BIRC7 - BIRC7

BIRC7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1OXN, 1OXQ, 1OY7, 1TW6, 2I3H, 2I3I, 3F7G, 3F7H, 3F7I, 3GT9, 3GTA, 3UW5, 4AUQ
Identifikátory
Aliasy	BIRC7, KIAP, LIVIN, ML-IAP, MLIAP, RNF50, bakulovirová IAP repetice obsahující 7
Externí ID	OMIM: 605737 MGI: 2676458 HomoloGene: 51405 Genové karty: BIRC7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	63,240,495 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	180,934,010 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru peptidázy; • aktivita inhibitoru endopeptidázy cysteinového typu; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba enzymu; • aktivita transferázy; • aktivita inhibitoru endopeptidázy cysteinového typu zapojená do apoptotického procesu; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Golgiho aparát; • buněčné jádro; • organizační centrum mikrotubulů; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace aktivity peptidázy; • aktivace aktivity JUN kinázy; • inhibice aktivity endopeptidázy cysteinového typu zapojené do apoptotického procesu; • negativní regulace apoptotického procesu; • regulace apoptotického procesu přirozených zabíječských buněk; • sestava mitotického vřetena; • regulace buněčné proliferace; • regulace přenosu signálu; • ubikvitinace bílkovin; • apoptotický proces; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79444
	329581
	ENSG00000101197
	ENSMUSG00000038840
	Q96CA5
	A2AWP0
	NM_139317; NM_022161
	NM_001163247
	NP_071444; NP_647478
	NP_001156719
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Baculovirový protein obsahující IAP repetice 7 je protein že u lidí je kódován BIRC7 gen.^[5]^[6]^[7]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny inhibitorů apoptózových proteinů (IAP) a obsahuje jednu kopii bakulovirové IAP repetice (BIR) a také doménu zinkového prstu typu RING. Doména BIR je nezbytná pro inhibiční aktivitu a interaguje s kaspázami, zatímco doména prstu RING někdy zvyšuje antiapoptotickou aktivitu, ale neinhibuje samotnou apoptózu. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy. Tyto dvě izoformy mají odlišné antiapoptotické vlastnosti, přičemž isoforma alfa chrání buňky před apoptózou indukovanou staurosporinem a izoforma b chránící buňky před apoptózou indukovanou etoposidem.^[7]v melanom Exprese genu BIRC7 je regulována pomocí Transkripční faktor spojený s mikroftalmií.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101197 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038840 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kasof GM, Gomes BC (květen 2001). „Livin, nový inhibitor člena rodiny proteinů apoptózy“. J Biol Chem. 276 (5): 3238–46. doi:10,1074 / jbc.M003670200. PMID 11024045.
^ Lin JH, Deng G, Huang Q, Morser J (únor 2001). „KIAP, nový člen rodiny proteinových inhibitorů apoptózy“. Biochem Biophys Res Commun. 279 (3): 820–31. doi:10,1006 / bbrc.2000.4027. PMID 11162435.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BIRC7 bakulovirový IAP repetice obsahující 7 (livin)“.
^ Dynek JN, Chan SM, Liu J a kol. (2008). „Transkripční faktor spojený s mikroftalmií je kritickým regulátorem transkripce inhibitoru melanomu u apoptózy u melanomů“. Cancer Res. 68 (9): 3124–32. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6622. PMID 18451137.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM a kol. (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

