ARL6IP5 - ARL6IP5

ARL6IP5
Identifikátory
Aliasy	ARL6IP5, DERP11, GTRAP3-18, JWA, PRAF3, addicsin, hp22, jmx, HSPC127, Yip6b, ribosylační faktor ADP jako protein interagující s GTPázou 6
Externí ID	OMIM: 605709 MGI: 1929501 HomoloGene: 4673 Genové karty: ARL6IP5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	69,106,092 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	97,233,315 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • buněčná membrána; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • endoplazmatické retikulum;
Biologický proces	• negativní regulace potenciálu mitochondriální membrány; • vnitřní apoptotická signální dráha v reakci na oxidační stres; • pozitivní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • Transport L-glutamátu; • pozitivní regulace stresem aktivované kaskády MAPK; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • negativní regulace transportu L-glutamátu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10550
	65106
	ENSG00000144746
	ENSMUSG00000035199
	O75915
	Q8R5J9
	NM_006407
	NM_022992
	NP_006398
	NP_075368
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

PRA1 protein rodiny 3 je protein že u lidí je kódován ARL6IP5 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Exprese tohoto genu je ovlivněna vitamin A.. Kódovaný protein tohoto genu může být spojen s cytoskelet. Podobný protein u potkanů může hrát roli v regulaci buněčné diferenciace. Krysí protein váže a inhibuje transportér glutamátu buněčné membrány EAAC1. Exprese krysího genu je upregulována kyselinou retinovou, což má za následek specifické snížení transportu glutamátu zprostředkovaného EAAC1.^[7] Narušení myšího genu vede ke zvýšenému obsahu neuronového glutathionu, neuroprotekci proti oxidačnímu stresu a lepšímu výkonu v motorickém / prostorovém učení a paměťových testech než myši divokého typu.

Interakce

ARL6IP5 bylo prokázáno komunikovat s SLC1A1.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144746 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035199 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Lin CI, Orlov I, Ruggiero AM, Dykes-Hoberg M, Lee A, Jackson M, Rothstein JD (březen 2001). „Modulace neuronového glutamátového transportéru EAAC1 interagujícím proteinem GTRAP3-18“. Příroda. 410 (6824): 84–8. doi:10.1038/35065084. PMID 11242046. S2CID 4622513.
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (listopad 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
^ ^A ^b "Entrez Gene: ARL6IP5 ADP-ribosylace podobný faktoru 6 interagující protein 5".

externí odkazy

Člověk ARL6IP5 umístění genomu a ARL6IP5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Ingley E, Williams JH, Walker CE a kol. (1999). „Nový faktor podobný ADP-ribosylaci (ARL-6) interaguje s podjednotkou kanálu SEC61beta, který vede protein“. FEBS Lett. 459 (1): 69–74. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01188-6. PMID 10508919. S2CID 30948975.
Butchbach ME, Lai L, Lin CL (2002). „Molekulární klonování, genová struktura, profil exprese a funkční charakterizace proteinu GTRAP3-18 interagujícího s myším glutamátovým transportérem (EAAT3).“ Gen. 292 (1–2): 81–90. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00669-8. PMID 12119102.
Ikemoto MJ, Inoue K, Akiduki S a kol. (2003). „Identifikace addicsinu / GTRAP3-18 jako chronického genu rozšířeného o morfin v amygdale“. NeuroReport. 13 (16): 2079–84. doi:10.1097/00001756-200211150-00018. PMID 12438930. S2CID 43751076.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Butchbach ME, Guo H, Lin CL (2003). „Methyl-beta-cyklodextrin, ale ne kyselina retinová, snižuje absorpci glutamátu zprostředkovanou EAAT3 a zvyšuje expresi GTRAP3-18“. J. Neurochem. 84 (4): 891–4. doi:10.1046 / j.1471-4159.2003.01588.x. PMID 12562531. S2CID 23283506.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Matsuda A, Suzuki Y, Honda G a kol. (2003). „Rozsáhlá identifikace a charakterizace lidských genů, které aktivují signální dráhy NF-kappaB a MAPK“. Onkogen. 22 (21): 3307–18. doi:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID 12761501.
Mao WG, Li AP, Ye J a kol. (2004). "[Vliv induktoru diferenciace a tepelného stresu na expresi proteinu JWA a Hsp70 buněk K562]". Zhonghua Lao Dong Wei Sheng Zhi Ye Bing Za Zhi. 21 (4): 253–6. PMID 14761432.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Schweneker M, Bachmann AS, Moelling K (2005). „JM4 je čtyř transmembránový protein vázající se na receptor CCR5“. FEBS Lett. 579 (7): 1751–8. doi:10.1016 / j.febslet.2005.02.037. PMID 15757671. S2CID 1173694.
Zhu T, Chen R, Li AP a kol. (2005). „Regulace nového genu spojeného s diferenciací buněk, JWA během oxidačního poškození v buňkách K562 a MCF-7“. J. Biomed. Sci. 12 (1): 219–27. doi:10.1007 / s11373-004-8186-4. PMID 15864752.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). „Signální sekvence a lapač klíčových slov in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA s oligopohraničením“. DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Huang S, Shen Q, Mao WG a kol. (2006). „JWA, nová signální molekula, která se účastní indukce diferenciace buněk lidské myeloidní leukémie“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 341 (2): 440–50. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.12.197. PMID 16430862.
Huang S, Shen Q, Mao WG a kol. (2006). „JWA, nová signální molekula, zapojená do diferenciace buněk HL-60 indukované kyselinou all-retinovou“. J. Biomed. Sci. 13 (3): 357–71. doi:10.1007 / s11373-005-9068-0. PMID 16468075.
Fo CS, Coleman CS, Wallick CJ a kol. (2006). "Genomická organizace, profil exprese a charakterizace nové rodiny proteinových PRA1 domén, člen 2 (PRAF2)". Gen. 371 (1): 154–65. doi:10.1016 / j.gene.2005.12.009. PMID 16481131.
Aoyama K, Wang F, Matsumura N a kol. (2012). "Zvýšený neuronální glutathion a neuroprotekce u GTRAP3-18-deficientních myší". Neurobiol Dis. 45 (3): 973–82. doi:10.1016 / j.nbd.2011.12.016. PMID 22210510. S2CID 22266026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144746 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035199 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11242046-5] A ^b Lin CI, Orlov I, Ruggiero AM, Dykes-Hoberg M, Lee A, Jackson M, Rothstein JD (březen 2001). „Modulace neuronového glutamátového transportéru EAAC1 interagujícím proteinem GTRAP3-18“. Příroda. 410 (6824): 84–8. doi:10.1038/35065084. PMID 11242046. S2CID 4622513.

[pmid11042152-6] Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (listopad 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: ARL6IP5 ADP-ribosylace podobný faktoru 6 interagující protein 5".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]