ZGPAT - ZGPAT

ZGPAT
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4II1
Identifikátory
Aliasy	ZGPAT, GPATC6, GPATCH6, KIAA1847, ZC3H9, ZC3HDC9, ZIP, obsahující typ CCCH se zinkovým prstem a doména G-patch
Externí ID	MGI: 2449939 HomoloGene: 41874 Genové karty: ZGPAT
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	63,736,142 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	181,383,628 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • buněčná membrána;
Biologický proces	• negativní regulace aktivity receptoru aktivovaného epidermálním růstovým faktorem; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84619
	229007
	ENSG00000197114
	ENSMUSG00000027582
	Q8N5A5
	Q8VDM1
NM_181485; NM_001083113; NM_001195653; NM_001195654; NM_032527;
	NM_181484
	NM_001048148; NM_144894
	NP_001076582; NP_001182582; NP_001182583; NP_115916; NP_852150
	NP_001041613; NP_659143
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CCCH typu se zinkovým prstem s proteinem obsahujícím G patch doménu je protein že u lidí je kódován ZGPAT gen.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197114 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027582 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ordway JM, Bedell JA, Citek RW, Nunberg A, Garrido A, Kendall R, Stevens JR, Cao D, Doerge RW, Korshunova Y, Holemon H, McPherson JD, Lakey N, Leon J, Martienssen RA, Jeddeloh JA (listopad 2006 ). „Komplexní profilování methylace DNA v genomu lidské rakoviny identifikuje nové epigenetické cíle“. Karcinogeneze. 27 (12): 2409–23. doi:10.1093 / carcin / bgl161. PMID 16952911.
^ „Entrez Gene: ZGPAT zinkový prst, typ CCCH s G patch doménou“.

Další čtení

Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Rual JF, Hirozane-Kishikawa T, Hao T a kol. (2004). „Human ORFeome verze 1.1: Platforma pro reverzní proteomiku“. Genome Res. 14 (10B): 2128–35. doi:10,1101 / gr. 2973604. PMC 528929. PMID 15489335.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Nagase T, Nakayama M, Nakajima D a kol. (2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 8 (2): 85–95. doi:10.1093 / dnares / 8.2.85. PMID 11347906.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197114 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027582 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid16952911-5] Ordway JM, Bedell JA, Citek RW, Nunberg A, Garrido A, Kendall R, Stevens JR, Cao D, Doerge RW, Korshunova Y, Holemon H, McPherson JD, Lakey N, Leon J, Martienssen RA, Jeddeloh JA (listopad 2006 ). „Komplexní profilování methylace DNA v genomu lidské rakoviny identifikuje nové epigenetické cíle“. Karcinogeneze. 27 (12): 2409–23. doi:10.1093 / carcin / bgl161. PMID 16952911.

[entrez-6] „Entrez Gene: ZGPAT zinkový prst, typ CCCH s G patch doménou“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]