Alexander Stark - Alexander Stark

Alexander Stark
Alma mater
Vědecká kariéra
Polegenová exprese ve vývoji, transkripce
Instituce
Doktorský poradceRobert B. Russell
webová stránkawww.imp.ac.na/skupiny/ Alexander-Stark/

Alexander Stark (narozen 1974) je a biochemik a výpočetní biolog pracuje na regulaci genová exprese ve vývoji.[1] Je vědeckým pracovníkem v Výzkumný ústav molekulární patologie (IMP) na Vídeňské biocentrum a mimořádný profesor Lékařská univerzita ve Vídni.[2]

raný život a vzdělávání

Alexander Stark vyrostl v Bádensko-Württembersko, Německo. Studoval biochemii na University of Tübingen, a absolvoval s diplomem z biochemie v roce 2000.[3] V roce 2001 zahájil výzkum pro doktorské studium ve skupině Roberta B. (Rob) Russella na Evropská laboratoř molekulární biologie (EMBL) a získal doktorát z Univerzita v Kolíně nad Rýnem v roce 2004.[3] Stark zůstal v EMBL ještě jeden rok jako překlenovací postdoktorand.

Kariéra

V roce 2005[3] Stark se stal postdoktorským výzkumným pracovníkem ve skupinách Eric S. Lander a Manolis Kellis na Široký institut z MIT a Harvardská Univerzita a MIT Computer Science and Artificial Intelligence Laboratory (CSAIL) v Bostonu, USA. Jeho postdoktorandský výzkum podpořila EMBO, HFSP a Schering Foundation.

V roce 2008,[3] Stark se stal vůdcem skupiny[4] na Výzkumný ústav molekulární patologie (IMP) v Vídeň a byl povýšen na vedoucího vědce v roce 2015.[5] Byl jmenován mimořádným profesorem Lékařská univerzita ve Vídni v roce 2017.[2]

Výzkum

Alexander Stark studuje regulaci genová exprese v reakci na vývojové nebo environmentální podněty se učit jak transkripce a transkripční sítě definují buněčné a vývojové programy.[6][1]

Konkrétněji zkoumá, jak je transkripce regulována na úrovni zesilovač a základní promotor DNA prvky a transkripční faktor a kofaktorové proteiny, které zprostředkovávají aktivaci transkripce. Využívá funkční genomové funkční testy, bioinformatiku a hmotnostní spektrometrie, a vyvíjí inovativní reportérové ​​testy (např STARR-seq ), které poskytují přímé funkční údaje.[1]

Mezi nejcitovanější publikace společnosti Stark patří Principles of MicroRNA- Target Recognition,[7] bantam kóduje vývojově regulovanou mikroRNA, která řídí šíření buněk a reguluje proapoptotický gen ukrytý v Drosophile,[8] a modifikace histonu u lidských zesilovačů odrážejí globální genovou expresi specifickou pro daný buněčný typ.[9]

Ocenění a úspěchy

Alexander Stark byl vybrán EMBO Young Investigator v roce 2012;[10] oznámil jako „vysoce citovaný výzkumník“ Thomson Reuters v roce 2014[11] a zvolen členem EMBO v roce 2015.[12][13]

Mimo jiné granty a stipendia byl Starkovi udělen počáteční grant Evropská rada pro výzkum (ERC) v roce 2009 a konsolidační grant ERC v roce 2015.[14] Je členem redakčních rad Geny a vývoj[15] a Molekulární systémy biologie.[16]

Reference

  1. ^ A b C „Alexander Stark - Systémová biologie regulačních motivů a sítí“. Výzkumný ústav molekulární patologie. Citováno 2018-02-11.
  2. ^ A b "Alexander Stark". Výzkumný ústav molekulární patologie GmbH. IMP. Citováno 2019-02-14.
  3. ^ A b C d "Alexander Stark". Stark Lab. Výzkumný ústav molekulární patologie. Citováno 11. března 2019.
  4. ^ https://www.imp.ac.at/fileadmin/content/About_IMP/Research_Reports/2008_IMP_Research_Report.pdf
  5. ^ https://www.imp.ac.at/fileadmin/content/IMP_ResearchReport.pdf
  6. ^ „Dešifrování transkripčního cis-regulačního kódu“. Stark Lab. 2018-02-05. Citováno 2018-02-11.
  7. ^ Brennecke J, Stark A, Russell RB, Cohen SM (2005) Principles of MicroRNA – Target Recognition. PLoS Biol 3 (3): e85. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0030085
  8. ^ Brennecke, Julius (4. dubna 2003). „bantam kóduje vývojově regulovanou mikroRNA, která řídí šíření buněk a reguluje proapoptotický gen ukrytý v Drosophile“. 113 (1): 25–36. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00231-9. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  9. ^ Heintzman, Nathaniel (7. května 2009). „Modifikace histonu u lidských zesilovačů odrážejí globální genovou expresi specifickou pro daný buněčný typ“. Příroda. 459 (7243): 108–112. Bibcode:2009 Natur.459..108H. doi:10.1038 / nature07829. PMC  2910248. PMID  19295514.
  10. ^ „Najít mladého vyšetřovatele“. EMBO.
  11. ^ Pathology, The Research Institute of Molecular. „Alexander Stark mezi nejvíce citovanými světovými vědci“.
  12. ^ Pathology, The Research Institute of Molecular. „Tisková zpráva: EMBO Accolade pro Alexandra Starka“.
  13. ^ „Najít člena“. EMBO.
  14. ^ „Vědec IMP Alex Stark získal grant ERC Consolidator Grant“. idw-online.de.
  15. ^ „Genes & Development - About the Journal“. genesdev.cshlp.org.
  16. ^ „Editors & Board - Molecular Systems Biology“. msb.embopress.org.

externí odkazy