Yaniv Erlich - Yaniv Erlich

Yaniv Erlich
יניב ארליך
Alma materWatsonova škola biologických věd
Vědecká kariéra
PoleGenomika, Bioinformatika, Genetické soukromí, Crowdsourcing,
InstituceColumbia University
Doktorský poradceGreg Hannon
webová stránkahttps://teamerlich.org/

Yaniv Erlich je Izraelsko-americký vědec. Je docentem Počítačová věda na Columbia University a vedoucí vědecký pracovník Mé dědictví.[1] Erlichova práce se spojuje počítačová věda a genomika.

Životopis

Erlich se narodil v Izrael. V roce 2006 získal titul BSc v Brain Sciences od Tel Avivská univerzita a doktorát z bioinformatiky v roce 2010 od Watsonova škola biologických věd na Cold Spring Harbor Laboratory. Od roku 2010 do roku 2015 byl Erlich Fellow na Whitehead Institute, MIT. Od roku 2015 vede laboratoř v Columbia University ve výpočetní genomice [2]

Vědecká práce

Davové získávání genomových informací

Erlichův tým zveřejnil studii v časopise Věda který hlásil získávání davů desítek milionů genealogických záznamů z webu Geni.com.[3] Tým dokázal vytvořit jediný rodokmen 13 milionů lidí, kteří jsou všichni propojeni a pokrývají desítky generací a více než 600 let historie.[4] Studie použila data k analýze genetiky dlouhověkosti a familiárního rozptylu[5]

V jiné linii studií Erlich a Joe Pickrell dát dohromady web s názvem DNA. Přistoupit k hromadnému získávání genomových datových souborů účastníků spotřebitelské genomiky.[6] Web do listopadu 2018 shromáždil více než 130 000 datových souborů.

Genetické soukromí

Skupina Erlich zveřejnila několik studií na toto téma genetické soukromí. V roce 2013 ohlásili možnost získat zpět příjmení muže z jeho údajně anonymního genomického souboru dat, což může vést k dohledání jeho úplné identity.[7] Tato technika využívá společné dědictví příjmení a Y-chromozomů ve většině společností. Tedy porovnáním Y-chromozom zájemce o genetické genealogické databáze Y-chromozomů je možné v některých případech odvodit příjmení. Tým odhadl, že 12% mužů v USA podléhá úspěšnému obnovení příjmení. Tým také prokázal, že po obnovení příjmení mohou základní demografické identifikátory, jako je věk a stav pobytu, umožnit zpětné vysledování identity jednotlivce. Aby demonstrovali sílu techniky, obnoví identitu více než 1000 genomů podle odvození příjmení.

V roce 2014 Erlich a Arvind Narayanan zveřejnil průzkum hackerských technik do genomických datových sad.[8] Předpovídali, že autosomální vyhledávání GEDmatch lze použít ke zpětnému sledování identity anonymních lidí, jakmile uživatelská základna GEDmatch dosáhne určité velikosti, což se skutečně stalo v roce 2018, kdy web používal k zachycení Golden State Killer.

V roce 2018 publikoval tým Erlich ve Vědě studii, která uvádí, že přibližně 60% amerických jedinců evropského původu má v GEDmatch alespoň třetí zápas bratranců, což může teoreticky umožnit jejich identifikaci.[9] Za dva až tři roky lze pomocí této techniky teoreticky dohledat prakticky jakoukoli osobu v této etnické skupině, pokud bude pokračovat současná míra růstu v GEDmatch.[10] Tým navrhl techniku ​​kryptografického podpisu, aby se snížila pravděpodobnost zneužití přímo na spotřebitelské weby policejními prohlídkami.

Reference

  1. ^ „Web laboratoře Erlich“.
  2. ^ „Reproduktory TEDxDanubia“.
  3. ^ „Kvantitativní analýza populačních rodokmenů s miliony příbuzných“.
  4. ^ „Crowdsourcing 600 let lidské historie“.
  5. ^ „WSJ“.
  6. ^ „DNA.Land je rámec pro sběr genomů a jevů v éře bohaté genetické informace“.
  7. ^ „Identifikace osobních genomů podle odvození příjmení“.
  8. ^ „Trasy pro narušení a ochranu genetického soukromí“.
  9. ^ „Identifikace inference genomových dat pomocí familiárního vyhledávání na velké vzdálenosti“.
  10. ^ „DNA většiny bílých Američanů může být identifikována prostřednictvím genealogických databází“.