Azurocidin 1 - Azurocidin 1

AZU1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1A7S, 1AE5, 1FY1, 1FY3
Identifikátory
Aliasy	AZU1, AZAMP, AZU, CAP37, HBP, HUMAZUR, NAZC, hHBP, azurocidin 1
Externí ID	OMIM: 162815 HomoloGene: 74404 Genové karty: AZU1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	832,018 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na heparin; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba proteoglykanu heparan sulfát; • vázání toxických látek; • aktivita endopeptidázy serinového typu;
Buněčná složka	• membrána; • azurofilní granule; • azurofilní granulovaná membrána; • extracelulární exosom; • vnější složka membrány; • extracelulární oblast; • extracelulární; • lumen azurofilní granule;
Biologický proces	• pozitivní regulace procesu biosyntézy MHC třídy II; • pozitivní regulace fagocytózy; • negativní regulace apoptotického procesu; • signalizace protein kinázy C.; • aktivace mikrogliálních buněk; • proteolýza; • indukce pozitivní chemotaxe; • aktivace monocytů; • chemotaxe; • regulace vaskulární propustnosti; • pozitivní regulace genové exprese; • makrofágová chemotaxe; • signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem spojeným s proteinkinázou C; • obranná reakce na bakterii; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-threoninu; • zabíjení bakterií zprostředkované neutrofily; • obranná odpověď na gramnegativní bakterii; • buněčná chemotaxe; • buněčná extravazace; • zánětlivá reakce; • vápníkem zprostředkovaná signalizace pomocí intracelulárního zdroje vápníku; • migrace gliových buněk; • pozitivní regulace buněčné adheze; • pozitivní regulace aktivity proteinkinázy; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	566
	n / a
	ENSG00000278624; ENSG00000172232
	n / a
	P20160
	n / a
	NM_001700
	n / a
	NP_001691
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Azurocidin také známý jako kationtový antimikrobiální protein CAP37 nebo protein vázající heparin (HBP) je a protein že u lidí je kódován AZU1 gen.^[3]^[4]

Funkce

Azurofilní granule specializované lysozomy z neutrofily obsahují alespoň 10 proteinů podílejících se na zabíjení mikroorganismů. Protein kódovaný tímto genem je azurofilní granulovaný antimikrobiální protein s monocytovou chemotaktickou a antibakteriální aktivitou. Je to také důležité multifunkční zařízení zánětlivý mediátor.^[5] Geny kódující tento protein, neutrofilní elastáza 2 a proteináza 3 jsou v klastru umístěném na chromozomu 19pter. Všechny 3 geny jsou exprimovány koordinovaně a jejich proteinové produkty jsou zabaleny společně do azurofilních granulí během diferenciace neutrofilů.^[4]

Struktura

Srovnání struktury azurocidinu 1 (pseudoproteáza) s chymotrypsinem (funkční proteáza) stejné nadčeleď

Tento kódovaný protein je členem PA klanu proteáz, ale nejde o serinovou proteinázu, protože jsou nahrazeny zbytky serinu a histidinu v aktivním místě, což z něj činí pseudoenzym.^[6]

Klinický význam

U pacientů s horečkou vysoké plazmatické hladiny HBP naznačují, že u pacienta je vysoké riziko rozvoje sepse s oběhový kolaps.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000172232 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000278624, ENSG00000172232 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Morgan JG, Sukiennicki T, Pereira HA, Spitznagel JK, Guerra ME, Larrick JW (listopad 1991). "Klonování cDNA pro serinproteázový homolog CAP37 / azurocidin, mikrobicidní a chemotaktický protein z lidských granulocytů". J. Immunol. 147 (9): 3210–4. PMID 1919011.
^ ^A ^b "Entrez Gene: AZU1 azurocidin 1 (kationtový antimikrobiální protein 37)".
^ Soehnlein, Oliver; Lindbom, Lennart (2009). „Azurocidin odvozený z neutrofilů alarmuje imunitní systém“. Journal of Leukocyte Biology. 85 (3): 344–351. doi:10.1189 / jlb.0808495. ISSN 1938-3673. PMID 18955543. S2CID 23637918.
^ Iversen, L. F .; Kastrup, J. S .; Bjørn, S.E .; Rasmussen, P. B .; Wiberg, F. C .; Flodgaard, H. J .; Larsen, I. K. (1997). "Struktura HBP, multifunkčního proteinu se záhybem serinové proteinázy". Přírodní strukturní biologie. 4 (4): 265–268. doi:10.1038 / nsb0497-265. ISSN 1072-8368. PMID 9095193. S2CID 19949043.
^ Linder A, Christensson B, Herwald H, Björck L, Akesson P (říjen 2009). „Protein vázající se na heparin: časný marker oběhového selhání při sepse“. Clin. Infikovat. Dis. 49 (7): 1044–50. doi:10.1086/605563. PMID 19725785.

