ATPC RNA motiv - ATPC RNA motif - Wikipedia

ATPC RNA motiv
	Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence ATPC
Identifikátory
Symbol	ATPC
Rfam	RF01067
Další údaje
RNA typ	Gen
Domény	Bakterie
TAK	SO: 0001263
PDB struktur	PDBe

The ATPC RNA motiv je konzervovaný RNA struktura nalezena v jistém sinice.^[1] Je zjevně všudypřítomný v Prochlorococcus marinus, a je přítomen v mnoha druzích rodu Synechococcus. RNA se vždy nachází uvnitř operon kódovací podjednotky ATP syntáza, a je vždy umístěn za genem kódujícím A podjednotku ATP syntázy a za genem kódujícím C podjednotka gen. Toto umístění je v souladu s a cis-regulační prvek, ale také s a nekódující RNA který je přepsán geny ATP syntázy.

Volají se jednoduché struktury RNA kmenové smyčky byly hlášeny u operonů ATP syntázy různých sinic,^[2] ale ne struktury, jako je 3-kmenové spojení, které je hlavním rysem motivu ATPC RNA.

Reference

^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z a kol. (2007). „Identifikace 22 kandidátských strukturovaných RNA v bakteriích pomocí komparativního genomického potrubí CMfinder“. Nucleic Acids Res. 35 (14): 4809–4819. doi:10.1093 / nar / gkm487. PMC 1950547. PMID 17621584.
^ Curtis SE (1988). "Struktura, organizace a exprese genů cyanobakteriálních ATP syntázy". Fotosyntéza. Res. 18 (1–2): 223–244. doi:10.1007 / BF00042986. PMID 24425167.

externí odkazy

Stránka pro ATPC_RNA_motif na Rfam

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z a kol. (2007). „Identifikace 22 kandidátských strukturovaných RNA v bakteriích pomocí komparativního genomického potrubí CMfinder“. Nucleic Acids Res. 35 (14): 4809–4819. doi:10.1093 / nar / gkm487. PMC 1950547. PMID 17621584.

[2] Curtis SE (1988). "Struktura, organizace a exprese genů cyanobakteriálních ATP syntázy". Fotosyntéza. Res. 18 (1–2): 223–244. doi:10.1007 / BF00042986. PMID 24425167.

[1]

[2]