externí odkazy

Člověk BIRC7 umístění genomu a BIRC7 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Bavykin AS, Korotaeva AA, Poyarkov SV, et al. (2013). „Dvojité cílení siRNA na cIAP2 a LIVIN vede k synergické senzibilizaci buněk HCT-116 na léčbu oxaliplatinou“. OncoTargets Ther. 6 (6): 1333–40. doi:10.2147 / OTT.S44893. PMC 3789649. PMID 24098083.
Vucic D, Stennicke HR, Pisabarro MT a kol. (2001). „ML-IAP, nový inhibitor apoptózy, který je přednostně exprimován v lidských melanomech“. Curr. Biol. 10 (21): 1359–66. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00781-8. PMID 11084335. S2CID 10381671.
Ashhab Y, Alian A, Polliack A a kol. (2001). "Dvě sestřihové varianty nového inhibitoru genu pro apoptózu s různými biologickými vlastnostmi a vzorem distribuce v tkáních". FEBS Lett. 495 (1–2): 56–60. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02366-3. PMID 11322947. S2CID 46380628.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Vucic D, Deshayes K, Ackerly H a kol. (2002). „SMAC negativně reguluje antiapoptotickou aktivitu inhibitoru melanomu apoptózy (ML-IAP)“. J. Biol. Chem. 277 (14): 12275–9. doi:10,1074 / jbc.M112045200. PMID 11801603.
Sanna MG, da Silva Correia J, Ducrey O a kol. (2002). „Potlačení apoptózy IAP zahrnuje odlišné mechanismy: signální kaskádu TAK1 / JNK1 a inhibici kaspázy“. Mol. Buňka. Biol. 22 (6): 1754–66. doi:10.1128 / MCB.22.6.1754-1766.2002. PMC 135597. PMID 11865055.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gazzaniga P, Gradilone A, Giuliani L a kol. (2003). „Exprese a prognostický význam genů LIVIN, SURVIVIN a dalších genů souvisejících s apoptózou v progresi povrchového karcinomu močového měchýře“. Ann. Oncol. 14 (1): 85–90. doi:10.1093 / annonc / mdg002. PMID 12488298.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Crnkovic-Mertens I, Hoppe-Seyler F, Butz K (2004). „Indukce apoptózy v nádorových buňkách pomocí umlčení genu pro livin / ML-IAP / KIAP zprostředkované siRNA“. Onkogen. 22 (51): 8330–6. doi:10.1038 / sj.onc.1206973. PMID 14614456.
Andersen MH, Reker S, Becker JC, thor Straten P (2004). „Inhibitor melanomu proteinu apoptózy: cíl spontánních reakcí cytotoxických T buněk“. J. Invest. Dermatol. 122 (2): 392–9. doi:10.1046 / j.0022-202X.2004.22242.x. PMID 15009721.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Tanabe H, Yagihashi A, Tsuji N a kol. (2005). "Exprese survivinové mRNA a livinové mRNA u nemalobuněčného karcinomu plic". Rakovina plic. 46 (3): 299–304. doi:10.1016 / j.lungcan.2004.05.002. PMID 15541814.
Yagihashi A, Ohmura T, Asanuma K a kol. (2006). "Detekce autoprotilátek proti survivinu a livinu v séru od pacientů s rakovinou prsu". Clin. Chim. Acta. 362 (1–2): 125–30. doi:10.1016 / j.cccn.2005.06.009. PMID 16026775.
Crnković-Mertens I, Semzow J, Hoppe-Seyler F, Butz K (2006). „Isoformově specifické umlčení genu pro Livin interferencí RNA definuje Livin beta jako klíčového mediátora inhibice apoptózy v HeLa buňkách“. J. Mol. Med. 84 (3): 232–40. doi:10.1007 / s00109-005-0021-5. PMID 16437214. S2CID 28468027.
Ma L, Huang Y, Song Z a kol. (2007). „Livin podporuje degradaci Smac / DIABLO cestou ubikvitin-proteazomu“. Buněčná smrt se liší. 13 (12): 2079–88. doi:10.1038 / sj.cdd.4401959. PMID 16729033.
Yan H, Brouha B, Liu T a kol. (2006). „Proteolytické štěpení Livinu (ML-IAP) v apoptotických melanomových buňkách potenciálně zprostředkovaných nekanonickou kaspázou“. J. Dermatol. Sci. 43 (3): 189–200. doi:10.1016 / j.jdermsci.2006.05.007. PMC 2292408. PMID 16806840.
Wu H, Ma Y, Zhu Y a kol. (2007). "Exprese proteinu BIRC7 a mRNA v non-Hodgkinově lymfomu". Leuku. Lymfom. 47 (6): 1110–6. doi:10.1080/10428190500472271. PMID 16840203. S2CID 24671993.
Crnković-Mertens I, Muley T, Meister M a kol. (2007). „Antiapoptotický gen pro livin je důležitým determinantem pro apoptotickou rezistenci nemalobuněčných buněk rakoviny plic.“ Rakovina plic. 54 (2): 135–42. doi:10.1016 / j.lungcan.2006.07.018. PMID 16965834.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101197 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038840 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11024045-5] Kasof GM, Gomes BC (květen 2001). „Livin, nový inhibitor člena rodiny proteinů apoptózy“. J Biol Chem. 276 (5): 3238–46. doi:10,1074 / jbc.M003670200. PMID 11024045.

[pmid11162435-6] Lin JH, Deng G, Huang Q, Morser J (únor 2001). „KIAP, nový člen rodiny proteinových inhibitorů apoptózy“. Biochem Biophys Res Commun. 279 (3): 820–31. doi:10,1006 / bbrc.2000.4027. PMID 11162435.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: BIRC7 bakulovirový IAP repetice obsahující 7 (livin)“.

[pmid18451137-8] Dynek JN, Chan SM, Liu J a kol. (2008). „Transkripční faktor spojený s mikroftalmií je kritickým regulátorem transkripce inhibitoru melanomu u apoptózy u melanomů“. Cancer Res. 68 (9): 3124–32. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6622. PMID 18451137.

[pmidunknown-9] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM a kol. (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]