ZC3HAV1 - ZC3HAV1

ZC3HAV1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2X5Y, 4X52
Identifikátory
Aliasy	ZC3HAV1, ARTD13, FLB6421, PARP13, ZAP, ZC3H2, ZC3HDC2, s obsahem zinkového prstu typu CCCH, antivirotikum 1
Externí ID	OMIM: 607312 MGI: 1926031 HomoloGene: 10585 Genové karty: ZC3HAV1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	139,109,720 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	38,354,603 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • kadherinová vazba; • Aktivita NAD + ADP-ribosyltransferázy; • Vazba NAD +; • aktivita proteinu ADP-ribosylázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• pozitivní regulace produkce interferonu-alfa; • proces imunitního systému; • reakce na virus; • pozitivní regulace katabolického procesu mRNA; • negativní regulace replikace virového genomu; • pozitivní regulace signální dráhy RIG-I; • obranná reakce na virus; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • vrozený imunitní systém; • pozitivní regulace produkce interferonu-beta; • proteinová poly-ADP-ribosylace; • proteinová ADP-ribosylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56829
	78781
	ENSG00000105939
	ENSMUSG00000029826
	Q7Z2W4
	Q3UPF5
	NM_020119; NM_024625; NM_001363491
	NM_028421; NM_028864; NM_001347122
	NP_064504; NP_078901; NP_001350420
	NP_001334051; NP_082697; NP_083140
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Antivirový protein typu CCCH se zinkovým prstem 1 je protein že u lidí je kódován ZC3HAV1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje typ CCCH zinkový prst protein, o kterém se předpokládá, že brání infekci retroviry. Studie krysího homologu naznačují, že protein může primárně fungovat tak, že inhibuje expresi virového genu a indukuje vrozenou imunitu proti virové infekci. Na tomto místě se vyskytuje alternativní sestřih a jsou popsány dvě varianty, každá kódující odlišné izoformy.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105939 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029826 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gao G, Guo X, Goff SP (září 2002). „Inhibice produkce retrovirové RNA pomocí ZAP, proteinu se zinkovým prstem typu CCCH“. Věda. 297 (5587): 1703–6. doi:10.1126 / science.1074276. PMID 12215647. S2CID 42188205.
^ Katoh M, Katoh M (červenec 2003). "Identifikace a charakterizace lidského genu TIPARP v amplifikaci CCNL na lidském chromozomu 3q25.31". Int J Oncol. 23 (2): 541–7. doi:10,3892 / ijo.23.2.541. PMID 12851707.
^ ^A ^b "Entrez Gene: ZC3HAV1 zinkový prst typu CCCH, antivirový 1".

Další čtení

Yu Y, Zhang C, Zhou G a kol. (2001). „Profilování genové exprese v játrech lidského plodu a identifikace genů specifických pro tkáň a vývojovou fázi prostřednictvím kompilovaných profilů exprese a účinného klonování cDNA v plné délce“. Genome Res. 11 (8): 1392–403. doi:10,1101 / gr.175501. PMC 311073. PMID 11483580.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Bick MJ, Carroll JW, Gao G a kol. (2003). „Exprese antivirového proteinu se zinkovým prstem inhibuje replikaci alfaviru“. J. Virol. 77 (21): 11555–62. doi:10.1128 / JVI.77.21.11555-11562.2003. PMC 229374. PMID 14557641.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
MacDonald MR, Machlin ES, Albin OR, Levy DE (2007). „Antivirový protein se zinkovým prstem působí synergicky s faktorem indukovaným interferonem pro maximální aktivitu proti alfavirům“. J. Virol. 81 (24): 13509–18. doi:10.1128 / JVI.00402-07. PMC 2168828. PMID 17928353.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105939 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029826 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12215647-5] Gao G, Guo X, Goff SP (září 2002). „Inhibice produkce retrovirové RNA pomocí ZAP, proteinu se zinkovým prstem typu CCCH“. Věda. 297 (5587): 1703–6. doi:10.1126 / science.1074276. PMID 12215647. S2CID 42188205.

[pmid12851707-6] Katoh M, Katoh M (červenec 2003). "Identifikace a charakterizace lidského genu TIPARP v amplifikaci CCNL na lidském chromozomu 3q25.31". Int J Oncol. 23 (2): 541–7. doi:10,3892 / ijo.23.2.541. PMID 12851707.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: ZC3HAV1 zinkový prst typu CCCH, antivirový 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]