CLDN1 - CLDN1

CLDN1
Identifikátory
Aliasy	CLDN1, CLD1, ILVASC, SEMP1, claudin 1
Externí ID	OMIM: 603718 MGI: 1276109 HomoloGene: 9620 Genové karty: CLDN1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	190,322,446 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	26,371,841 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita strukturních molekul; • identická vazba na protein; • aktivita virového receptoru;
Buněčná složka	• membrána; • integrální součást membrány; • buněčné spojení; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • apikální plazmatická membrána; • boční plazmatická membrána; • dvoubuněčný těsný spoj; • cytoplazma; • bazolaterální plazmatická membrána;
Biologický proces	• virový vstup; • organizace spojení buňka-buňka; • adheze buněk na buňkách nezávislá na vápníku prostřednictvím molekul buněčné adheze na plazmatické membráně; • GO: virový proces 0022415; • homooligomerizace bílkovin; • heterooligomerizace bílkovin; • vytvoření kožní bariéry; • sestava dvoubunkového těsného spojení; • stárnutí; • vytvoření hematoencefalické bariéry; • reakce na toxickou látku; • reakce na lipopolysacharid; • hyperosmotická slanost reakce; • reakce na ethanol; • transport léčiva přes hematoencefalickou bariéru; • reakce na interleukin-18; • buněčná odpověď na iont olova; • buněčná odpověď na interferon-gama; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • reakce na dexamethason; • buněčná odpověď na stimul transformujícího růstového faktoru beta; • vytvoření endoteliální intestinální bariéry; • regenerace jater; • pozitivní regulace sestavy těsného spojení dvoubuněčných buněk; • buněčná odpověď na butyrát;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9076
	12737
	ENSG00000163347
	ENSMUSG00000022512
	O95832
	O88551
	NM_021101
	NM_016674
	NP_066924
	NP_057883
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Claudin-1 je protein že u lidí je kódován CLDN1 gen.^[5]^[6] Patří do skupiny klaudiny.

Funkce

Těsná spojení představují jeden způsob adheze mezi buňkami v epiteliálních nebo endoteliálních buněčných vrstvách, tvořící souvislá těsnění kolem buněk a slouží jako fyzická bariéra, aby se zabránilo volným průchodům rozpuštěných látek a vody paracelulárním prostorem. Tato spojení se skládají ze sad spojitých síťových vláken v cytoplazmatickém letáku směřujícím ven, s komplementárními drážkami v extrcytoplasmatickém letáku směřujícím dovnitř. Protein kódovaný tímto genem, který je členem rodiny klaudinů, je integrální membránový protein a součást těsných spojovacích řetězců. Ztráta funkčních mutací vede k syndromu neonatální ichtyózy-sklerotizující cholangitidy.^[7]

Interakce

CLDN1 bylo prokázáno komunikovat s CLDN5^[8] a CLDN3.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163347 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022512 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Halford S, Spencer P, Greenwood J, Winton H, Hunt DM, Adamson P (červen 2000). "Přiřazení claudinu-1 (CLDN1) k lidskému chromozomu 3q28 -> q29 s hybridy somatických buněk". Cytogenet. Cell Genet. 88 (3–4): 217. doi:10.1159/000015553. PMID 10828592. S2CID 8896678.
^ Morita K, Furuse M, Fujimoto K, Tsukita S (březen 1999). „Rodina multigenů Claudin kódující proteinové složky čtyř transmembránových domén úzkých spojovacích řetězců“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (2): 511–6. Bibcode:1999PNAS ... 96..511M. doi:10.1073 / pnas.96.2.511. PMC 15167. PMID 9892664.
^ „Entrez Gene: CLDN1 claudin 1“.
^ ^A ^b Coyne CB, Gambling TM, Boucher RC, Carson JL, Johnson LG (listopad 2003). "Role interakcí claudinu v těsné spojovací propustnosti dýchacích cest". Dopoledne. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 285 (5): L1166-78. doi:10.1152 / ajplung.00182.2003. PMID 12909588.