externí odkazy

Člověk AZU1 umístění genomu a AZU1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Morgan JG, Pereira HA, Sukiennicki T a kol. (1992). „Kationtový protein lidských neutrofilních granulí CAP37 je specifický makrofágový chemotaxin, který sdílí homologii se zánětlivými proteinázami“. Adv. Exp. Med. Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 305: 89–96. doi:10.1007/978-1-4684-6009-4_11. ISBN 978-1-4684-6011-7. PMID 1755383.
Watorek W (2004). "Azurocidin - neaktivní homolog serinové proteinázy působící jako multifunkční zánětlivý mediátor". Acta Biochim. Pol. 50 (3): 743–52. doi:10.18388 / abp.2003_3665. PMID 14515154.
Zimmer M, Medcalf RL, Fink TM a kol. (1992). „Tři lidské geny podobné elastáze koordinovaně exprimované v linii myelomonocytů jsou organizovány jako jediný genetický lokus na 19pter“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (17): 8215–9. doi:10.1073 / pnas.89.17.8215. PMC 49888. PMID 1518849.
Green BG, Weston H, Ashe BM a kol. (1991). „PMN elastázy: srovnání specificity lidských isozymů a enzymu z jiných druhů vůči substrátům a inhibitorům“. Oblouk. Biochem. Biophys. 286 (1): 284–92. doi:10.1016 / 0003-9861 (91) 90042-H. PMID 1897955.
Flodgaard H, Ostergaard E, Bayne S a kol. (1991). „Kovalentní struktura dvou nových proteinů prasatového a lidského původu z neutrofilních leukocytů. Neutrofilní elastázy homology se silnými chemotaktickými aktivitami monocytů a fibroblastů“. Eur. J. Biochem. 197 (2): 535–47. doi:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb15942.x. PMID 2026172.
Almeida RP, Melchior M, Campanelli D a kol. (1991). „Doplňková sekvence DNA lidského neutrofilního azurocidinu, antibiotika s rozsáhlou homologií k serinovým proteázám“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 177 (2): 688–95. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 91843-2. PMID 2049091.
Pohl J, Pereira HA, Martin NM, Spitznagel JK (1990). „Aminokyselinová sekvence CAP37, antibakteriální derivát z lidských neutrofilních granulí a chemotaktický glykoprotein specifický pro monocyty strukturně podobný neutrofilní elastáze“. FEBS Lett. 272 (1–2): 200–4. doi:10.1016 / 0014-5793 (90) 80484-Z. PMID 2226832. S2CID 36779510.
Campanelli D, Detmers PA, Nathan CF, Gabay JE (1990). "Azurocidin a homologní serinová proteáza z neutrofilů. Diferenciální antimikrobiální a proteolytické vlastnosti". J. Clin. Investovat. 85 (3): 904–15. doi:10.1172 / JCI114518. PMC 296509. PMID 2312733.
Pereira HA, Shafer WM, Pohl J a kol. (1990). „CAP37, lidský neutrofilní chemotaktický faktor se specifickou aktivitou pro monocyty“. J. Clin. Investovat. 85 (5): 1468–76. doi:10.1172 / JCI114593. PMC 296594. PMID 2332502.
Wilde CG, Snable JL, Griffith JE, Scott RW (1990). "Charakterizace dvou azurfilních granulárních proteáz s homologií aktivního místa s neutrofilní elastázou". J. Biol. Chem. 265 (4): 2038–41. PMID 2404977.
Pereira HA, Spitznagel JK, Pohl J a kol. (1990). „CAP 37, kationtový protein z lidských neutrofilních granulí o 37 kD sdílí homologii se zánětlivými proteinázami“. Life Sci. 46 (3): 189–96. doi:10.1016 / 0024-3205 (90) 90104-Y. PMID 2406527.
Gabay JE, Scott RW, Campanelli D a kol. (1989). "Antibiotické proteiny lidských polymorfonukleárních leukocytů". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (14): 5610–4. doi:10.1073 / pnas.86.14.5610. PMC 297672. PMID 2501794.
Pereira HA, Erdem I, Pohl J, Spitznagel JK (1993). „Syntetický baktericidní peptid na bázi CAP37: kationtová antimikrobiální bílkovina asociovaná s lidskými neutrofily s granulemi chemotaktická pro monocyty“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (10): 4733–7. doi:10.1073 / pnas.90.10.4733. PMC 46587. PMID 8506327.
Chertov O, Michiel DF, Xu L a kol. (1996). „Identifikace defensinu-1, defensinu-2 a CAP37 / azurocidinu jako proteinů chemoatraktantů T-buněk uvolňovaných z neutrofilů stimulovaných interleukinem-8“. J. Biol. Chem. 271 (6): 2935–40. doi:10.1074 / jbc.271.6.2935. PMID 8621683.
Iversen LF, Kastrup JS, Bjørn SE a kol. (1997). "Struktura HBP, multifunkčního proteinu se záhybem serinové proteinázy". Nat. Struct. Biol. 4 (4): 265–8. doi:10.1038 / nsb0497-265. PMID 9095193. S2CID 19949043.
Karlsen S, Iversen LF, Larsen IK a kol. (1998). "Struktura atomového rozlišení lidského HBP / CAP37 / azurocidinu". Acta Crystallogr. D. 54 (Pt 4): 598–609. doi:10.1107 / S0907444997016193. PMID 9761855.
Olofsson AM, Vestberg M, Herwald H a kol. (1999). „Protein vázající se na heparin zaměřený na mitochondriální kompartmenty chrání endoteliální buňky před apoptózou“. J. Clin. Investovat. 104 (7): 885–94. doi:10,1172 / JCI6671. PMC 408551. PMID 10510329.
Lindmark A, Garwicz D, Rasmussen PB a kol. (1999). "Charakterizace biosyntézy, zpracování a třídění lidského HBP / CAP37 / azurocidinu". J. Leukoc. Biol. 66 (4): 634–43. doi:10,1002 / jlb.66.4.634. PMID 10534120. S2CID 27897421.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000172232 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000278624, ENSG00000172232 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1919011-3] Morgan JG, Sukiennicki T, Pereira HA, Spitznagel JK, Guerra ME, Larrick JW (listopad 1991). "Klonování cDNA pro serinproteázový homolog CAP37 / azurocidin, mikrobicidní a chemotaktický protein z lidských granulocytů". J. Immunol. 147 (9): 3210–4. PMID 1919011.

[entrez-4] A ^b "Entrez Gene: AZU1 azurocidin 1 (kationtový antimikrobiální protein 37)".

[5] Soehnlein, Oliver; Lindbom, Lennart (2009). „Azurocidin odvozený z neutrofilů alarmuje imunitní systém“. Journal of Leukocyte Biology. 85 (3): 344–351. doi:10.1189 / jlb.0808495. ISSN 1938-3673. PMID 18955543. S2CID 23637918.

[6] Iversen, L. F .; Kastrup, J. S .; Bjørn, S.E .; Rasmussen, P. B .; Wiberg, F. C .; Flodgaard, H. J .; Larsen, I. K. (1997). "Struktura HBP, multifunkčního proteinu se záhybem serinové proteinázy". Přírodní strukturní biologie. 4 (4): 265–268. doi:10.1038 / nsb0497-265. ISSN 1072-8368. PMID 9095193. S2CID 19949043.

[pmid19725785-7] Linder A, Christensson B, Herwald H, Björck L, Akesson P (říjen 2009). „Protein vázající se na heparin: časný marker oběhového selhání při sepse“. Clin. Infikovat. Dis. 49 (7): 1044–50. doi:10.1086/605563. PMID 19725785.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]