ACSS2 - ACSS2

ACSS2
Identifikátory
Aliasy	ACSS2, ACAS2, ACS, ACSA, dJ1161H23.1, člen rodiny s krátkým řetězcem acyl-CoA syntetázy 2, acetyl-koenzym A syntetáza 2, acetyl-koenzym A syntetáza, cytoplazmatická, ACECS1, ACECS
Externí ID	OMIM: 605832 MGI: 1890410 HomoloGene: 6469 Genové karty: ACSS2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	34,927,962 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	155,585,724 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • ligázová aktivita; • Vazba AMP; • katalytická aktivita; • ATP vazba; • aktivita acetát-CoA ligázy;
Buněčná složka	• intracelulární membránou vázaná organela; • nukleoplazma; • cytoplazma; • cytosol; • mitochondriální matice;
Biologický proces	• metabolismus; • proces biosyntézy lipidů; • acetyl-CoA biosyntetický proces z acetátu; • proces biosyntézy acetyl-CoA; • octanový biosyntetický proces; • proces biosyntézy propionátu; • oxidace ethanolu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55902
	60525
	ENSG00000131069
	ENSMUSG00000027605
	Q9NR19
	Q9QXG4
	NM_001076552; NM_001242393; NM_018677; NM_139274
	NM_019811
	NP_001070020; NP_001229322; NP_061147
	NP_062785
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Člen rodiny acyl-koenzymu A syntetázy s krátkým řetězcem 2 je enzym že v lidé je kódován ACSS2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje a cytosolický enzym který katalyzuje aktivaci acetát pro použití v syntéza lipidů a energie generace. Protein působí jako a monomer a vyrábí acetyl -CoA z acetátu v reakci, která vyžaduje ATP. Je také nezbytný pro produkci Crotonyl-CoA, který aktivuje své cílové geny krotonylací histonových ocasů. Exprese tohoto genu je regulována pomocí sterol regulační prvky vázající proteiny, transkripční faktory, které aktivují geny potřebné pro syntézu cholesterol a nenasycené mastné kyseliny. Dvě varianty přepisu kódující různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.^[6]

Metabolická produkce acetyl-CoA souvisí s acetylací histonů a regulací genů. V myších neuronech Mews et al.^[7] identifikoval hlavní roli pro cestu ACSS2 při regulaci acetylace histonu a expresi neuronových genů. Acetylace histonu ve zralých neuronech je silně spojena s tvorbou paměti. Chromatin se acetyluje ve specifických oblastech mozku, jako je hipokampus, v reakci na neuronální aktivitu nebo trénink chování u hlodavců.^[8] Taková acetylace koreluje se zvýšenou expresí souboru „okamžitých časných“ genů,^[9] které kódují proteiny, které široce zprostředkovávají změny v síle spojení mezi neurony, a tím usnadňují konsolidaci paměti.^[10] V myším hipokampu se ACSS2 váže přímo na okamžité rané geny, aby „poháněl“ lokální acetylaci histonů a následně jejich indukci pro dlouhodobou prostorovou paměť.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131069 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027605 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Luong A, Hannah VC, Brown MS, Goldstein JL (srpen 2000). „Molekulární charakterizace lidské acetyl-CoA syntetázy, enzymu regulovaného proteiny vázajícími regulační prvek na sterol“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (34): 26458–66. doi:10,1074 / jbc.M004160200. PMID 10843999.
^ ^A ^b „Entrez Gene: člen rodiny ACSS2 acyl-CoA syntetázy s krátkým řetězcem 2“.
^ Mews P, Donahue G, Drake AM, Luczak V, Abel T, Berger SL (květen 2017). „Acetyl-CoA syntetáza reguluje acetylaci histonů a hipokampální paměť“. Příroda. 546 (7658): 381–386. Bibcode:2017Natur.546..381M. doi:10.1038 / příroda22405. PMC 5505514. PMID 28562591.
^ Schmitt M, Matthies H (1979). „[Biochemické studie na histonech centrálního nervového systému. III. Začlenění [14C] -acetátu do histonů různých oblastí mozku potkana během pokusu o učení]“. Acta Biologica et Medica Germanica. 38 (4): 683–9. PMID 525146.
^ Peixoto L, Abel T (leden 2013). „Role acetylace histonů při formování paměti a kognitivních poruchách“. Neuropsychofarmakologie. 38 (1): 62–76. doi:10.1038 / npp.2012.86. PMC 3521994. PMID 22669172.
^ West AE, Greenberg ME (červen 2011). "Neuronální aktivita regulovaná transkripce genu ve vývoji synapsí a kognitivních funkcích". Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 3 (6): a005744. doi:10.1101 / cshperspect.a005744. PMC 3098681. PMID 21555405.

11. Sabari BR, Tang Z, Huang H, Yong-Gonzalez V, Molina H, Kong HE, Dai L, Shimada M, Cross JR, Zhao Y, Roeder RG, Allis CD (2015). Intracelulární krotonyl-CoA stimuluje transkripci prostřednictvím p300-katalyzované histonové krotonylace. Mol Cell. 58 (2): 203-15

externí odkazy

Člověk ACSS2 umístění genomu a ACSS2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131069 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027605 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10843999-5] Luong A, Hannah VC, Brown MS, Goldstein JL (srpen 2000). „Molekulární charakterizace lidské acetyl-CoA syntetázy, enzymu regulovaného proteiny vázajícími regulační prvek na sterol“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (34): 26458–66. doi:10,1074 / jbc.M004160200. PMID 10843999.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: člen rodiny ACSS2 acyl-CoA syntetázy s krátkým řetězcem 2“.

[Mews_2017-7] Mews P, Donahue G, Drake AM, Luczak V, Abel T, Berger SL (květen 2017). „Acetyl-CoA syntetáza reguluje acetylaci histonů a hipokampální paměť“. Příroda. 546 (7658): 381–386. Bibcode:2017Natur.546..381M. doi:10.1038 / příroda22405. PMC 5505514. PMID 28562591.

[8] Schmitt M, Matthies H (1979). „[Biochemické studie na histonech centrálního nervového systému. III. Začlenění [14C] -acetátu do histonů různých oblastí mozku potkana během pokusu o učení]“. Acta Biologica et Medica Germanica. 38 (4): 683–9. PMID 525146.

[9] Peixoto L, Abel T (leden 2013). „Role acetylace histonů při formování paměti a kognitivních poruchách“. Neuropsychofarmakologie. 38 (1): 62–76. doi:10.1038 / npp.2012.86. PMC 3521994. PMID 22669172.

[10] West AE, Greenberg ME (červen 2011). "Neuronální aktivita regulovaná transkripce genu ve vývoji synapsí a kognitivních funkcích". Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 3 (6): a005744. doi:10.1101 / cshperspect.a005744. PMC 3098681. PMID 21555405.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]