CHAF1B - CHAF1B

CHAF1B
Identifikátory
Aliasy	CHAF1B, CAF-1, CAF-IP60, CAF1, CAF1A, CAF1P60, MPHOSPH7, MPP7, chromatinová sestava faktor 1 podjednotka B
Externí ID	OMIM: 601245 MGI: 1314881 HomoloGene: 48346 Genové karty: CHAF1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	36,419,015 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	93,906,115 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• rozložená vazba na protein; • histonová vazba; • vazba chromatinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Komplex CAF-1; • nukleoplazma; • nukleární chromatin; • buněčné jádro; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• sestava chromatinu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • Sestavení nukleosomů závislé na replikaci DNA; • replikace DNA; • buněčný cyklus; • Oprava DNA; • shromáždění nukleosomů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8208
	110749
	ENSG00000159259
	ENSMUSG00000022945
	Q13112
	Q9D0N7
	NM_005441
	NM_028083
	NP_005432
	NP_082359
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Sestava faktoru chromatinu 1 podjednotka B je protein že u lidí je kódován CHAF1B gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Chromatinový montážní faktor I (CAF-1 ) je vyžadován pro sestavení histonových oktamerů na nově replikovanou DNA. CAF-I se skládá ze tří proteinových podjednotek, p50, p60 a p150. Protein kódovaný tímto genem odpovídá podjednotce p60 a je po replikaci vyžadován pro sestavení chromatinu. Kódovaný protein je diferenciálně fosforylován způsobem závislým na buněčném cyklu. Kromě toho se normálně nachází v jádře, s výjimkou mitózy, kdy se uvolňuje do cytoplazmy. Tento protein je členem rodiny WD-repeat HIR1 a může se také podílet na opravě DNA.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že CHAF1B komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159259 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022945 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kaufman PD, Kobayashi R, Kessler N, Stillman B (červen 1995). „Podjednotky p150 a p60 faktoru I sestavení chromatinu: molekulární vazba mezi nově syntetizovanými histony a replikací DNA“. Buňka. 81 (7): 1105–14. doi:10.1016 / S0092-8674 (05) 80015-7. PMID 7600578. S2CID 13502921.
^ Katsanis N, Fisher EM (říjen 1996). „Gen kódující podjednotku p60 faktoru I sestavení chromatinu (CAF1P60) se mapuje na lidský chromozom 21q22.2, oblast spojenou s některými hlavními rysy Downova syndromu.“ Genetika člověka. 98 (4): 497–9. doi:10,1007 / s004390050246. PMID 8792829. S2CID 1206979.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CHAF1B chromatinový montážní faktor 1, podjednotka B (p60)".
^ ^A ^b Mello JA, Silljé HH, Roche DM, Kirschner DB, Nigg EA, Almouzni G (duben 2002). „Human Asf1 a CAF-1 interagují a synergizují v opravné vazbě nukleosomové sestavy“. Zprávy EMBO. 3 (4): 329–34. doi:10.1093 / embo-reports / kvf068. PMC 1084056. PMID 11897662.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (Červen 2003). „Komplex WINAC remodelační komplex WINAC se zaměřuje na jaderný receptor na promotory a je narušen Williamsovým syndromem“. Buňka. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.

