CCDC90B - CCDC90B
CCDC90B | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
Aliasy | CCDC90B, MDS011, MDS025, doména coiled-coil obsahující 90B | ||||||||||||||||||||||||
Externí ID | MGI: 1913615 HomoloGene: 23328 Genové karty: CCDC90B | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (protein) |
| ||||||||||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr 11: 83,26 - 83,29 Mb | Chr 7: 92,56 - 92,58 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Navinutá cívková doména obsahující 90B, také známý jako CCDC90B, je protein kódovaný CCDC90B gen.
Gen
CCDC90B se nachází na chromozom 11 u lidí. Sousedí s:[5]
- PCF11, protein savčího pre-mRNA štěpícího komplexu 2
- ANKRD42, ankyrinový opakující se protein zapojený do vazby iontů vápníku
- BC070093
- DLG2, člen rodiny membránově spojené guanylátkinázy (MAGUK)
Protein
Struktura
Tento protein je charakterizován přítomností a doména neznámé funkce, DUF1640. Tato doména je charakteristická pro celý protein, s výjimkou prvních dvaceti tří aminokyselinových zbytků - MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP - které jsou mitochondriálním cílovým místem a jsou štěpeny.
Protein má sedm předpovídaných alfa helixy, charakteristika proteinů ve svitcích.
Předpokládané vlastnosti
Molekulární váha: 26,72 kDa
Isoelektrický bod: 7.5
Transmembránové šroubovice: Žádné
- Chloroplastové tranzitní peptidy: Žádné
- Signální peptidy: Žádné
- C-mannosylační stránky: Žádné
- N-glykosylační místa: Žádné
- Mitochondriální cílení: Ano
- Štěpená stránka: MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP
Mobilní umístění
CCDC90B je pravděpodobně a mitochondriální protein. Předpokládá se, že bude obsahovat alespoň tři specifická fosforylační místa: fosforylační místa proteinkinázy C, fosforylační místa kasein kinázy II a fosforylační místa závislá na cAMP / cGMP.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137500 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030613 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „UCSC Genome Bioinformatics BLAT“. Kalifornská univerzita - Santa Cruz. Březen 2006. Citováno 2009-05-14.
- ^ „EXPASy“. SIB Švýcarsko. 2009-01-05. Citováno 2009-05-14.
externí odkazy
- Člověk CCDC90B umístění genomu a CCDC90B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.