WRNIP1 - WRNIP1

WRNIP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3VHS, 3VHT
Identifikátory
Aliasy	WRNIP1, WHIP, bA420G6.2, Wernerova helikáza interagující protein 1, WRN helikáza interagující protein 1, CFAP93, FAP93
Externí ID	OMIM: 608196 MGI: 1926153 HomoloGene: 10592 Genové karty: WRNIP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	2,786,952 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	32,822,609 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba nukleotidů; • Aktivita ATPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • vazba kovových iontů; • identická vazba na protein; • GO: aktivita aktivátoru enzymu 0010577; • GO: 0043142 aktivita jednořetězcové DNA helikázy;
Buněčná složka	• perinukleární oblast cytoplazmy; • membrána; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • cytoplazma; • replisome;
Biologický proces	• replikace DNA; • Syntéza DNA zapojená do opravy DNA; • regulace iniciace replikace DNA závislé na DNA; • Oprava DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • Renaturace řetězce DNA; • proces imunitního systému; • Replikace DNA závislá na DNA; • regulace opravy DNA; • DNA rekombinace; • Replikace DNA, zpracování fragmentu Okazaki; • GO: 0048554 pozitivní regulace katalytické aktivity; • vrozený imunitní systém;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56897
	78903
	ENSG00000124535
	ENSMUSG00000021400
	Q96S55
	Q91XU0
	NM_020135; NM_130395
	NM_030215
	NP_064520; NP_569079
	NP_084491
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

ATPase WRNIP1 je enzym že u lidí je kódován WRNIP1 gen.^[5]^[6]

Wernerův syndrom je vzácná autozomálně recesivní porucha charakterizovaná předčasným stárnutím. Protein kódovaný tímto genem interaguje s N-koncovou částí Wernerova proteinu obsahujícího exonukleázovou doménu. Tento protein vykazuje homologii s proteiny rodiny replikačních faktorů C a je konzervován z E. coli na člověka. Studie kvasinek naznačují, že tento gen může ovlivnit proces stárnutí. Pro tento gen byly izolovány dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

WRNIP1 bylo prokázáno komunikovat s Wernerův syndrom ATP-dependentní helikáza.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124535 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021400 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Kawabe Yi, Branzei D, Hayashi T, Suzuki H, Masuko T, Onoda F, Heo SJ, Ikeda H, Shimamoto A, Furuichi Y, Seki M, Enomoto T (červen 2001). „Nový protein interaguje s genovým produktem Wernerova syndromu fyzicky i funkčně“. J Biol Chem. 276 (23): 20364–9. doi:10.1074 / jbc.C100035200. PMID 11301316.
^ ^A ^b „Entrez Gene: WRNIP1 Wernerova helikáza interagující protein 1“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Tsurimoto T, Shinozaki A, Yano M a kol. (2005). „Protein interakce lidské Wernerovy helikázy 1 (WRNIP1) funguje jako nový modulátor pro deltu DNA polymerázy.“ Geny buňky. 10 (1): 13–22. doi:10.1111 / j.1365-2443.2004.00812.x. PMID 15670210. S2CID 24977510.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Bish RA, Myers MP (2007). „Wernerův protein interagující s helikázou váže polyubikvitin prostřednictvím své domény se zinkovým prstem“. J. Biol. Chem. 282 (32): 23184–93. doi:10,1074 / jbc.M701042200. PMID 17550899.

externí odkazy

FactorBook BIČ

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124535 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021400 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11301316-5] A ^b Kawabe Yi, Branzei D, Hayashi T, Suzuki H, Masuko T, Onoda F, Heo SJ, Ikeda H, Shimamoto A, Furuichi Y, Seki M, Enomoto T (červen 2001). „Nový protein interaguje s genovým produktem Wernerova syndromu fyzicky i funkčně“. J Biol Chem. 276 (23): 20364–9. doi:10.1074 / jbc.C100035200. PMID 11301316.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: WRNIP1 Wernerova helikáza interagující protein 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]