Andrew J. Roger - Andrew J. Roger

Andrew J. Roger
AndrewRogergroup.png
Andrew J. Roger
Akademické pozadí
Alma materUniversity of British Columbia, Dalhousie University
VlivyFord Doolittle
Akademická práce
InstituceDalhousie University
Hlavní zájmyEukaryotické organismy, biologie a evoluce mitochondrií, hydrogenosomy a mitosomy, komparativní genomika jednobuněčných eukaryot, modelování evoluce genů a genomů
webová stránkahttps://medicine.dal.ca/departments/department-sites/biochemistry-molecular-biology/our-people/faculty/roger.html

Andrew J. Roger je kanadsko-australský molekulární biolog a evoluční bioinformatik. V současné době je profesorem na Ústav biochemie a molekulární biologie v Dalhousie University a byl zakládajícím ředitelem (v letech 2008–2017) meziresortního Centra pro srovnávací genomiku a evoluční bioinformatiku (CGEB).[1]

Vzdělání a kariéra

Roger dostal jeho B.Sc z University of British Columbia a jeho PhD z Dalhousie University. Roger byl zvolen členem kolegy z Royal Society of Canada v roce 2012[2] pro jeho práci na eukaryotice superknihy, jeho práce na vývoji organel souvisejících s mitochondrií v anaerobních protistech a jeho příspěvek k vyšetřování a zlepšování fylogenetických modelů [3]

Výzkum

Bývalý student Ford Doolittle, Rogerův výzkum se zaměřuje na „hluboký“ Strom života, zejména určování vztahů mezi eukaryoty na úrovni nadkrálovství a objasnění podstaty poslední eukaryotický společný předek (LECA).[4] Pomocí fylogenomických přístupů Rogerova skupina objasňuje vzorce a proces evoluce genomu v eukaryotických mikrobech. Jeho výzkum se také zabývá evolučním původem mitochondrie, hydrogenosomy, a mitosomy,[5][6][7] role laterálního (horizontálního) přenosu genů v evoluci eukaryotického genomu[8][9] a jak se anaerobní paraziti vyvinuli z volně žijících předků.

Vybrané publikace

  • Roger, A.J. a Susko, E. (2018) Molekulární hodiny poskytují zatím málo informací methanogenní archaea. Nature Ecol. Evol. 2: 1676-1677.
  • Muñoz-Gómez, S.A., Hess, S., Burger, G., Lang, B.F., Susko, E., Slamovits, C.H. a Roger, A.J. (2019) Aktualizovaná fylogeneze Alphaproteobacteria odhaluje, že parazitické Rickettsiales a * Holosporales mají nezávislý původ. eLife, 25. února; 8. pii: e42535.
  • Hess, S., Eme, L., Roger, A.J. a Simpson, A.G.B. (2019) Přírodní toroidní mikroplavka poháněná rotačním eukaryotickým bičíkem. Nature Microbiol. 4:1620-1626.
  • Susko E. a Roger, A.J. (2019) O použití informačních kritérií pro výběr modelu ve fylogenetice. Mol. Biol. Evol., 5. listopadu
  • Susko E, Roger AJ., (2013) Problémy s odhadem kmitočtů předků podle stacionárních modelů. Syst Biol. 62(2):330-8
  • Schody, C.W., Roger, A.J. a Hampl, V., (2011) Eukaryotická pyruvátformát-lyáza a její aktivační enzym byly získány laterálně z firmy. Mol. Biol. Evol. 28:2087-2099

Reference

  1. ^ http://www.biochem.dal.ca/faculty-staff/faculty/roger.php
  2. ^ [1]
  3. ^ https://www.dal.ca/news/2012/09/24/a--royal--recognition-for-dal-scientists.html
  4. ^ http://bloodroot.biochem.dal.ca/rogerlab.ca/Andrew.php
  5. ^ Muñoz-Gómez, S. A .; Wideman, J. G .; Roger, A. J .; Slamovits, C. H. (2017). "Původ mitochondriálních cristae z alphaproteobacteria". Molekulární biologie a evoluce. 34 (4): 943–956. doi:10.1093 / molbev / msw298. PMID  28087774.
  6. ^ Schody, Courtney W .; Eme, Laura; Brown, Matthew W .; Mutsaers, Cornelis; Susko, Edward; Dellaire, Graham; Soanes, Darren M .; van der Giezen, Mark; Roger, Andrew J. (červen 2014). „SUF Fe-S Cluster Biogenesis System in the Mitochondrion-related Organelles of the Anaerobic Protist Pygsuia“. Aktuální biologie. 24 (11): 1176–1186. doi:10.1016 / j.cub.2014.04.033. PMID  24856215.
  7. ^ Leger, M. M .; Gawryluk, R. M .; Gray, M. W .; Roger, A. J. (2013). „Důkazy o cestě k tvorbě anaerobního ATP hydrogenačního typu v Acanthamoeba castellanii“. PLOS ONE. 8 (9): e69532. Bibcode:2013PLoSO ... 869532L. doi:10.1371 / journal.pone.0069532. PMC  3785491. PMID  24086244.
  8. ^ Leger, Michelle M .; Eme, Laura; Schody, Courtney W .; Roger, Andrew J. (2018). „Demystifikace eukaryotického laterálního přenosu genů (reakce na Martin 2017 DOI: 10.1002 / bies.201700115)“. BioEssay. p. 1700242. doi:10.1002 / bies.201700242.
  9. ^ Sibbald, Shannon J .; Eme, Laura; Archibald, John M .; Roger, Andrew J. (19. srpna 2020). „Mechanismy laterálního přenosu genů a pangenomy u eukaryot“. Trendy v parazitologii. doi:10.1016 / j.pt.2020.07.014.