ARID4B - ARID4B

ARID4B
Identifikátory
Aliasy	ARID4B, BCAA, BRCAA1, RBBP1L1, RBP1L1, SAP180, interakční doména bohatá na AT 4B
Externí ID	OMIM: 609696 MGI: 2137512 HomoloGene: 12847 Genové karty: ARID4B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	235,328,219 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	14,199,603 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita histon-deacetylázy; • molekulární funkce; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • buněčná složka;
Biologický proces	• regulace genové exprese pomocí genetického otisku; • regulace transkripce, DNA-šablony; • vytvoření buněčné bariéry Sertoli; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • trimethylace histonu H4-K20; • transkripce, chráněná DNA; • trimethylace histonu H3-K9; • spermatogeneze; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • histonová deacetylace; • biologický proces; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51742
	94246
	ENSG00000054267
	ENSMUSG00000039219
	Q4LE39
	A2CG63
	NM_001206794; NM_016374; NM_031371
	NM_194262; NM_198122
	NP_001193723; NP_057458; NP_112739
	NP_919238; NP_937755
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interaktivní protein s obsahem bohaté na AT 4B je protein že u lidí je kódován ARID4B gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje protein se sekvenční podobností s retinoblastom -vázací protein-1. Kódovaný protein je podjednotkou histon deacetyláza -závislý SIN3A transkripční corepressor komplex, který funguje v různých buněčných procesech včetně proliferace, diferenciace, apoptóza, onkogeneze, a stanovení osudu buňky. Genový produkt rozpoznává IgG protilátka izolovaný od a rakovina prsu pacient a zdá se, že je molekulární marker spojené s širokou škálou lidských malignit. Alternativní transkripce spojit varianty kódování různé izoformy byly charakterizovány.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000054267 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039219 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cao J, Gao T, Stanbridge EJ, Irie R (srpen 2001). „RBP1L1, gen vázající se na protein vázající na retinoblastom kódující antigenní epitop hojně exprimovaný v lidských karcinomech a normálních varlatech“. J Natl Cancer Inst. 93 (15): 1159–65. doi:10.1093 / jnci / 93.15.1159. PMID 11481388.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARID4B AT bohatá interaktivní doména 4B (podobná RBP1)“.

externí odkazy

Člověk ARID4B umístění genomu a ARID4B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298.
Bommel H, Xie G, Rossoll W, Wiese S, Jablonka S, Boehm T, Sendtner M (2003). „Missense mutace v tubulinově specifickém genu chaperonu E (Tbce) v myší mutantní progresivní motorické neuronopatii, model lidské motoneuronové choroby“. J. Cell Biol. 159 (4): 563–9. doi:10.1083 / jcb.200208001. PMC 2173089. PMID 12446740.
Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (2003). „Identifikace a charakterizace tří nových komponent komplexu mSin3A corepressor“. Mol. Buňka. Biol. 23 (10): 3456–67. doi:10.1128 / MCB.23.10.3456-3467.2003. PMC 164750. PMID 12724404.
Cui D, Jin G, Gao T, Sun T, Tian F, Estrada GG, Gao H, Sarai A (2004). "Charakterizace BRCAA1 a její nová identifikace epitopu antigenu". Cancer Epidemiol. Biomarkery Předchozí. 13 (7): 1136–45. PMID 15247124.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000054267 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039219 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11481388-5] Cao J, Gao T, Stanbridge EJ, Irie R (srpen 2001). „RBP1L1, gen vázající se na protein vázající na retinoblastom kódující antigenní epitop hojně exprimovaný v lidských karcinomech a normálních varlatech“. J Natl Cancer Inst. 93 (15): 1159–65. doi:10.1093 / jnci / 93.15.1159. PMID 11481388.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ARID4B AT bohatá interaktivní doména 4B (podobná RBP1)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]