C1D - C1D

C1D
Identifikátory
Aliasy	C1D, LRP1, SUN-CoR, SUNCOR, hRrp47, C1D jaderný receptor corepressor
Externí ID	OMIM: 606997 MGI: 1927354 HomoloGene: 4619 Genové karty: C1D
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	68,110,948 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	17,269,176 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba jaderného receptoru závislá na ligandu; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderný exosom (komplex RNázy); • transkripční represorový komplex; • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • zrání 5,8S rRNA; • transkripce, chráněná DNA; • apoptotický proces; • zpracování rRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10438
	57316
	ENSG00000197223
	ENSMUSG00000000581
	Q13901
	O35473
	NM_173177; NM_001190263; NM_001190265; NM_006333
	NM_020558; NM_001330649
	NP_001177192; NP_001177194; NP_006324; NP_775269
	NP_001317578; NP_065583
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein C1D vázající nukleovou kyselinu je protein že u lidí je kódován C1D gen.^[5]^[6]^[7]^[8]^[9]^[10]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je protein vázající DNA a indukující apoptózu a je lokalizován v jádře. Je to také protein interagující s Rac3, který působí jako korpresor pro receptor hormonu štítné žlázy. Předpokládá se, že tento protein reguluje tvorbu komplexu TRAX / Translin. Bylo popsáno několik alternativně sestřižených variant transkriptu tohoto genu, ale povaha celé délky některých z těchto variant nebyla stanovena.^[10]

Interakce

C1D bylo prokázáno komunikovat s TSNAX^[8] a DNA-PKcs.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197223 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000581 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nehls P, Keck T, Greferath R, Spiess E, Glaser T, Rothbarth K, Stammer H, Werner D (duben 1998). "klonování cDNA, rekombinantní exprese a charakterizace polypetidů s výjimečnou afinitou k DNA". Nucleic Acids Res. 26 (5): 1160–6. doi:10.1093 / nar / 26.5.1160. PMC 147382. PMID 9469821.
^ Schilders G, Egberts WV, Raijmakers R, Pruijn GJ (červenec 2007). „C1D je hlavním cílem autoprotilátek u pacientů se syndromem překrytí polymyositis-sklerodermie“. Artritida Rheum. 56 (7): 2449–54. doi:10,1002 / článek 22710. PMID 17599775.
^ Schilders G, van Dijk E, Pruijn GJ (květen 2007). „C1D a hMtr4p se asociují s lidskou exozomovou podjednotkou PM / Scl-100 a podílejí se na zpracování před rRNA“. Nucleic Acids Res. 35 (8): 2564–72. doi:10.1093 / nar / gkm082. PMC 1885644. PMID 17412707.
^ ^A ^b Erdemir T, Bilican B, Oncel D, Goding CR, Yavuzer U (leden 2002). „Interakce jaderného proteinu C1D závislá na poškození DNA s faktorem X (TRAX) spojeným s translinem“. J. Cell Sci. 115 (Pt 1): 207–16. PMID 11801738.
^ Zamir I, Dawson J, Lavinsky RM, Glass CK, Rosenfeld MG, Lazar MA (prosinec 1997). „Klonování a charakterizace korepresoru a potenciální složky komplexu pro potlačení nukleárního hormonu. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (26): 14400–5. doi:10.1073 / pnas.94.26.14400. PMC 24996. PMID 9405624.
^ ^A ^b "Entrez Gene: C1D nukleární DNA vázající protein".
^ Yavuzer U, Smith GC, Bliss T, Werner D, Jackson SP (červenec 1998). „Aktivace DNA nezávislá na konci DNA-PK zprostředkovaná spojením s proteinem C1D vázajícím DNA“. Genes Dev. 12 (14): 2188–99. doi:10.1101 / gad.12.14.2188. PMC 317006. PMID 9679063.

externí odkazy

Člověk C1D umístění genomu a C1D stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk LRP1 umístění genomu a LRP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Rothbarth K, Stammer H, Werner D (2002). „Degradace zprostředkovaná proteazomy antagonizuje kritické hladiny proteinu C1D indukujícího apoptózu“. Cancer Cell Int. 2 (1): 12. doi:10.1186/1475-2867-2-12. PMC 140130. PMID 12379155.
Rothbarth K, Hunziker A, Stammer H, Werner D (2001). "Promotér genu kódujícího 16 kDa DNA vázající a apoptózu indukující C1D protein". Biochim. Biophys. Acta. 1518 (3): 271–5. doi:10.1016 / S0167-4781 (01) 00198-1. PMID 11311939.
Rothbarth K, Spiess E, Juodka B, Yavuzer U, Nehls P, Stammer H, Werner D (1999). „Indukce apoptózy nadměrnou expresí proteinu C1D vázajícího se na DNA a aktivujícího DNA-PK“. J. Cell Sci. 112 (13): 2223–32. PMID 10362552.
Haataja L, Groffen J, Heisterkamp N (1998). "Identifikace nového proteinu C1D interagujícího s Rac3". Int. J. Mol. Med. 1 (4): 665–70. doi:10,3892 / ijmm. 1.4.665. PMID 9852280.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197223 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000581 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9469821-5] Nehls P, Keck T, Greferath R, Spiess E, Glaser T, Rothbarth K, Stammer H, Werner D (duben 1998). "klonování cDNA, rekombinantní exprese a charakterizace polypetidů s výjimečnou afinitou k DNA". Nucleic Acids Res. 26 (5): 1160–6. doi:10.1093 / nar / 26.5.1160. PMC 147382. PMID 9469821.

[pmid17599775-6] Schilders G, Egberts WV, Raijmakers R, Pruijn GJ (červenec 2007). „C1D je hlavním cílem autoprotilátek u pacientů se syndromem překrytí polymyositis-sklerodermie“. Artritida Rheum. 56 (7): 2449–54. doi:10,1002 / článek 22710. PMID 17599775.

[pmid17412707-7] Schilders G, van Dijk E, Pruijn GJ (květen 2007). „C1D a hMtr4p se asociují s lidskou exozomovou podjednotkou PM / Scl-100 a podílejí se na zpracování před rRNA“. Nucleic Acids Res. 35 (8): 2564–72. doi:10.1093 / nar / gkm082. PMC 1885644. PMID 17412707.

[pmid11801738-8] A ^b Erdemir T, Bilican B, Oncel D, Goding CR, Yavuzer U (leden 2002). „Interakce jaderného proteinu C1D závislá na poškození DNA s faktorem X (TRAX) spojeným s translinem“. J. Cell Sci. 115 (Pt 1): 207–16. PMID 11801738.

[pmid9405624-9] Zamir I, Dawson J, Lavinsky RM, Glass CK, Rosenfeld MG, Lazar MA (prosinec 1997). „Klonování a charakterizace korepresoru a potenciální složky komplexu pro potlačení nukleárního hormonu. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (26): 14400–5. doi:10.1073 / pnas.94.26.14400. PMC 24996. PMID 9405624.

[entrez-10] A ^b "Entrez Gene: C1D nukleární DNA vázající protein".

[pmid9679063-11] Yavuzer U, Smith GC, Bliss T, Werner D, Jackson SP (červenec 1998). „Aktivace DNA nezávislá na konci DNA-PK zprostředkovaná spojením s proteinem C1D vázajícím DNA“. Genes Dev. 12 (14): 2188–99. doi:10.1101 / gad.12.14.2188. PMC 317006. PMID 9679063.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]