XAF1 - XAF1

XAF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LXW
Identifikátory
Aliasy	XAF1, BIRC4BP, HSXIAPAF1, XIAPAF1, XIAP asociovaný faktor 1
Externí ID	OMIM: 606717 MGI: 3772572 HomoloGene: 49488 Genové karty: XAF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	6,775,647 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	72,313,733 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • vazba iontů zinku;
Buněčná složka	• cytosol; • cytoplazma; • buněčné jádro; • mitochondrie;
Biologický proces	• apoptotický proces; • interferonová signální dráha typu I; • reakce na interferon-beta;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54739
	327959
	ENSG00000132530
	ENSMUSG00000040483
	Q6GPH4
	Q5NBU8
NM_017523; NM_199139; NM_001353134; NM_001353135; NM_001353136;
	NM_001353137; NM_001353138; NM_001353139; NM_001353140
	NM_001037713; NM_001291153
NP_059993; NP_954590; NP_001340063; NP_001340064; NP_001340065;
	NP_001340066; NP_001340067; NP_001340068; NP_001340069
	NP_001032802; NP_001278082
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor související s XIAP 1 je protein že u lidí je kódován XAF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

X-vázaný inhibitor apoptózy (XIAP; MIM 300079) je silným členem rodiny IAP. Všichni členové této rodiny mají bakulovirové IAP (BIR) repetice, domény bohaté na cystein přibližně 80 aminokyselin, které váží a inhibují kaspázy (např. CASP3; MIM 600636). XIAP má 3 BIR domény a C-koncový RING zinkový prst, který má aktivitu E3 ubikvitin ligázy (viz MIM 601623). XAF1 antagonizuje antikaspázovou aktivitu XIAP a může být důležitá při zprostředkování rezistence na apoptózu v rakovinných buňkách (Liston et al., 2001). [Dodáno OMIM]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že XAF1 komunikovat s XIAP.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132530 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040483 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Leaman DW, Chawla-Sarkar M, Vyas K, Reheman M, Tamai K, Toji S, Borden EC (srpen 2002). „Identifikace X-vázaného inhibitoru faktoru 1 spojeného s apoptózou jako genu stimulovaného interferonem, který zvyšuje apoptózu indukovanou TRAIL Apo2L“. J. Biol. Chem. 277 (32): 28504–11. doi:10,1074 / jbc.M204851200. PMID 12029096.
^ ^A ^b Liston P, Fong WG, Kelly NL, Toji S, Miyazaki T, Conte D, Tamai K, Craig CG, McBurney MW, Korneluk RG (únor 2001). "Identifikace XAF1 jako antagonisty anti-kaspázové aktivity XIAP". Nat. Cell Biol. 3 (2): 128–33. doi:10.1038/35055027. PMID 11175744. S2CID 19731886.
^ ^A ^b „Entrez Gene: XAF1 XIAP associated factor-1“.

