AFF3 - AFF3

AFF3
Identifikátory
Aliasy	AFF3, Člen rodiny LAF4, MLLT2, AF4 / FMR2 3
Externí ID	OMIM: 601464 MGI: 106927 HomoloGene: 1718 Genové karty: AFF3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	100,192,428 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	38,664,955 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • dvouřetězcová vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderné těleso; • komplex faktoru prodloužení transkripce; • Komplex ELL-EAF;
Biologický proces	• reakce na faktor nekrózy nádoru; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • embryonální morfogeneze zadní končetiny;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3899
	16764
	ENSG00000144218
	ENSMUSG00000037138
	P51826
	P51827
	NM_001025108; NM_002285
	NM_001290814; NM_010678
	NP_001020279; NP_002276
	NP_001277743
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Člen rodiny AF4 / FMR2 3 je protein že u lidí je kódován AFF3 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje tkáňově omezené jádro transkripční aktivátor to je přednostně vyjádřeno v lymfoidní tkáň. Izolace tohoto proteinu zpočátku definovala vysoce konzervovanou nukleovou rodinu genů LAF4 / MLLT2 transkripční faktory které mohou fungovat při vývoji lymfoidů a onkogeneze. V některých VŠECHNO u pacientů byl tento gen shledán fúzovaným s genem pro MLL. Pro tento gen bylo nalezeno několik alternativně sestřižených variant transkriptu, které kódují různé proteiny.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144218 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037138 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Liao X, Ma C, Trask B, Massa H, Gilbert DJ, Staudt LM, Jenkins NA, Copeland NG (červen 1996). „LAF4 se mapuje na myší chromozom 1 a lidský chromozom 2q11.2-q12“. Savčí genom. 7 (6): 467–8. doi:10,1007 / s003359900137. PMID 8662235. S2CID 1525532.
^ Ma C, Staudt LM (leden 1996). „LAF-4 kóduje lymfoidní jaderný protein s transaktivačním potenciálem, který je homologní s AF-4, genem fúzovaným s MLL v leukemiích t (4; 11)“. Krev. 87 (2): 734–45. doi:10.1182 / krev.V87.2.734.bloodjournal872734. PMID 8555498.
^ ^A ^b „Entrez Gene: rodina AFF3 AF4 / FMR2, člen 3“.

externí odkazy

Člověk AFF3 umístění genomu a AFF3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
von Bergh AR, Beverloo HB, Rombout P, van Wering ER, van Weel MH, Beverstock GC, Kluin PM, Slater RM, Schuuring E (září 2002). „LAF4, gen související s AF4, je fúzován s MLL u kojenecké akutní lymfoblastické leukémie“. Geny, chromozomy a rakovina. 35 (1): 92–6. doi:10,1002 / gcc.10091. PMID 12203795. S2CID 20750925.
Hiwatari M, Taki T, Taketani T, Taniwaki M, Sugita K, Okuya M, Eguchi M, Ida K, Hayashi Y (květen 2003). „Fúze genu souvisejícího s AF4, LAF4, na MLL v dětské akutní lymfoblastické leukémii s t (2; 11) (q11; q23)“. Onkogen. 22 (18): 2851–5. doi:10.1038 / sj.onc.1206389. PMID 12743608.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
MD, Faseruk SA, Gokgoz N, Pinnaduwage D, Done SJ, Andrulis IL (červenec 2005). „LAF-4 je aberantně exprimován v lidské rakovině prsu“. International Journal of Cancer. 115 (4): 568–74. doi:10.1002 / ijc.20881. PMID 15704140. S2CID 11311219.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144218 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037138 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8662235-5] Liao X, Ma C, Trask B, Massa H, Gilbert DJ, Staudt LM, Jenkins NA, Copeland NG (červen 1996). „LAF4 se mapuje na myší chromozom 1 a lidský chromozom 2q11.2-q12“. Savčí genom. 7 (6): 467–8. doi:10,1007 / s003359900137. PMID 8662235. S2CID 1525532.

[pmid8555498-6] Ma C, Staudt LM (leden 1996). „LAF-4 kóduje lymfoidní jaderný protein s transaktivačním potenciálem, který je homologní s AF-4, genem fúzovaným s MLL v leukemiích t (4; 11)“. Krev. 87 (2): 734–45. doi:10.1182 / krev.V87.2.734.bloodjournal872734. PMID 8555498.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: rodina AFF3 AF4 / FMR2, člen 3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]