BANP - BANP

BANP
Identifikátory
Aliasy	BANP„BEND1, SMAR1, SMARBP1, BTG3 asociovaný jaderný protein
Externí ID	OMIM: 611564 MGI: 1889023 HomoloGene: 9635 Genové karty: BANP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	88,077,318 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	122,029,258 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba p53; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderné těleso;
Biologický proces	• lokalizace proteinu do jádra; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • buněčný cyklus; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace proteinového katabolického procesu; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54971
	53325
	ENSG00000172530
	ENSMUSG00000025316
	Q8N9N5
	Q8VBU8
NM_001173539; NM_001173540; NM_001173541; NM_001173542; NM_001173543;
	NM_017869; NM_079837
	NM_001110100; NM_001285981; NM_001285983; NM_016812
NP_001167010; NP_001167011; NP_001167012; NP_001167013; NP_001167014;
	NP_060339; NP_524576
	NP_001103570; NP_001272910; NP_001272912; NP_058092
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein BANP je protein že u lidí je kódován BANP gen.^[5]^[6]^[7] Je členem rodiny lidských genů, “BEN doména obsahující ", který zahrnuje dalších osm genů: BEND2, BEND3, BEND4, BEND5, BEND6, BEND7, NACC1 (BEND8) a NACC2 (BEND9).

Funkce

Tento gen kóduje protein, který se váže na oblasti připojení matrice. Protein funguje jako a supresor nádoru a buněčný cyklus regulátor. Byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty kódující různé izoformy.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172530 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025316 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Birot A, Duret L, Bartholin L, Santalucia B, Tigaud I, Magaud J, Rouault J (srpen 2000). "Identifikace a molekulární analýza BANP". Gen. 253 (2): 189–96. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00244-4. PMID 10940556.
^ Chattopadhyay S, Kaul R, Charest A, Housman D, Chen J (srpen 2000). „SMAR1, nový, alternativně sestřihaný genový produkt, váže oblast spojenou s Scaffold / Matrix na lokusu beta receptoru T buněk“. Genomika. 68 (1): 93–6. doi:10,1006 / geno.2000.6279. PMID 10950932.
^ ^A ^b "Entrez Gene: BANP BTG3 asociovaný jaderný protein".

externí odkazy

Člověk BANP umístění genomu a BANP stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (září 1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Výzkum genomu. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Kaul R, Mukherjee S, Ahmed F, Bhat MK, Chhipa R, Galande S, Chattopadhyay S (únor 2003). „Přímá interakce s aktivací p53 pomocí SMAR1 zpomaluje progresi buněčného cyklu ve fázi G2 / M a zpomaluje růst nádoru u myší“. International Journal of Cancer. 103 (5): 606–15. doi:10.1002 / ijc.10881. PMID 12494467. S2CID 22386279.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Kaul-Ghanekar R, Jalota A, Pavithra L, Tucker P, Chattopadhyay S (2004). „SMAR1 a Cux / CDP modulují chromatin a působí jako negativní regulátory zesilovače TCRbeta (Ebeta)“. Výzkum nukleových kyselin. 32 (16): 4862–75. doi:10.1093 / nar / gkh807. PMC 519105. PMID 15371550.
Kaul-Ghanekar R, Majumdar S, Jalota A, Gulati N, Dubey N, Saha B, Chattopadhyay S (březen 2005). „Abnormální V (D) J rekombinace lokusu beta receptoru T buněk u transgenních myší SMAR1“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (10): 9450–9. doi:10,1074 / jbc.M412206200. PMID 15623522.
Jalota A, Singh K, Pavithra L, Kaul-Ghanekar R, Jameel S, Chattopadhyay S (duben 2005). „Nádorový supresor SMAR1 aktivuje a stabilizuje p53 prostřednictvím motivu bohatého na arginin-serin“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (16): 16019–29. doi:10,1074 / jbc.M413200200. PMID 15701641.
Rampalli S, Pavithra L, Bhatt A, Kundu TK, Chattopadhyay S (říjen 2005). „Nádorový supresor SMAR1 zprostředkovává represi cyklinu D1 prostřednictvím náboru komplexu SIN3 / histon-deacetyláza 1“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (19): 8415–29. doi:10.1128 / MCB.25.19.8415-8429.2005. PMC 1265755. PMID 16166625.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172530 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025316 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10940556-5] Birot A, Duret L, Bartholin L, Santalucia B, Tigaud I, Magaud J, Rouault J (srpen 2000). "Identifikace a molekulární analýza BANP". Gen. 253 (2): 189–96. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00244-4. PMID 10940556.

[pmid10950932-6] Chattopadhyay S, Kaul R, Charest A, Housman D, Chen J (srpen 2000). „SMAR1, nový, alternativně sestřihaný genový produkt, váže oblast spojenou s Scaffold / Matrix na lokusu beta receptoru T buněk“. Genomika. 68 (1): 93–6. doi:10,1006 / geno.2000.6279. PMID 10950932.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: BANP BTG3 asociovaný jaderný protein".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]