WIF1 - WIF1

WIF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D3J, 2YGN, 2YGO, 2YGP, 2YGQ
Identifikátory
Aliasy	WIF1, WIF-1, WNT inhibiční faktor 1
Externí ID	OMIM: 605186 MGI: 1344332 HomoloGene: 31430 Genové karty: WIF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	65,121,305 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	121,100,650 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na Wnt-protein; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na receptory;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • povrch buňky;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • negativní regulace signální dráhy Wnt; • Wnt signální cesta; • signální transdukce; • pozitivní regulace diferenciace tukových buněk; • vývoj anatomické struktury;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11197
	24117
	ENSG00000156076
	ENSMUSG00000020218
	Q9Y5W5
	Q9WUA1
	NM_007191
	NM_011915
	NP_009122
	NP_036045
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Wnt inhibiční faktor 1 je protein že u lidí je kódován WIF1 gen.^[5] WIF1 je lipid vázající protein, na který se váže Wnt proteiny a brání jim ve spouštění signalizace.^[6]^[7]^[8]

Funkce

WNT proteiny jsou extracelulární signální molekuly podílející se na kontrole embryonální vývoj. Tento gen kóduje vylučovaný protein, který váže proteiny WNT a inhibuje jejich aktivity. Tento protein obsahuje doménu WNT inhibičního faktoru (WIF) a 5 domén podobných epidermálnímu růstovému faktoru (EGF). Může být zapojen do mezoderm segmentace. Bylo zjištěno, že tento protein je přítomen v rybách, obojživelnících a savcích.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156076 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020218 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: WIF1 WNT inhibitory factor 1“.
^ Malinauskas T, Aricescu AR, Lu W, Siebold C, Jones EY (červenec 2011). "Modulární mechanismus inhibice signalizace Wnt inhibičním faktorem Wnt 1". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 18 (8): 886–893. doi:10.1038 / nsmb.2081. PMC 3430870. PMID 21743455.
^ Malinauskas T (2008). "Dokování mastných kyselin do WIF domény lidského Wnt inhibičního faktoru-1". Lipidy. 43 (3): 227–30. doi:10.1007 / s11745-007-3144-3. PMID 18256869. S2CID 31357937.
^ Hsieh JC, Kodjabachian L, Rebbert ML, Rattner A, Smallwood PM, Samos CH, Nusse R, Dawid IB, Nathans J (duben 1999). "Nový vylučovaný protein, který se váže na proteiny Wnt a inhibuje jejich aktivity". Příroda. 398 (6726): 431–6. doi:10.1038/18899. PMID 10201374. S2CID 4376660.