Další čtení

Fong WG, Liston P, Rajcan-Separovic E, St Jean M, Craig C, Korneluk RG (2000). "Exprese a genetická analýza faktoru 1 (XAF1) spojeného s XIAP v rakovinných buněčných liniích". Genomika. 70 (1): 113–22. doi:10,1006 / geno.2000.6364. PMID 11087668.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Ray S, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). „Vyjádřená analýza sekvenční značky lidské sítnice pro projekt NEIBank: retbindin, hojná nová retinální cDNA a alternativní sestřih dalších transkriptů genů preferovaných pro sítnici“. Mol. Vis. 8: 196–204. PMID 12107411.
Byun DS, Cho K, Ryu BK, Lee MG, Kang MJ, Kim HR, Chi SG (2003). „Hypermethylace faktoru 1 asociovaného s XIAP, domnělého genu potlačujícího nádor z lokusu 17p13.2, v lidských adenokarcinomech žaludku“. Cancer Res. 63 (21): 7068–75. PMID 14612497.
Ng KC, Campos EI, Martinka M, Li G (2004). „Exprese XAF1 je významně snížena u lidského melanomu“. J. Invest. Dermatol. 123 (6): 1127–34. doi:10.1111 / j.0022-202X.2004.23467.x. PMID 15610524.
Wang J, He H, Yu L, Xia HH, Lin MC, Gu Q, Li M, Zou B, An X, Jiang B, Kung HF, Wong BC (2006). „HSF1 down-reguluje XAF1 prostřednictvím transkripční regulace“. J. Biol. Chem. 281 (5): 2451–9. doi:10,1074 / jbc.M505890200. PMID 16303760.
Yin W, Cheepala S, Clifford JL (2006). "Identifikace nové sestřihové varianty X-vázaného inhibitoru faktoru 1 spojeného s apoptózou". Biochem. Biophys. Res. Commun. 339 (4): 1148–54. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.11.128. PMID 16343440.
Fang X, Liu Z, Fan Y, Zheng C, Nilson S, Egevad L, Ekman P, Xu D (2006). "Přepnout na plnou délku exprese XAF1 mRNA v buňkách rakoviny prostaty pomocí inhibitoru methylace DNA". Int. J. Cancer. 118 (10): 2485–9. doi:10.1002 / ijc.21636. PMID 16353137. S2CID 43629966.
Gilli F, Marnetto F, Caldano M, Sala A, Malucchi S, Capobianco M, Bertolotto A (2006). „Biologické markery léčby interferonem-beta: srovnání mezi interferonem stimulovanými geny MxA, TRAIL a XAF-1“. Mult. Scler. 12 (1): 47–57. doi:10.1191 / 135248506ms1245oa. PMID 16459719. S2CID 34530563.
Reu FJ, Bae SI, Cherkassky L, Leaman DW, Lindner D, Beaulieu N, MacLeod AR, Borden EC (2006). "Překonání rezistence na interferonem indukovanou apoptózu renálního karcinomu a melanomových buněk demetylací DNA". J. Clin. Oncol. 24 (23): 3771–9. CiteSeerX 10.1.1.1025.9291. doi:10.1200 / JCO.2005.03.4074. PMID 16801630.
Lee MG, Huh JS, Chung SK, Lee JH, Byun DS, Ryu BK, Kang MJ, Chae KS, Lee SJ, Lee CH, Kim JI, Chang SG, Chi SG (2006). „Hypermethylace promotoru CpG a downregulace exprese XAF1 u lidských urogenitálních malignit: důsledky pro oslabenou reakci p53 na apoptotické stresy“. Onkogen. 25 (42): 5807–22. doi:10.1038 / sj.onc.1209867. PMID 16909101.
Zou B, Chim CS, Zeng H, Leung SY, Yang Y, Tu SP, Lin MC, Wang J, He H, Jiang SH, Sun YW, Yu LF, Yuen ST, Kung HF, Wong BC (2006). „Korelace mezi metylací CpG na jednom místě a umlčením exprese genu XAF1 u lidských rakovin žaludku a tlustého střeva“. Gastroenterologie. 131 (6): 1835–43. doi:10.1053 / j.gastro.2006.09.050. PMID 17087954.
Micali OC, Cheung HH, Plenchette S, Hurley SL, Liston P, LaCasse EC, Korneluk RG (2007). „Umlčení genu XAF1 hypermethylací promotoru v rakovinných buňkách a reaktivací na TRAIL-senzibilizaci pomocí IFN-beta“. Rakovina BMC. 7: 52. doi:10.1186/1471-2407-7-52. PMC 1845166. PMID 17376236.
Kempkensteffen C, Hinz S, Schrader M, Christoph F, Magheli A, Krause H, Schostak M, Miller K, Weikert S (2007). „Genová exprese a methylace promotoru faktoru 1 asociovaného s XIAP v karcinomech ledvinových buněk: korelace s patologií a výsledkem“. Cancer Lett. 254 (2): 227–35. doi:10.1016 / j.canlet.2007.03.006. PMID 17449173.
Shibata T, Mahotka C, Wethkamp N, Heikaus S, Gabbert HE, Ramp U (2007). "Narušená exprese regulátorů apoptózy XIAP, XAF1 a Smac / DIABLO v adenokarcinomech žaludku". Diagn. Mol. Pathol. 16 (1): 1–8. doi:10.1097 / 01.pdm.0000213471.92925.51. PMID 17471152. S2CID 43822747.
Chung SK, Lee MG, Ryu BK, Lee JH, Han J, Byun DS, Chae KS, Lee KY, Jang JY, Kim HJ, Chi SG (2007). „Častá změna XAF1 u lidských kolorektálních rakovin: důsledky pro rezistenci nádorových buněk vůči apoptotickým stresům“. Gastroenterologie. 132 (7): 2459–77. doi:10.1053 / j.gastro.2007.04.024. PMID 17570219.
Arora V, Cheung HH, Plenchette S, Micali OC, Liston P, Korneluk RG (2007). „Degradace survivinu komplexem X-vázaného inhibitoru apoptózy (XIAP) -XAF1“. J. Biol. Chem. 282 (36): 26202–9. doi:10,1074 / jbc.M700776200. PMID 17613533.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132530 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040483 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12029096-5] Leaman DW, Chawla-Sarkar M, Vyas K, Reheman M, Tamai K, Toji S, Borden EC (srpen 2002). „Identifikace X-vázaného inhibitoru faktoru 1 spojeného s apoptózou jako genu stimulovaného interferonem, který zvyšuje apoptózu indukovanou TRAIL Apo2L“. J. Biol. Chem. 277 (32): 28504–11. doi:10,1074 / jbc.M204851200. PMID 12029096.

[pmid11175744-6] A ^b Liston P, Fong WG, Kelly NL, Toji S, Miyazaki T, Conte D, Tamai K, Craig CG, McBurney MW, Korneluk RG (únor 2001). "Identifikace XAF1 jako antagonisty anti-kaspázové aktivity XIAP". Nat. Cell Biol. 3 (2): 128–33. doi:10.1038/35055027. PMID 11175744. S2CID 19731886.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: XAF1 XIAP associated factor-1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]