AUP1 - AUP1

AUP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EKF
Identifikátory
Aliasy	AUP1, starověký všudypřítomný protein 1, lipidové kapky regulující VLDL montážní faktor, AUP1 lipidové kapičky regulující VLDL montážní faktor
Externí ID	OMIM: 602434 MGI: 107789 HomoloGene: 7239 Genové karty: AUP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	74,529,760 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	83,057,808 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• ubikvitinová vazba; • aktivita aktivátoru ubikvitin-protein transferáza; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • Komplex ERAD-L ubikvitinové ligázy Hrd1p; • integrální součást membrány; • endoplazmatické retikulum;
Biologický proces	• retrográdní transport bílkovin, ER na cytosol; • cesta ERAD závislá na ubikvitinu; • GO: 0048552 regulace katalytické aktivity;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	550
	11993
	ENSG00000115307
	ENSMUSG00000068328
	Q9Y679
	P70295
	NM_181575
	NM_001025446; NM_001301649; NM_007517
	NP_853553
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Starověký všudypřítomný protein 1 je protein že u lidí je kódován AUP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje protein, který obsahuje doménu s homologií se starou konzervovanou oblastí archain 1 gen a doména, která se může účastnit vazby ubikvitin -konjugující enzymy. Ukázalo se, že protein kódovaný tímto genem se váže na konzervovanou membránově-proximální sekvenci cytoplazmatického ocasu podjednotek integrinu alfa (IIb). Tyto podjednotky hrají klíčovou roli při signalizaci naruby integrinu alfa (IIb) beta (3) krevní destičky a megakaryocyty což vede k agregaci krevních destiček a tvorbě trombu. Tento gen překrývá gen pro mitochondriální serinová proteáza 25.^[7]

Interakce

AUP1 bylo prokázáno komunikovat s ITGA2B.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115307 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068328 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Jang W, Weber JS, Bashir R, Bushby K, Meisler MH (leden 1997). „Aup1, nový gen na myším chromozomu 6 a lidském chromozomu 2p13“. Genomika. 36 (2): 366–8. doi:10.1006 / geno.1996.0477. PMID 8812468.
^ ^A ^b Kato A, Kawamata N, Tamayose K, Egashira M, Miura R, Fujimura T, Murayama K, Oshimi K (srpen 2002). „Starověký všudypřítomný protein 1 se váže na konzervovanou membránově-proximální sekvenci cytoplazmatického ocasu integrinových alfa podjednotek, která hraje zásadní roli při signalizaci naruby alfa IIbbeta 3“. J Biol Chem. 277 (32): 28934–41. doi:10,1074 / jbc.M204340200. PMID 12042322.
^ ^A ^b „Entrez Gene: AUP1 starověký všudypřítomný protein 1“.

externí odkazy

Člověk AUP1 umístění genomu a AUP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9Y679 (Starověký všudypřítomný protein 1) na PDBe-KB.

Další čtení

Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Karpisheva KV, Tauber B, Kisliakova TV, Dobner T (2003). „[Nový lidský buněčný protein AUP1. III. Intracelulární lokalizace proteinu AUP1 v různých lidských a krysích buněčných liniích]“. Tsitologiia. 44 (9): 846–51. PMID 12534238.
Karpisheva KV, Touber B, Kisliakova TV, Dobner T (2003). „[Nový lidský buněčný protein AUP1. II. Klonování cDNA, genomová organizace genu Aup1 a předběžná charakterizace lidského proteinu AUP1]“. Tsitologiia. 44 (9): 839–45. PMID 12534237.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115307 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068328 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8812468-5] Jang W, Weber JS, Bashir R, Bushby K, Meisler MH (leden 1997). „Aup1, nový gen na myším chromozomu 6 a lidském chromozomu 2p13“. Genomika. 36 (2): 366–8. doi:10.1006 / geno.1996.0477. PMID 8812468.

[pmid12042322-6] A ^b Kato A, Kawamata N, Tamayose K, Egashira M, Miura R, Fujimura T, Murayama K, Oshimi K (srpen 2002). „Starověký všudypřítomný protein 1 se váže na konzervovanou membránově-proximální sekvenci cytoplazmatického ocasu integrinových alfa podjednotek, která hraje zásadní roli při signalizaci naruby alfa IIbbeta 3“. J Biol Chem. 277 (32): 28934–41. doi:10,1074 / jbc.M204340200. PMID 12042322.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: AUP1 starověký všudypřítomný protein 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]