Bakteriofágová pRNA - Bacteriophage pRNA

Bakteriofágová pRNA
RF00044.jpg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence Phage_pRNA
Identifikátory
SymbolPhage_pRNA
RfamRF00044
Další údaje
RNA typGen
DoményViry
TAKSO: 0000655
PDB strukturPDBe

Bakteriofágová pRNA je ncRNA živel. Během replikace lineárních dsDNA virů je virový genom zabalen do předem vytvořeného viru prokapsid. Balení DNA do procapsidu vyžaduje a molekulární motor, který používá ATP jako energie k dosažení energeticky nepříznivého pohybu. V některých bakteriofágech je molekula RNA (pRNA) důležitou součástí tohoto motoru.[1] Strukturální analýzy balicího motoru prokázaly, že: pRNA když je molekula připojena k hlavici, má pětinásobnou symetrii.[2][3][4] Předpokládá se, že pRNA je vázána kapsid konektorový protein.[4] Pouze prvních 120 základny pRNA jsou nezbytné pro zabalení virové DNA.[5][6] Předpokládá se, že pRNA se skládá ze dvou domén, jedné odpovídajících prvním 120 bázím a druhé zbývajícím 50 bázím.[6] Nukleární štěpení nastává v oblasti jednoho vlákna spojující tyto dvě domény.[6]

Reference

  1. ^ Guo P (2002). Struktura a funkce hexamerické RNA phi29, která řídí motor balení virové DNA: přehled. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Pokrok ve výzkumu nukleových kyselin a molekulární biologie. 72. 415–472. doi:10.1016 / S0079-6603 (02) 72076-X. ISBN  978-0-12-540072-5. PMID  12206459.
  2. ^ Morais MC, Tao Y, Olson NH a kol. (2001). "Rekonstrukce obrazu kryoelektronové mikroskopie nesouladů symetrie v bakteriofágu phi29". J. Struct. Biol. 135 (1): 38–46. doi:10.1006 / jsbi.2001.4379. PMC  5595366. PMID  11562164.
  3. ^ Simpson AA, Tao Y, Leiman PG a kol. (2000). "Struktura bakteriofágového phi29 DNA balení motoru". Příroda. 408 (6813): 745–750. Bibcode:2000Natur.408..745S. doi:10.1038/35047129. PMC  4151180. PMID  11130079.
  4. ^ A b Badasso MO, Leiman PG, Tao Y a kol. (2000). "Čištění, krystalizace a počáteční rentgenová analýza konektoru hlava-ocas bakteriofága phi29". Acta Crystallogr. D. 56 (Pt 9): 1187–1190. doi:10.1107 / S0907444900009239. PMID  10957642.
  5. ^ Guo PX, Erickson S, Anderson D (1987). „Malá virová RNA je nutná pro in vitro zabalení DNA bakteriofága phi 29“. Věda. 236 (4802): 690–694. Bibcode:1987Sci ... 236..690G. doi:10.1126 / science.3107124. PMID  3107124.
  6. ^ A b C Bailey S, Wichitwechkarn J, Johnson D, Reilly BE, Anderson DL, Bodley JW (1990). "Fylogenetická analýza a sekundární struktura bakteriofága RNA Bacillus subtilis potřebná pro balení DNA". J. Biol. Chem. 265 (36): 22365–22370. PMID  2125049.

externí odkazy