WDR1 - WDR1

WDR1
Identifikátory
Aliasy	WDR1, AIP1, HEL-S-52, NORI-1, WD opakovaná doména 1
Externí ID	OMIM: 604734 MGI: 1337100 HomoloGene: 6628 Genové karty: WDR1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	10,116,949 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	38,563,221 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktinová vazba; • vazba aktinového vlákna;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • myelin; • podosomy; • buněčné spojení; • buněčná projekce; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • aktinové vlákno; • mezibuněčné spojení; • cytoplazma; • cytosol; • kortikální aktinový cytoskelet; • buněčná membrána;
Biologický proces	• degranulace krevních destiček; • smyslové vnímání zvuku; • organizace aktinového cytoskeletu; • regulace repolarizace komorové srdeční svalové buněčné membrány; • regulace diferenciace oligodendrocytů; • udržování apikální / bazální polarity epiteliálních buněk; • sestava apikálního spojení; • regulace depolymerace aktinových vláken; • imunita zprostředkovaná neutrofily; • regulace tvaru buňky; • fragmentace aktinových vláken; • tvorba krevních destiček; • pozitivní regulace depolymerace aktinových vláken; • kortikální organizace cytoskeletu; • pohyb; • stanovení rovinné polarity folikulárního epitelu; • organizace sarkomér; • migrace neutrofilů; • depolymerace aktinových vláken;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9948
	22388
	ENSG00000071127
	ENSMUSG00000005103
	O75083
	O88342
	NM_005112; NM_017491
	NM_011715
	NP_005103; NP_059830
	NP_035845
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny obsahující repetice WD je protein že u lidí je kódován WDR1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje protein obsahující 9 opakování WD. Opakování WD jsou přibližně 30-40aminokyselina domény obsahující několik konzervovaných zbytků, většinou zahrnujících trp-asp na C-terminál konec. Domény WD se účastní interakcí protein-protein. Kódovaný protein může pomoci vyvolat demontáž aktin vlákna. Dvě varianty přepisu kódující různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000071127 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005103 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Adler HJ, Winnicki RS, Gong TW, Lomax MI (květen 1999). „Gen upregulovaný v akusticky poškozené kuřecí bazilární papile kóduje nový opakující se protein WD40“. Genomika. 56 (1): 59–69. doi:10.1006 / geno.1998.5672. PMID 10036186.
^ ^A ^b „Entrez Gene: WDR1 WD repeat domain 1“.

Další čtení

Dawson SJ, White LA (1992). „Léčba endokarditidy Haemophilus aphrophilus ciprofloxacinem“. J. Infect. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Rodal AA, Tetreault JW, Lappalainen P, et al. (1999). „Aip1p interaguje s cofilinem a rozkládá aktinová vlákna“. J. Cell Biol. 145 (6): 1251–64. doi:10.1083 / jcb.145.6.1251. PMC 2133144. PMID 10366597.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). "Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů". Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Fujibuchi T, Abe Y, Takeuchi T a kol. (2005). Msgstr "AIP1 / WDR1 podporuje zaokrouhlování mitotických buněk". Biochem. Biophys. Res. Commun. 327 (1): 268–75. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.11.156. PMID 15629458.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000071127 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005103 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10036186-5] Adler HJ, Winnicki RS, Gong TW, Lomax MI (květen 1999). „Gen upregulovaný v akusticky poškozené kuřecí bazilární papile kóduje nový opakující se protein WD40“. Genomika. 56 (1): 59–69. doi:10.1006 / geno.1998.5672. PMID 10036186.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: WDR1 WD repeat domain 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]