Aureochromy - Aureochromes

Aureochromy jsou modré světlo fotoreceptory stejně jako transkripční faktory nalezen pouze v stramenopiles zatím.[1][2][3]

Popis

Poprvé byl objeven v Vaucheria frigida v roce 2007 Takahashi et.al. Fotosyntetický eukaryoty převážně přeměňují sluneční světlo na energii fotosyntézou, ale světlo je také důležité pro pohyb a vývoj, regulaci biologických aktivit. Efektivní vlnová délka pro světelné reakce u fotosyntetických eukaryot je hlavně v oblastech červeného světla (RL) a modrého světla (BL) (Mohr 1980; Furuya 1993). Red / far-red receptor fytochrom a fytochromem zprostředkované reakce, jako je potlačení hypokotyl růst byl intenzivně studován. BL-indukované reakce mohou zahrnovat fototropismus a chloroplast foto-relokační hnutí (Christie 2007). V zelených rostlinách byly objeveny různé receptory BL. Takahashi et.al izolovali BL receptory z Xanthophyceae alga, Vaucheria v roce 2007 a pojmenoval ji Aureochrome (latinský význam: aureus = zlato). Tato nová třída fotoreceptorů modrého světla je svým způsobem jedinečná díky přítomnosti a bZIP (doména vázající DNA) spolu s doménou LOV (vnímání světla), díky níž funguje jako transkripční faktor stejně jako fotoreceptor, jak ukazují Takahashi et al. v roce 2007.

Čtyři ortology v modelu bylo identifikováno aureochromů rozsivka P. tricornutumtj. AUREO 1a, 1b, 1c a 2. Aureo1a rozpoznává sekvenci TGACGT, která je typickým vazebným místem pro určité podskupiny transkripčních faktorů bZIP. Bylo také prokázáno, že PtAUREO1a a 1c jsou regulovány na světle nezávislé cirkadiánní rytmus a že jsou schopni se formovat homodimery a heterodimery které rozpoznávají sekvenci jádra ACGT v aureochromu.[4] Fotoreakce proteinu AUREO 1 byly nedávno studovány Tsuguyoshi et al (2011) a dospěli k závěru, že AUREO1-LOV existuje v rovnováze mezi monomer a dimer. Huysman a kol. ukázal, že Aureo1a se podílí na regulaci exprese cyklinu dsCYC2 specifického pro rozsivku, který se podílí na fázovém přechodu G1 na S po zatčení temnotou v roce 2013. Aureo1a je skutečně prokázáno, že funguje jako represor vysokého světla aklimatizace[5].[6]

Reference

  1. ^ Takahashi, Fumio; Yamagata, Daisuke; Ishikawa, Mié; Fukamatsu, Yosuke; Ogura, Yasunobu; Kasahara, Masahiro; Kiyosue, Tomohiro; Kikuyama, Munehiro; Wada, Masamitsu (04.12.2007). „AUREOCHROME, fotoreceptor potřebný pro fotomorfogenezi ve stramenopilech“. Sborník Národní akademie věd. 104 (49): 19625–19630. doi:10.1073 / pnas.0707692104. PMC  2148339. PMID  18003911.
  2. ^ Kataoka, Hironao; Wada, Masamitsu; Kikuyama, Munehiro; Kiyosue, Tomohiro; Kasahara, Masahiro; Ogura, Yasunobu; Fukamatsu, Yosuke; Ishikawa, Mié; Yamagata, Daisuke (04.12.2007). „AUREOCHROME, fotoreceptor potřebný pro fotomorfogenezi ve stramenopilech“. Sborník Národní akademie věd. PNAS, Národní akademie věd. 104 (49): 19625–19630. doi:10.1073 / pnas.0707692104. PMC  2148339. PMID  18003911.
  3. ^ Kroth, Peter G .; Wilhelm, Christian; Kottke, Tilman (2017). "Aktualizace o aureochromech: fylogeneze - mechanismus - funkce". Journal of Plant Physiology. 217: 20–26. doi:10.1016 / j.jplph.2017.06.010. PMID  28797596.
  4. ^ Banerjee, Ankan; Herman, Elena; Patkové, Manuel; Maestre-Reyna, Manuel; Hepp, Sebastian; Pokorný, Richard; Kroth, Peter G .; Essen, Lars-Oliver; Kottke, Tilman (2016). „Alosterická komunikace mezi doménami vázajícími se na DNA a na světlo reagující domény rozsivkových aureochromů třídy I“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (12): 5957–5970. doi:10.1093 / nar / gkw420. PMC  4937327. PMID  27179025.
  5. ^ Serif, M .; Lepetit, B .; Weißert, K ​​.; Kroth, P.G .; Rio Bartulos, C. (2017). „Rychlá a spolehlivá strategie pro generování knockoutů genů zprostředkovaných TALENem v rozsivce Phaeodactylum tricornutum“ (PDF). Výzkum řas. 23: 186–195. doi:10.1016 / j.algal.2017.02.005.
  6. ^ Madhuri, S .; Río Bártulos, C .; Serif, M .; Lepetit, B .; Kroth, P.G. (2019). „Strategie doplňující PtAUREO1a v TALEN knockout kmenech Phaeodactylum tricornutum“. Výzkum řas. 39: 101469. doi:10.1016 / j.algal.2019.101469.

Další čtení