Další čtení

Ridgway P, Almouzni G (srpen 2000). „CAF-1 a dědičnost stavů chromatinu: na křižovatce replikace a opravy DNA“. Journal of Cell Science. 113 (15): 2647–58. PMID 10893180.
Blouin JL, Duriaux-Sail G, Chen H, Gos A, Morris MA, Rossier C, Antonarakis SE (duben 1996). "Mapování genu pro p60 podjednotku lidského chromatinového montážního faktoru (CAF1A) do oblasti Downova syndromu chromozomu 21". Genomika. 33 (2): 309–12. doi:10.1006 / geno.1996.0199. PMID 8660983.
Verreault A, Kaufman PD, Kobayashi R, Stillman B (říjen 1996). „Sestavení nukleosomu komplexem CAF-1 a acetylovaných histonů H3 / H4“. Buňka. 87 (1): 95–104. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81326-4. PMID 8858152. S2CID 1416453.
Matsumoto-Taniura N, Pirollet F, Monroe R, Gerace L, Westendorf JM (září 1996). "Identifikace nových fosfoproteinů fáze M expresním klonováním". Molekulární biologie buňky. 7 (9): 1455–69. doi:10,1091 / mbc.7.9.1455. PMC 275994. PMID 8885239.
Marheineke K, Krude T (červen 1998). „Aktivita sestavení nukleosomů a intracelulární lokalizace změn lidského CAF-1 během cyklu dělení buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (24): 15279–86. doi:10.1074 / jbc.273.24.15279. PMID 9614144.
Martini E, Roche DM, Marheineke K, Verreault A, Almouzni G (listopad 1998). „Nábor fosforylovaného montážního faktoru chromatinu 1 na chromatin po UV záření lidských buněk“. The Journal of Cell Biology. 143 (3): 563–75. doi:10.1083 / jcb.143.3.563. PMC 2148138. PMID 9813080.
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe H, Yada T, Park HS, Toyoda A, Ishii K, Totoki Y, Choi DK, Groner Y, Soeda E, Ohki M, Takagi T, Sakaki Y, Taudien S, Blechschmidt K , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Beck A, Klages S, Hennig S, Riesselmann L, Dagand E, Haaf T, Wehrmeyer S, Borzym K, Gardiner K, Nizetic D, Francis F, Lehrach H, Reinhardt R, Yaspo ML (květen 2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
Keller C, Krude T (listopad 2000). „Požadavek aktivity Cyclin / Cdk2 a proteinové fosfatázy 1 pro sestavení chromatinu závislé na sestavě chromatinu během syntézy DNA. The Journal of Biological Chemistry. 275 (45): 35512–21. doi:10,1074 / jbc.M003073200. PMID 10938080.
Mello JA, Silljé HH, Roche DM, Kirschner DB, Nigg EA, Almouzni G (duben 2002). „Human Asf1 a CAF-1 interagují a synergizují v opravné vazbě nukleosomové sestavy“. Zprávy EMBO. 3 (4): 329–34. doi:10.1093 / embo-reports / kvf068. PMC 1084056. PMID 11897662.
Morel AP, Sentis S, Bianchin C, Le Romancer M, Jonard L, Rostan MC, Rimokh R, Corbo L (červenec 2003). „Antiproliferativní protein BTG2 interaguje s lidským komplexem CCR4 existujícím in vivo ve třech formách regulovaných buněčným cyklem“. Journal of Cell Science. 116 (Pt 14): 2929–36. doi:10,1242 / jcs.00480. PMID 12771185.
Nabatiyan A, Krude T (duben 2004). „Ztlumení faktoru 1 sestavy chromatinu v lidských buňkách vede k buněčné smrti a ztrátě sestavy chromatinu během syntézy DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (7): 2853–62. doi:10.1128 / MCB.24.7.2853-2862.2004. PMC 371118. PMID 15024074.
Shim KS, Bergelson JM, Furuse M, Ovod V, Krude T, Lubec G (2004). "Redukce chromatinového montážního faktoru 1 p60 a proteinu C21orf2, kódovaného na chromozomu 21, v mozku Downova syndromu". Pokroky ve výzkumu Downova syndromu. Journal of Neural Transmission. Supplementum. Dodatek Journal of Neural Transmission 67. 67. 117–28. doi:10.1007/978-3-7091-6721-2_10. ISBN 978-3-211-40776-9. PMID 15068244.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Lin KT, Lu RM, Tarn WY (říjen 2004). „Proteiny obsahující WW doménu interagují s časným spliceosomem a účastní se sestřihu pre-mRNA in vivo“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (20): 9176–85. doi:10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888.
Groth A, Ray-Gallet D, Quivy JP, Lukas J, Bartek J, Almouzni G (leden 2005). "Human Asf1 reguluje tok histonů fáze S během replikačního stresu". Molekulární buňka. 17 (2): 301–11. doi:10.1016 / j.molcel.2004.12.018. PMID 15664198.

externí odkazy

Člověk CHAF1B umístění genomu a CHAF1B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk MPP7 umístění genomu a MPP7 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 21 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159259 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022945 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7600578-5] Kaufman PD, Kobayashi R, Kessler N, Stillman B (červen 1995). „Podjednotky p150 a p60 faktoru I sestavení chromatinu: molekulární vazba mezi nově syntetizovanými histony a replikací DNA“. Buňka. 81 (7): 1105–14. doi:10.1016 / S0092-8674 (05) 80015-7. PMID 7600578. S2CID 13502921.

[pmid8792829-6] Katsanis N, Fisher EM (říjen 1996). „Gen kódující podjednotku p60 faktoru I sestavení chromatinu (CAF1P60) se mapuje na lidský chromozom 21q22.2, oblast spojenou s některými hlavními rysy Downova syndromu.“ Genetika člověka. 98 (4): 497–9. doi:10,1007 / s004390050246. PMID 8792829. S2CID 1206979.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: CHAF1B chromatinový montážní faktor 1, podjednotka B (p60)".

[pmid11897662-8] A ^b Mello JA, Silljé HH, Roche DM, Kirschner DB, Nigg EA, Almouzni G (duben 2002). „Human Asf1 a CAF-1 interagují a synergizují v opravné vazbě nukleosomové sestavy“. Zprávy EMBO. 3 (4): 329–34. doi:10.1093 / embo-reports / kvf068. PMC 1084056. PMID 11897662.

[pmid17353931-9] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid12837248-10] Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (Červen 2003). „Komplex WINAC remodelační komplex WINAC se zaměřuje na jaderný receptor na promotory a je narušen Williamsovým syndromem“. Buňka. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]