YTHDF2 - YTHDF2 - Wikipedia

YTHDF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4RDN, 4RDO, 4WQN
Identifikátory
Aliasy	YTHDF2, HGRG8, NY-REN-2, CAHL, YTH N6-methyladenosin RNA vázající protein 2
Externí ID	OMIM: 610640 MGI: 2444233 HomoloGene: 32302 Genové karty: YTHDF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	28,769,775 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	132,212,303 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba RNA na N6-methyladenosin; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytosol; • P-tělo; • buněčné jádro; • cytoplazma; • organizační centrum mikrotubulů; • cytoplazmatická ribonukleoproteinová granule;
Biologický proces	• humorální imunitní odpověď; • pozitivní regulace iniciace translace nezávislé na víčku; • regulace stability mRNA; • embryonální morfogeneze; • Destabilizace mRNA; • zrání oocytů; • negativní regulace signální dráhy Notch; • endoteliální na hemopoetický přechod; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk; • regulace procesu meiotického buněčného cyklu podílejícího se na zrání oocytů; • diferenciace buněk; • oogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51441
	213541
	ENSG00000198492
	ENSMUSG00000040025
	Q9Y5A9
	Q91YT7
	NM_016258; NM_001172828; NM_001173128
	NM_145393
	NP_001166299; NP_001166599; NP_057342
	NP_663368
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

YTH protein vázající N6-methyladenosin RNA 2 je protein že u lidí je kódován YTHDF2 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje člena YTH (YT521-B homologie) nadrodiny obsahující YTH doménu. YTH doména je typická pro eukaryoty a je zvláště hojná v rostlinách. YTH doména je obvykle umístěna uprostřed proteinové sekvence a může fungovat ve vazbě na RNA. Kromě YTH domény má tento protein oblast bohatou na prolin, která může být zapojena do signální transdukce. V jednom z intronů tohoto genu byla identifikována doména bohatá na Alu, o které se předpokládá, že je spojena s lidskou dlouhověkostí. U pacientů s akutní myeloidní leukemií byla také pozorována vzájemná translokace mezi tímto genem a genem Runx1 (AML1) na chromozomu 21. Tento gen byl původně mapován na chromozom 14, který se později ukázal jako pseudogen. Alternativně byly v tomto genu identifikovány sestřižené varianty transkriptu kódující různé izoformy. [poskytl RefSeq, říjen 2012].

Viz také

N⁶-Metyladenosin

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198492 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040025 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: YTH N6-methyladenosin RNA binding protein 2“. Citováno 2017-12-24.

Další čtení

Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999). „Antigeny rozpoznávané autologními protilátkami u pacientů s karcinomem z renálních buněk“. Int. J. Cancer. 83 (4): 456–64. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID 10508479.
Cardelli M, Marchegiani F, Cavallone L, Olivieri F, Giovagnetti S, Mugianesi E, Moresi R, Lisa R, Franceschi C (2006). „Polymorfismus genu YTHDF2 (1p35) lokalizovaného v genomové doméně bohaté na Alu je spojen s lidskou dlouhověkostí“. J. Gerontol. Biol. Sci. Med. Sci. 61 (6): 547–56. doi:10.1093 / gerona / 61.6.547. PMID 16799135.
Cardelli M, Marchegiani F, Cavallone L, Olivieri F, Giovagnetti S, Mugianesi E, Moresi R, Lisa R, Franceschi C (2006). „Polymorfismus genu YTHDF2 (1p35) lokalizovaného v genomové doméně bohaté na Alu je spojen s lidskou dlouhověkostí“. J. Gerontol. Biol. Sci. Med. Sci. 61 (6): 547–56. doi:10.1093 / gerona / 61.6.547. PMID 16799135.
Wang X, Lu Z, Gomez A, Hon GC, Yue Y, Han D, Fu Y, Parisien M, Dai Q, Jia G, Ren B, Pan T, He C (2014). „N6-methyladenosin-dependentní regulace stability messengerové RNA“. Příroda. 505 (7481): 117–20. doi:10.1038 / příroda12730. PMC 3877715. PMID 24284625.
Li F, Zhao D, Wu J, Shi Y (2014). „Struktura YTH domény lidského YTHDF2 v komplexu s m (6) mononukleotidem odhaluje aromatickou klec pro rozpoznávání m (6) A“. Cell Res. 24 (12): 1490–2. doi:10.1038 / cr.2014.153. PMC 4260351. PMID 25412658.
Zhu T, Roundtree IA, Wang P, Wang X, Wang L, Sun C, Tian Y, Li J, He C, Xu Y (2014). „Krystalová struktura YTH domény YTHDF2 odhaluje mechanismus pro rozpoznávání N6-methyladenosinu“. Cell Res. 24 (12): 1493–6. doi:10.1038 / cr.2014.152. PMC 4260350. PMID 25412661.
Xu C, Liu K, Ahmed H, Loppnau P, Schapira M, Min J (2015). „Strukturální základ pro diskriminační rozpoznávání RNA N6-methyladenosinu lidskou doménovou rodinou proteinů YT521-B“. J. Biol. Chem. 290 (41): 24902–13. doi:10,1074 / jbc.M115,680389. PMC 4598999. PMID 26318451.
Tirumuru N, Zhao BS, Lu W, Lu Z, He C, Wu L (2016). „N (6) -methyladenosin HIV-1 RNA reguluje virovou infekci a expresi HIV-1 Gag proteinu“. eLife. 5. doi:10,7554 / eLife.15528. PMC 4961459. PMID 27371828.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198492 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040025 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: YTH N6-methyladenosin RNA binding protein 2“. Citováno 2017-12-24.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]