Další čtení

Shepelev MV, Korobko EV, Korobko IV (2006). "[WIF1: perspektivy aplikace v onkologii]". Mol. Mikrobiol. Virusol. (4): 3–7. PMID 17094650.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Reguart N, He B, Xu Z a kol. (2004). "Klonování a charakterizace promotoru lidského inhibičního faktoru Wnt-1". Biochem. Biophys. Res. Commun. 323 (1): 229–34. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.08.075. PMID 15351726.
Esufali S, Bapat B (2004). „Cross-talk mezi Rac1 GTPázou a dysregulovanou signální cestou Wnt vede k buněčné redistribuci beta-kateninu a transkripční aktivaci zprostředkované TCF / LEF“. Onkogen. 23 (50): 8260–71. doi:10.1038 / sj.onc.1208007. PMID 15377999.
Ohigashi T, Mizuno R, Nakashima J a kol. (2005). „Inhibice Wnt signalizace downregulates Akt aktivitu a indukuje chemosenzitivitu v buňkách rakoviny prostaty s mutací PTEN“. Prostata. 62 (1): 61–8. doi:10.1002 / pros.20117. PMID 15389810. S2CID 1398615.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Simon M, Grandage VL, Linch DC, Khwaja A (2005). „Konstitutivní aktivace signální dráhy Wnt / beta-katenin u akutní myeloidní leukémie“. Onkogen. 24 (14): 2410–20. doi:10.1038 / sj.onc.1208431. PMID 15735743.
Taniguchi H, Yamamoto H, Hirata T a kol. (2005). „Častá epigenetická inaktivace Wnt inhibičního faktoru-1 u lidských gastrointestinálních rakovin“. Onkogen. 24 (53): 7946–52. doi:10.1038 / sj.onc.1208910. PMID 16007117.
Lin YC, You L, Xu Z a kol. (2006). "Aktivace signalizace Wnt a umlčení WIF-1 v buněčných liniích rakoviny nosohltanu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 341 (2): 635–40. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.12.220. PMID 16427602.
Urakami S, Shiina H, Enokida H a kol. (2006). „Epigenetická inaktivace Wnt inhibičního faktoru-1 hraje důležitou roli u rakoviny močového měchýře prostřednictvím aberantní kanonické signální dráhy Wnt / beta-katenin“. Clin. Cancer Res. 12 (2): 383–91. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-1344. PMID 16428476.
Liepinsh E, Bányai L, Patthy L, Otting G (2006). "NMR struktura WIF domény lidského Wnt-inhibičního faktoru-1". J. Mol. Biol. 357 (3): 942–50. doi:10.1016 / j.jmb.2006.01.047. PMID 16476441.
Batra S, Shi Y, Kuchenbecker KM a kol. (2006). „Wnt inhibiční faktor-1, antagonista Wnt, je umlčen hypermethylací promotoru u maligního mezoteliomu pleury“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 342 (4): 1228–32. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.02.084. PMID 16516163.
Chim CS, Chan WW, Pang A, Kwong YL (2006). „Preferenční methylace Wnt inhibičního faktoru-1 u akutní promyelocytární leukémie: nezávislý špatný prognostický faktor“. Leukémie. 20 (5): 907–9. doi:10.1038 / sj.leu.2404176. PMID 16525492.
Urakami S, Shiina H, Enokida H a kol. (2006). „Kombinovaná analýza hypermethylovaných genů rodiny Wnt-antagonistů jako nový panel epigenetických biomarkerů pro detekci rakoviny močového měchýře“. Clin. Cancer Res. 12 (7 Pt 1): 2109–16. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2468. PMID 16609023.
Milutinovic S, D'Alessio AC, Detich N, Szyf M (2007). „Valproát indukuje rozsáhlé epigenetické přeprogramování, které zahrnuje demetylaci specifických genů“. Karcinogeneze. 28 (3): 560–71. doi:10.1093 / carcin / bgl167. PMID 17012225.
Queimado L, Lopes CS, Reis AM (2007). „WIF1, inhibitor dráhy Wnt, je přeuspořádán v nádorech slinných žláz“. Geny Chromozomy Rakovina. 46 (3): 215–25. doi:10,1002 / gcc.20402. PMID 17171686. S2CID 34184943.
Chan SL, Cui Y, van Hasselt A a kol. (2007). „Inhibiční faktor 1 potlačující tumor Wnt je často methylován v karcinomech nosohltanu a jícnu“. Laboratoř. Investovat. 87 (7): 644–50. doi:10.1038 / labinvest.3700547. PMID 17384664.
Veeck J, Wild PJ, Fuchs T a kol. (2009). „Prognostický význam methylace promotoru Wnt-inhibičního faktoru 1 (WIF1) a Dickkopf-3 (DKK3) u lidské rakoviny prsu“. Rakovina BMC. 9: 1–13. doi:10.1186/1471-2407-9-217. PMC 2717119. PMID 19570204.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156076 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020218 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: WIF1 WNT inhibitory factor 1“.

[pmid21743455-6] Malinauskas T, Aricescu AR, Lu W, Siebold C, Jones EY (červenec 2011). "Modulární mechanismus inhibice signalizace Wnt inhibičním faktorem Wnt 1". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 18 (8): 886–893. doi:10.1038 / nsmb.2081. PMC 3430870. PMID 21743455.

[pmid=18256869-7] Malinauskas T (2008). "Dokování mastných kyselin do WIF domény lidského Wnt inhibičního faktoru-1". Lipidy. 43 (3): 227–30. doi:10.1007 / s11745-007-3144-3. PMID 18256869. S2CID 31357937.

[pmid10201374-8] Hsieh JC, Kodjabachian L, Rebbert ML, Rattner A, Smallwood PM, Samos CH, Nusse R, Dawid IB, Nathans J (duben 1999). "Nový vylučovaný protein, který se váže na proteiny Wnt a inhibuje jejich aktivity". Příroda. 398 (6726): 431–6. doi:10.1038/18899. PMID 10201374. S2CID 4376660.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]