Beebase - Beebase
![]() | tento článek potřebuje další citace pro ověření.Červen 2018) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) ( |
BeeBase je online databáze bioinformatiky, která zobrazuje související údaje Apis mellifera, Evropská včela spolu s některými patogeny a jinými druhy. Byl vyvinut ve spolupráci s Konsorcium pro sekvenování genomu včel.[1]
Data
Tato stránka hostí sekvenci genomu pro apis mellifera spolu s patogeny následujících patogenů:
Analyzují se dva další druhy:
V únoru 2007 BeeBase sestával z a GB prohlížeč - prohlížeč genomu založený na a CMap -na základě] srovnávací prohlížeč map, oba moduly Databáze obecných modelových organizmů (GMOD) projekt. Prohlížeč genomu zahrnoval stopy známých genů včel, predikované sady genů (Ensembl, NCBI, EMBL-Heidelberg), markery STS (mapy vazeb Solignac a Hunt), tagy sekvence exprimující včely (EST), homology ovocný let, komár a jiný hmyz a transponovatelné prvky. Prohlížeč srovnávacích map včel včel zobrazil vazebné mapy a fyzickou mapu (sestava genomu), přičemž zvýraznil značky, které jsou mezi mapami běžné.
Budoucí vylepšení plánována na rok 2006 BeeBase plocha Prohlížeč QTL a a genová exprese databáze. The sekvence genomu bude sloužit jako reference k propojení těchto různých datových typů.
Biologické údaje a služby dostupné na BeeBase zahrnout:
- DNA a proteinová sekvence data
- oficiální včela gen set (vyvinutý a hostovaný v Beebase)
- genom prohlížeč
- vazební mapy
- server pro hledání genomu včel pomocí VÝBUCH
Beebase uspořádal komunitní anotaci genomu včel ve spolupráci s Baylor College medicíny Lidský genom Sekvenční centrum.[2]
Reference
- ^ A b C Web aplikace BeeBase - http://hymenopteragenome.org/beebase/
- ^ Elsik, C. G .; Worley, K. C .; Zhang, L .; Milshina, N. V .; Jiang, H .; Reese, J. T .; Childs, K. L .; Venkatraman, A .; Dickens, C. M .; Weinstock, G. M .; Gibbs, R. A. (25. října 2006). „Komunitní anotace: Postupy, protokoly a podpůrné nástroje“. Výzkum genomu. 16 (11): 1329–1333. doi:10,1101 / gr. 5580606.
externí odkazy
Viz také
![]() | Tento včela související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |