Argininový represor ArgR - Arginine repressor ArgR
| Argininový represor, C-terminální doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 c-terminální doména komplexu arginin represor escherichia coli / l-arginin; derivát pb | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Arg_repressor_C | ||||||||
| Pfam | PF02863 | ||||||||
| InterPro | IPR020899 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Argininový represor, vazebná doména DNA | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Arg_repressor | ||||||||
| Pfam | PF01316 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se argininový represor (ArgR) je represorem prokaryotický dráhy argininiminiminázy.
The arginin Dihydroláza (AD) se nachází v mnoha prokaryoty a některé eukaryoty, příklad toho druhého Giardia lamblia (Giardia intestinalis).[1] Tři-enzymová anaerobní cesta štěpí L-arginin za vzniku 1 mol ATP, oxid uhličitý a amoniak. V některých bakteriích je první enzym arginin deimináza, může představovat až 10% z celkové částky buňka protein.[1]
Většina prokaryotický dráhy argininiminiminázy jsou pod kontrolou a represor gen, nazývaný ArgR.[2] Toto je negativní regulátor a uvolní pouze argininiminiminázu operon pro výraz v přítomnosti argininu.[3] The Krystalická struktura apo-ArgR z Bacillus stearothermophilus byla stanovena na 2,5 A pomocí Rentgenová krystalografie.[4] Protein existuje jako hexamer identických podjednotek a je prokázáno, že má šest domén vázajících DNA, seskupených kolem centrálního oligomerního jádra, když se váže na arginin. Převážně interaguje s A.T zbytky v krabicích ARG. Tento hexamerní protein váže DNA na svém N-konci k potlačení biosyntézy argininu nebo k aktivaci argininu katabolismus. Nějaký druh mít několik ArgR paralogy. Některé ze sousedních stromů paralogní sekvence vykazují dlouhé větve a významně se liší od dobře konzervované C-koncové oblasti.
Reference
- ^ A b Brown DM, Upcroft JA, Edwards MR, Upcroft P (leden 1998). „Anaerobní bakteriální metabolismus ve starověkém eukaryotu Giardia duodenalis". Int. J. Parasitol. 28 (1): 149–64. doi:10.1016 / S0020-7519 (97) 00172-0. PMID 9504342.
- ^ Lu CD, Houghton JE, Abdelal AT (květen 1992). "Charakterizace represoru argininu ze Salmonella typhimurium a jeho interakce s operátorem carAB". J. Mol. Biol. 225 (1): 11–24. doi:10.1016 / 0022-2836 (92) 91022-H. PMID 1583685.
- ^ Maghnouj A, de Sousa Cabral TF, Stalon V, Vander Wauven C (prosinec 1998). „ArcABDC genový klastr kódující dráhu argininiminiminázy Bacillus licheniformis a jeho aktivaci argininovým represorem argR“. J. Bacteriol. 180 (24): 6468–75. doi:10.1128 / JB.180.24.6468-6475.1998. PMC 107747. PMID 9851988.
- ^ Ni J, Sakanyan V, Charlier D, Glansdorff N, Van Duyne GD (květen 1999). "Struktura represoru argininu z Bacillus stearothermophilus". Nat. Struct. Biol. 6 (5): 427–32. doi:10.1038/8229. PMID 10331868. S2CID 24763624.