Motiv Whalefall-1 RNA - Whalefall-1 RNA motif

Motiv Whalefall-1 RNA
	Konsenzuální sekundární struktura Whalefall-1 RNA
Identifikátory
Symbol	wf-1
Rfam	RF01762
Další údaje
RNA typ	sRNA
Domény	Metagenom pádu velryb
PDB struktur	PDBe

The Motiv Whalefall-1 RNA (také zvaný wf-1) odkazuje na konzervovaný RNA struktura, která byla objevena pomocí bioinformatika.^[1]^[2] Strukturálně se motiv skládá ze dvou kmenové smyčky (viz obrázek), druhý z nich je často ukončen CUUG tetraloop, což je energeticky výhodná sekvence RNA. RNA Whalefall-1 se nacházejí pouze v DNA extrahováno z nekultivovaných bakterie nalezeno na pád velryb, tj. a velryba mrtvola. Od roku 2010 nebyly RNA Whalefall-1 detekovány u žádných známých kultivovaných druhů bakterií a jsou tedy jedním z několika RNA přítomné ve vzorcích prostředí.

Reference

^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (prosinec 2009). „Výjimečná strukturovaná nekódující RNA odhalená analýzou bakteriálních metagenomů“. Příroda. 462 (7273): 656–9. doi:10.1038 / nature08586. PMC 4140389. PMID 19956260.

externí odkazy

Stránka pro Whalefall-1 RNA na Rfam

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[Weinberg2010-1] Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.

[Weinberg2009-2] Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (prosinec 2009). „Výjimečná strukturovaná nekódující RNA odhalená analýzou bakteriálních metagenomů“. Příroda. 462 (7273): 656–9. doi:10.1038 / nature08586. PMC 4140389. PMID 19956260.

[1]

[2]