Volatilome - Volatilome

The volatilome (někdy nazývané nestálý[1][2][3]) obsahuje všechny nestálý metabolity stejně jako další těkavé organické a anorganické sloučeniny, které pocházejí z organismus,[4][5][6] superorganismus nebo ekosystém. Atmosféru živé planety lze považovat za její volatilome. Zatímco všechny těkavé metabolity v těkavém těle lze považovat za podskupinu metabolome, těkavý destilát také obsahuje exogenně odvozené sloučeniny, které nejsou odvozeny z metabolických procesů (např. kontaminanty v životním prostředí), proto lze volatilome považovat za odlišnou entitu od metabolomu. Volatilome je složkou „aury“ molekul a mikrobů („mikrobiální oblak“[7]), který obklopuje všechny organismy.

Zápachový profil

Všechny těkavé metabolity detekovatelné lidským nosem se nazývajízápach profil'. Souvislost změněných pachových profilů s chorobnými stavy je již dlouho dokumentována ve východní i západní medicíně a nedávný pokrok v zavádění robotických vzorků zvýšil zájem o volatilome jako zdroj biomarkerů, které lze použít pro neinvazivní screening na onemocnění. Těkavé profily lze sbírat pomocí aktivního nebo pasivního vzorkování a analýza se provádí převážně pomocí plynová chromatografie – hmotnostní spektrometrie s řadou přímých nebo nepřímých technik zavádění vzorků.

Viz také

Reference

  1. ^ Phillips, Michael; Cataneo, Renee N .; Chaturvedi, Anirudh; Kaplan, Peter D .; Libardoni, Mark; Mundada, Mayur; Patel, Urvish; Zhang, Xiang (2013-09-25). „Detekce rozšířeného lidského volatomu pomocí komplexní dvourozměrné plynové chromatografie s časovou masovou spektrometrií“. PLOS ONE. 8 (9): e75274. doi:10.1371 / journal.pone.0075274. ISSN  1932-6203. PMC  3783494. PMID  24086492.
  2. ^ Das, Mrinal Kumar; Bishwal, Subasa Chandra; Das, Aleena; Dabral, Deepti; Varshney, Ankur; Badireddy, Vinod Kumar; Nanda, Ranjan (2014-01-21). „Vyšetřování genderově specifického volatomu vydechovaného dechu u lidí metodou GCxGC-TOF-MS“. Analytická chemie. 86 (2): 1229–1237. doi:10.1021 / ac403541a. ISSN  0003-2700. PMID  24350824.
  3. ^ Heddergott, C .; Calvo, A. M .; Latgé, J. P. (02.02.2017). "Volatome z Aspergillus fumigatus". Eukaryotická buňka. 13 (8): 1014–1025. doi:10.1128 / EC.00074-14. ISSN  1535-9778. PMC  4135790. PMID  24906414.
  4. ^ Amann, Anton; Costello, Ben de Lacy; Miekisch, Wolfram; Schubert, Jochen; Buszewski, Bogusław; Pleil, Joachim; Ratcliffe, Norman; Risby, Terence (01.09.2014). „Lidský těkavý organismus: těkavé organické sloučeniny (VOC) ve vydechovaném dechu, kožní emanace, moč, výkaly a sliny“. Journal of Breath Research. 8 (3): 034001. doi:10.1088/1752-7155/8/3/034001. ISSN  1752-7163. PMID  24946087.
  5. ^ Birgitta, E. Ebert. „Průzkum a využití kvasinkového volatilomu“. Současná metabolomika. 4.
  6. ^ Freihorst, Daniela; Brunsch, Melanie; Wirth, Sophia; Krause, Katrin; Kniemeyer, Olaf; Linde, Jörg; Kunert, Maritta; Boland, Wilhelm; Kothe, Erika (březen 2018). "Cítit rozdíl: transkriptom, proteom a těkavé změny po páření". Plísňová genetika a biologie. 112: 2–11. doi:10.1016 / j.fgb.2016.08.007. PMID  27593501.
  7. ^ Meadow, James F .; Altrichter, Adam E .; Bateman, Ashley C .; Stenson, Jason; Brown, GZ; Green, Jessica L .; Bohannan, Brendan J.M. (2015-09-22). „Lidé se liší svým osobním mikrobiálním mrakem“. PeerJ. 3: e1258. doi:10,7717 / peerj.1258. ISSN  2167-8359. PMC  4582947. PMID  26417541.