CBY1 - CBY1

CBY1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4WRQ
Identifikátory
Aliasy	CBY1, C22orf2, CBY, HS508I15A, PGEA1, PIGEA-14, PIGEA14, arb1, chibby homolog 1 (Drosophila), člen rodiny chibby 1, antagonista beta kateninu, Chibby1
Externí ID	OMIM: 607757 MGI: 1920989 HomoloGene: 12514 Genové karty: CBY1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	38,673,854 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	79,667,660 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba beta-katenin; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • aktivita homodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• cytosol; • trans-Golgiho síť; • Golgiho aparát; • jaderná skvrna; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytoplazma; • centriole; • cytoskelet; • buněčná projekce; • ciliární bazální tělo;
Biologický proces	• lokalizace bílkovin; • diferenciace buněk srdečního svalu; • negativní regulace signální dráhy Wnt; • diferenciace buněk; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • diferenciace tukových buněk; • organizace projekce buněk; • homotetramerizace bílkovin; • cilium morfogeneze; • sestava ciliární přechodové zóny;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	25776
	73739
	ENSG00000100211
	ENSMUSG00000022428
	Q9Y3M2
	Q9D1C2
	NM_015373; NM_001002880
	NM_028634
	NP_001002880; NP_056188
	NP_082910
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein chibby homolog 1 je protein že u lidí je kódován CBY1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Beta-katenin je transkripční aktivátor a onkoprotein podílí se na vývoji několika druhů rakoviny. Protein kódovaný tímto genem interaguje přímo s C-terminál oblast beta-kateninu, inhibující onkogenní aktivaci transkripce zprostředkovanou beta-kateninem kompeticí s transkripční faktory pro vazbu na beta-katenin. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

CBY1 bylo prokázáno komunikovat s Beta-katenin.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100211 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022428 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
^ Hidaka S, Könecke V, Osten L, Witzgall R (srpen 2004). „PIGEA-14, nový stočený cívkový protein ovlivňující intracelulární distribuci polycystinu-2“. J Biol Chem. 279 (33): 35009–16. doi:10,1074 / jbc.M314206200. PMID 15194699.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CBY1 chibby homolog 1 (Drosophila)“.
^ Takemaru K, Yamaguchi S, Lee YS, Zhang Y, Carthew RW, Moon RT (duben 2003). „Chibby, protivník dráhy Wnt / Wingless spojený s jaderným beta-kateninem“. Příroda. 422 (6934): 905–9. doi:10.1038 / nature01570. PMID 12712206.

externí odkazy

Člověk CBY1 umístění genomu a CBY1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugano J, Hata H, Ota T, Isogai T, Tanaka T, Nakamura Y, Suyama A, Sakaki Y, Morishita S, Okubo K, Sugano S (2001). „Identifikace a charakterizace regionů potenciálních promotorů 1031 druhů lidských genů“. Genome Res. 11 (5): 677–84. doi:10,1101 / gr. Gr-1640r. PMC 311086. PMID 11337467.
Collins JE, Goward ME, Cole CG, Smink LJ, Huckle EJ, Knowles S, Bye JM, Beare DM, Dunham I (2003). „Přehodnocení anotace lidského genu: Analýza druhé generace chromozomu 22“. Genome Res. 13 (1): 27–36. doi:10,1101 / gr. 695703. PMC 430954. PMID 12529303.
Takemaru K, Yamaguchi S, Lee YS, Zhang Y, Carthew RW, Moon RT (2003). „Chibby, protivník dráhy Wnt / Wingless spojený s jaderným beta-kateninem“. Příroda. 422 (6934): 905–9. doi:10.1038 / nature01570. PMID 12712206.
Gad S, Teboul D, Lièvre A, Goasguen N, Berger A, Beaune P, Laurent-Puig P (2004). „Je gen kódující Chibbyho implikován jako tumor supresor u kolorektálního karcinomu?“. Rakovina BMC. 4: 31. doi:10.1186/1471-2407-4-31. PMC 471554. PMID 15245581.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Schuierer MM, Graf E, Takemaru K, Dietmaier W, Bosserhoff AK (2006). "Snížená exprese inhibitoru beta-kateninu Chibby v buněčných liniích karcinomu tlustého střeva". Svět J. Gastroenterol. 12 (10): 1529–35. PMID 16570344.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Li FQ, Singh AM, Mofunanya A, Love D, Terada N, Moon RT, Takemaru K (2007). „Chibby podporuje diferenciaci adipocytů inhibicí signalizace β-kateninem“. Mol. Buňka. Biol. 27 (12): 4347–54. doi:10.1128 / MCB.01640-06. PMC 1900052. PMID 17403895.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100211 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022428 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10591208-5] Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.

[pmid15194699-6] Hidaka S, Könecke V, Osten L, Witzgall R (srpen 2004). „PIGEA-14, nový stočený cívkový protein ovlivňující intracelulární distribuci polycystinu-2“. J Biol Chem. 279 (33): 35009–16. doi:10,1074 / jbc.M314206200. PMID 15194699.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CBY1 chibby homolog 1 (Drosophila)“.

[pmid12712206-8] Takemaru K, Yamaguchi S, Lee YS, Zhang Y, Carthew RW, Moon RT (duben 2003). „Chibby, protivník dráhy Wnt / Wingless spojený s jaderným beta-kateninem“. Příroda. 422 (6934): 905–9. doi:10.1038 / nature01570. PMID 12712206.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]