CCDC90B - CCDC90B

CCDC90B
Identifikátory
Aliasy	CCDC90B, MDS011, MDS025, doména coiled-coil obsahující 90B
Externí ID	MGI: 1913615 HomoloGene: 23328 Genové karty: CCDC90B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	83,286,407 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	92,582,294 bp
Ortology
	60492
	66365
	ENSG00000137500
	ENSMUSG00000030613
	Q9GZT6
	Q8C3X2
NM_001286116; NM_001286117; NM_001286118; NM_001286119; NM_001286120;
	NM_021825
	NM_001162918; NM_025515
NP_001273045; NP_001273046; NP_001273047; NP_001273048; NP_001273049;
	NP_068597
	NP_001156390; NP_079791
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Navinutá cívková doména obsahující 90B, také známý jako CCDC90B, je protein kódovaný CCDC90B gen.

Gen

CCDC90B se nachází na chromozom 11 u lidí. Sousedí s:^[5]

PCF11, protein savčího pre-mRNA štěpícího komplexu 2
ANKRD42, ankyrinový opakující se protein zapojený do vazby iontů vápníku
BC070093
DLG2, člen rodiny membránově spojené guanylátkinázy (MAGUK)

Protein

Struktura

Tento protein je charakterizován přítomností a doména neznámé funkce, DUF1640. Tato doména je charakteristická pro celý protein, s výjimkou prvních dvaceti tří aminokyselinových zbytků - MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP - které jsou mitochondriálním cílovým místem a jsou štěpeny.

Protein má sedm předpovídaných alfa helixy, charakteristika proteinů ve svitcích.

Předpokládané vlastnosti

Molekulární váha: 26,72 kDa

Isoelektrický bod: 7.5

Transmembránové šroubovice: Žádné

Post-překladové úpravy:^[6]

Chloroplastové tranzitní peptidy: Žádné

Signální peptidy: Žádné

C-mannosylační stránky: Žádné

N-glykosylační místa: Žádné

Mitochondriální cílení: Ano

Štěpená stránka: MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP

Mobilní umístění

CCDC90B je pravděpodobně a mitochondriální protein. Předpokládá se, že bude obsahovat alespoň tři specifická fosforylační místa: fosforylační místa proteinkinázy C, fosforylační místa kasein kinázy II a fosforylační místa závislá na cAMP / cGMP.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137500 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030613 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „UCSC Genome Bioinformatics BLAT“. Kalifornská univerzita - Santa Cruz. Březen 2006. Citováno 2009-05-14.
^ „EXPASy“. SIB Švýcarsko. 2009-01-05. Citováno 2009-05-14.

externí odkazy

Člověk CCDC90B umístění genomu a CCDC90B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137500 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030613 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[UCSC_Genome_Bioinformatics-5] „UCSC Genome Bioinformatics BLAT“. Kalifornská univerzita - Santa Cruz. Březen 2006. Citováno 2009-05-14.

[SIB_Switzerland_2009-01-05-6] „EXPASy“. SIB Švýcarsko. 2009-01-05. Citováno 2009-05-14.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]