YKT6 - YKT6

YKT6
Identifikátory
Aliasy	YKT6Homolog YKT6 v-SNARE
Externí ID	OMIM: 606209 MGI: 1927550 HomoloGene: 4778 Genové karty: YKT6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	44,214,294 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	5,967,780 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita proteinu-cysteinu S-palmitoyltransferázy; • aktivita transferázy; • Aktivita SNAP receptoru; • Vazba SNARE; • kadherinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • endozom; • Golgiho aparát; • membrána; • Golgiho membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • bazilární dendrit; • transportní váček; • tělo neuronových buněk; • Komplex SNARE; • endoplazmatické retikulum; • mitochondrie; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • endoplazmatické retikulum - Golgiho meziprostorová membrána; • cytoplazmatický váček; • apikální dendrit; • cytosol;
Biologický proces	• cílení vezikul; • dokování vezikul zapojené do exocytózy; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • retrográdní transport, endosom do Golgi; • transport bílkovin; • fúze vezikul; • transport zprostředkovaný vezikuly; • Fúze lipidové dvojvrstvy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10652
	56418
	ENSG00000106636
	ENSMUSG00000002741
	O15498
	Q9CQW1
	NM_006555; NM_001363678
	NM_019661
	NP_006546; NP_001350607; NP_006546.1
	NP_062635
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Synaptobrevinový homolog YKT6 je protein že u lidí je kódován YKT6 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento genový produkt je jednou z rozpoznávacích molekul SNARE zapojených do vezikulárního transportu mezi sekrečními oddíly. Jedná se o membránový asociovaný isoprenylovaný protein, který funguje v transportním kroku endoplazmatického retikula-Golgi. Tento protein je vysoce konzervovaný z kvasinek na člověka a může funkčně doplňovat ztrátu kvasinkového homologu v sekreční dráze kvasinek.^[7]

Interakce

YKT6 bylo prokázáno komunikovat s BET1L.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106636 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002741 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Veit M (prosinec 2004). „Lidský protein SNARE Ykt6 zprostředkovává svou vlastní palmitoylaci na C-koncových cysteinových zbytcích“. The Biochemical Journal. 384 (Pt 2): 233–7. doi:10.1042 / BJ20041474. PMC 1134105. PMID 15479160.
^ Rossi V, Banfield DK, Vacca M, Dietrich LE, Ungermann C, D'Esposito M, Galli T, Filippini F (prosinec 2004). "Longins a jejich domény longin: regulované SNARE a multifunkční regulátory SNARE". Trendy v biochemických vědách. 29 (12): 682–8. doi:10.1016 / j.tibs.2004.10.002. PMID 15544955.
^ ^A ^b „Entrez Gene: YKT6 YKT6 v-SNARE homolog (S. cerevisiae)“.
^ Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (duben 2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". The Journal of Cell Biology. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.
^ Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (říjen 2002). „GS15 tvoří komplex SNARE se syntaxinem 5, GS28 a Ykt6 a je zapojen do provozu v raných cisternach Golgiho aparátu“ (PDF). Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3493–507. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
McNew JA, Sogaard M, Lampen NM, Machida S, Ye RR, Lacomis L, Tempst P, Rothman JE, Söllner TH (červenec 1997). „Ykt6p, prenylovaný SNARE nezbytný pro transport endoplazmatického retikula-Golgiho“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (28): 17776–83. doi:10.1074 / jbc.272.28.17776. PMID 9211930.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Tochio H, Tsui MM, Banfield DK, Zhang M (červenec 2001). "Autoinhibiční mechanismus pro nesyntaxinové SNARE proteiny odhalený strukturou Ykt6p". Věda. 293 (5530): 698–702. doi:10.1126 / science.1062950. PMID 11474112. S2CID 13618305.
Honer WG, Falkai P, Bayer TA, Xie J, Hu L, Li HY, Arango V, Mann JJ, Dwork AJ, Trimble WS (duben 2002). „Abnormality proteinů mechanismu SNARE v přední frontální kůře u těžkých duševních chorob“. Mozková kůra. 12 (4): 349–56. doi:10.1093 / cercor / 12.4.349. PMID 11884350.
Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (duben 2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". The Journal of Cell Biology. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.
Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (říjen 2002). „GS15 tvoří komplex SNARE se syntaxinem 5, GS28 a Ykt6 a je zapojen do provozu v raných cisternach Golgiho aparátu“ (PDF). Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3493–507. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.
Puri N, Kruhlak MJ, Whiteheart SW, Roche PA (listopad 2003). „Degranulace mastocytů vyžaduje demontáž SNARE faktorem citlivým na N-ethylmaleimid“. Journal of Immunology. 171 (10): 5345–52. doi:10,4049 / jimmunol.171.10.5345. PMID 14607937.
Fukasawa M, Varlamov O, Eng WS, Söllner TH, Rothman JE (duben 2004). „Lokalizace a aktivita SNARE Ykt6 určená její regulační doménou a palmitoylací“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (14): 4815–20. doi:10.1073 / pnas.0401183101. PMC 387331. PMID 15044687.
Tai G, Lu L, Wang TL, Tang BL, Goud B, Johannes L, Hong W (září 2004). „Účast komplexu syntaxinu 5 / Ykt6 / GS28 / GS15 SNARE na transportu z raného / recyklačního endosomu do trans-Golgiho sítě“. Molekulární biologie buňky. 15 (9): 4011–22. doi:10,1091 / mbc.E03-12-0876. PMC 515336. PMID 15215310.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Okumura AJ, Hatsuzawa K, Tamura T, Nagaya H, Saeki K, Okumura F, Nagao K, Nishikawa M, Yoshimura A, Wada I (únor 2006). „Zapojení nového Q-SNARE, D12, do kontroly kvality endomembránového systému“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (7): 4495–506. doi:10,1074 / jbc.M509715200. PMID 16354670.
Ooe A, Kato K, Noguchi S (březen 2007). „Možné zapojení genů CCT5, RGS3 a YKT6 up-regulováno v nádorech s mutací p53 v rezistenci na docetaxel u lidských nádorů prsu“. Výzkum a léčba rakoviny prsu. 101 (3): 305–15. doi:10.1007 / s10549-006-9293-x. PMID 16821082. S2CID 2398124.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106636 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002741 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15479160-5] Veit M (prosinec 2004). „Lidský protein SNARE Ykt6 zprostředkovává svou vlastní palmitoylaci na C-koncových cysteinových zbytcích“. The Biochemical Journal. 384 (Pt 2): 233–7. doi:10.1042 / BJ20041474. PMC 1134105. PMID 15479160.

[pmid15544955-6] Rossi V, Banfield DK, Vacca M, Dietrich LE, Ungermann C, D'Esposito M, Galli T, Filippini F (prosinec 2004). "Longins a jejich domény longin: regulované SNARE a multifunkční regulátory SNARE". Trendy v biochemických vědách. 29 (12): 682–8. doi:10.1016 / j.tibs.2004.10.002. PMID 15544955.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: YKT6 YKT6 v-SNARE homolog (S. cerevisiae)“.

[pmid11927603-8] Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (duben 2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". The Journal of Cell Biology. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.

[pmid12388752-9] Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (říjen 2002). „GS15 tvoří komplex SNARE se syntaxinem 5, GS28 a Ykt6 a je zapojen do provozu v raných cisternach Golgiho aparátu“ (PDF). Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3493–507. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]