Alkb homolog 1, histon h2a dioxygenáza - Alkb homolog 1, histone h2a dioxygenase

ALKBH1
Identifikátory
Aliasy	ALKBH1, ABH, ABH1, ALKBH, alkB, hABH, alkB homolog 1, histon H2A dioxygenáza
Externí ID	OMIM: 605345 MGI: 2384034 HomoloGene: 4393 Genové karty: ALKBH1
EC číslo	4.2.99.18
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	77,708,023 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methylcytosin dioxygenázy; • aktivita dioxygenázy; • vazba kovových iontů; • katalytická aktivita; • aktivita lyázy; • chemoatraktivní aktivita; • aktivita oxidoreduktázy; • vazba železného železa; • Aktivita 1-ethyladenin demethylázy; • vazba tRNA; • aktivita oxidoreduktázy, působící na spárované dárce, s inkorporací nebo redukcí molekulárního kyslíku, 2-oxoglutarát jako jeden donor, a inkorporace jednoho atomu každého kyslíku do obou dárců; • Aktivita DNA-N1-methyladenin dioxygenázy; • Aktivita tRNA demethylázy; • aktivita DNA - (apurinové nebo apyrimidinové místo) lyázy třídy I; • Aktivita DNA (apurinové nebo apyrimidinové místo) lyázy;
Buněčná složka	• mitochondrie; • buněčné jádro; • nukleární euchromatin;
Biologický proces	• negativní regulace neuronového apoptotického procesu; • diferenciace buněk; • Dealkylace DNA zapojená do opravy DNA; • placentace; • migrace neuronů; • v embryonálním vývoji dělohy; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • oxidační demetylace; • vývojový růst; • regulace genové exprese; • Oprava RNA; • Demetylace DNA; • pozitivní chemotaxe; • metabolismus; • vývoj projekce neuronů; • oxidačně-redukční proces; • Oprava DNA; • regulace překladu; • Modifikace cytosinu kolísající tRNA; • regulace iniciace translace; • regulace translační tažnosti; • oxidační demetylace jednovláknové DNA; • regulace mitochondriálního překladu; • Demetylace tRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8846
	211064
	ENSG00000100601
	ENSMUSG00000079036
	Q13686
	P0CB42
	NM_001039506; NM_006020
	NM_001102565
	NP_006011
	NP_001096035
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

AlkB homolog 1, histon H2A dioxygenáza je protein že u lidí je kódován ALKBH1 gen.^[4]

Funkce

Tento gen kóduje a homolog do E-coli alkB genový produkt. AlkB protein E. coli je součástí mechanismu adaptivní reakce Alkylace DNA oprava poškození. Podílí se na obrácení poškození o oxidační demetylace z 1-methyladenin a 3-methylcytosin. [poskytl RefSeq, červenec 2008].

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100601 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: AlkB homolog 1, histone H2A dioxygenase“. Citováno 2018-07-12.

Další čtení

Aas PA, Otterlei M, Falnes PO, Vågbø CB, Skorpen F, Akbari M, Sundheim O, Bjørås M, Slupphaug G, Seeberg E, Krokan HE (únor 2003). "Lidské a bakteriální oxidační demetylázy opravují poškození alkylace jak v RNA, tak v DNA". Příroda. 421 (6925): 859–63. doi:10.1038 / nature01363. PMID 12594517.
Westbye MP, Feyzi E, Aas PA, Vågbø CB, Talstad VA, Kavli B, Hagen L, Sundheim O, Akbari M, Liabakk NB, Slupphaug G, Otterlei M, Krokan HE (září 2008). „Human AlkB homolog 1 is a mitochondrial protein that demethylates 3-methylcytosine in DNA and RNA“. J. Biol. Chem. 283 (36): 25046–56. doi:10,1074 / jbc.M803776200. PMC 3259822. PMID 18603530.
Müller TA, Meek K, Hausinger RP (leden 2010). „Lidský homolog AlkB 1 (ABH1) vykazuje aktivitu DNA lyázy na abasických místech“. Oprava DNA (Amst.). 9 (1): 58–65. doi:10.1016 / j.dnarep.2009.10.011. PMC 2818486. PMID 19959401.
Shankaracharya, Das S, Vidyarthi AS (září 2011). "Homologické modelování a predikce funkce hABH1, zahrnující opravu DNA poškozené alkylací". Interdiscip Sci. 3 (3): 175–81. doi:10.1007 / s12539-011-0087-4. PMID 21956739.
Müller TA, Andrzejak MM, Hausinger RP (červen 2013). "Adukt kovalentní protein-DNA 5'-produkt je generován po aktivitě AP lyázy lidského ALKBH1 (AlkB homolog 1)". Biochem. J. 452 (3): 509–18. doi:10.1042 / BJ20121908. PMC 4126167. PMID 23577621.
Müller TA, Yu K, Hausinger RP, Meek K (2013). „ALKBH1 je postradatelný pro abasické štěpení místa během opravy základní excize a rekombinace přepínání třídy“. PLOS ONE. 8 (6): e67403. doi:10.1371 / journal.pone.0067403. PMC 3692455. PMID 23825659.
Fedeles BI, Singh V, Delaney JC, Li D, Essigmann JM (srpen 2015). „AlkB rodina Fe (II) / α-ketoglutarát-závislých dioxygenáz: Oprava poškození alkylací nukleovými kyselinami a dále“. J. Biol. Chem. 290 (34): 20734–42. doi:10,1074 / jbc.R115,656462. PMC 4543635. PMID 26152727.
Haag S, Sloan KE, Ranjan N, Warda AS, Kretschmer J, Blessing C, Hübner B, Seikowski J, Dennerlein S, Rehling P, Rodnina MV, Höbartner C, Bohnsack MT (říjen 2016). „NSUN3 a ABH1 modifikují polohu vlnění mt-tRNAMet, aby rozšířily rozpoznávání kodonů v mitochondriální translaci“ (PDF). EMBO J.. 35 (19): 2104–2119. doi:10.15252 / embj.201694885. PMC 5048346. PMID 27497299.
Liu F, Clark W, Luo G, Wang X, Fu Y, Wei J, Wang X, Hao Z, Dai Q, Zheng G, Ma H, Han D, Evans M, Klungland A, Pan T, He C (říjen 2016 ). „Demetylace tRNA zprostředkovaná ALKBH1 reguluje překlad“. Buňka. 167 (3): 816–828.e16. doi:10.1016 / j.cell.2016.09.038. PMC 5119773. PMID 27745969.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100601 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] „Entrez Gene: AlkB homolog 1, histone H2A dioxygenase“. Citováno 2018-07-12.

[1]

[2]

[3]

[4]