externí odkazy

Člověk CLDN1 umístění genomu a CLDN1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Kniesel U, Wolburg H (2000). „Těsná spojení hematoencefalické bariéry“. Buňka. Mol. Neurobiol. 20 (1): 57–76. doi:10.1023 / A: 1006995910836. PMID 10690502. S2CID 26473781.
Heiskala M, Peterson PA, Yang Y (2001). "Role claudinových nadrodinových proteinů v paracelulárním transportu". Provoz. 2 (2): 93–8. doi:10.1034 / j.1600-0854.2001.020203.x. PMID 11247307. S2CID 12132159.
Tsukita S, Furuse M, Itoh M (2001). "Multifunkční prameny v těsných spojích". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2 (4): 285–93. doi:10.1038/35067088. PMID 11283726. S2CID 36524601.
Tsukita S, Furuse M (2002). "Bariéra na bázi klaudinu v jednoduchých a vrstevnatých celulárních vrstvách". Curr. Opin. Cell Biol. 14 (5): 531–6. doi:10.1016 / S0955-0674 (02) 00362-9. PMID 12231346.
González-Mariscal L, Betanzos A, Nava P, Jaramillo BE (2003). "Proteiny těsného spojení". Prog. Biophys. Mol. Biol. 81 (1): 1–44. doi:10.1016 / S0079-6107 (02) 00037-8. PMID 12475568.
Swisshelm K, Macek R, Kubbies M (2005). "Role klaudinů v tumorigenezi". Adv. Droga. Rev. 57 (6): 919–28. doi:10.1016 / j.addr.2005.01.006. PMID 15820559.
Král JE, Eugenin EA, Buckner CM, Berman JW (2006). "HIV tat a neurotoxicita". Mikroby jsou infikovány. 8 (5): 1347–57. doi:10.1016 / j.micinf.2005.11.014. PMID 16697675.
Ye J (2007). „Spoléhání se na metabolické cesty cholesterolu hostitele pro životní cyklus viru hepatitidy C“. PLOS Pathog. 3 (8): e108. doi:10.1371 / journal.ppat.0030108. PMC 1959368. PMID 17784784.
Furuse M, Fujita K, Hiiragi T, Fujimoto K, Tsukita S (1998). „Claudin-1 a -2: nové integrální membránové proteiny lokalizované v těsných spojích bez sekvenční podobnosti s oklucinem“. J. Cell Biol. 141 (7): 1539–50. doi:10.1083 / jcb.141.7.1539. PMC 2132999. PMID 9647647.
Swisshelm K, Machl A, Planitzer S, Robertson R, Kubbies M, Hosier S (1999). „SEMP1, cDNA spojená se stárnutím izolovaná z lidských epiteliálních buněk mléčné žlázy, je členem nadrodiny membránového proteinu epitelu“. Gen. 226 (2): 285–95. doi:10.1016 / S0378-1119 (98) 00553-8. PMID 9931503.
Furuse M, Sasaki H, Tsukita S (1999). „Způsob interakce heterogenních druhů klaudinů uvnitř a mezi vlákny těsného spojení“. J. Cell Biol. 147 (4): 891–903. doi:10.1083 / jcb.147.4.891. PMC 2156154. PMID 10562289.
Itoh M, Furuse M, Morita K, Kubota K, Saitou M, Tsukita S (1999). „Přímá vazba tří MAGUK spojovaných s těsným spojením, ZO-1, ZO-2 a ZO-3, s COOH konci klaudinů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1351–63. doi:10.1083 / jcb.147.6.1351. PMC 2168087. PMID 10601346.
Krämer F, White K, Kubbies M, Swisshelm K, Weber BH (2000). „Genomická organizace claudinu-1 a její hodnocení u dědičného a sporadického karcinomu prsu“. Hučení. Genet. 107 (3): 249–56. doi:10,1007 / s004390000375. PMID 11071387. S2CID 24898101.
Miyamori H, Takino T, Kobayashi Y, Tokai H, Itoh Y, Seiki M, Sato H (2001). „Claudin podporuje aktivaci pro-matricové metaloproteinázy-2 zprostředkovanou membránovou matricovou metaloproteinázou“. J. Biol. Chem. 276 (30): 28204–11. doi:10,1074 / jbc.M103083200. PMID 11382769.
Hamazaki Y, Itoh M, Sasaki H, Furuse M, Tsukita S (2002). „Multi-PDZ doménový protein 1 (MUPP1) je koncentrován v těsných spojích prostřednictvím své možné interakce s klaudinem-1 a spojovací molekulou adheze“. J. Biol. Chem. 277 (1): 455–61. doi:10,1074 / jbc.M109005200. PMID 11689568.
Liu F, Koval M, Ranganathan S, Fanayan S, Hancock WS, Lundberg EK, Beavis RC, Lane L, Duek P, McQuade L, Kelleher NL, Baker MS (2015). „Pohled na systémovou proteomiku z rodiny endogenních lidských klaudinových proteinů“. J Proteome Res. 15 (2): 339–359. doi:10.1021 / acs.jproteome.5b00769. PMC 4777318. PMID 26680015.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163347 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022512 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10828592-5] Halford S, Spencer P, Greenwood J, Winton H, Hunt DM, Adamson P (červen 2000). "Přiřazení claudinu-1 (CLDN1) k lidskému chromozomu 3q28 -> q29 s hybridy somatických buněk". Cytogenet. Cell Genet. 88 (3–4): 217. doi:10.1159/000015553. PMID 10828592. S2CID 8896678.

[pmid9892664-6] Morita K, Furuse M, Fujimoto K, Tsukita S (březen 1999). „Rodina multigenů Claudin kódující proteinové složky čtyř transmembránových domén úzkých spojovacích řetězců“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (2): 511–6. Bibcode:1999PNAS ... 96..511M. doi:10.1073 / pnas.96.2.511. PMC 15167. PMID 9892664.

[entrez-7] „Entrez Gene: CLDN1 claudin 1“.

[pmid12909588-8] A ^b Coyne CB, Gambling TM, Boucher RC, Carson JL, Johnson LG (listopad 2003). "Role interakcí claudinu v těsné spojovací propustnosti dýchacích cest". Dopoledne. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 285 (5): L1166-78. doi:10.1152 / ajplung.00182.2003. PMID 12909588.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]