Vibrio regulační RNA OmpA - Vibrio regulatory RNA of OmpA

Vibrio regulační RNA OmpA
VrrA sekundární struktura.jpg
Reprezentace VrrA sekundární struktura včetně barevného schématu, které označuje stupeň zachování sekvence.
Identifikátory
SymbolVrrA
RfamRF00024
Další údaje
RNA typGen Antisense RNA
DoményBakterie
PDB strukturPDBe

VrrA (Vibrio regulační RNA OmpA) je nekódující RNA to je zachováno napříč všemi Vibrio druhy bakterie a působí jako represor pro syntézu proteinu vnější membrány OmpA. Tato nekódující RNA byla původně identifikována z Tn5 transposon mutantní knihovny Vibrio cholerae a jeho umístění v bakterii genom byl namapován na intergenní oblast mezi geny VC1741 a VC1743 podle ZÁVOD analýza.[1]

Vezikuly vnější membrány jsou vylučovány z povrchu gramnegativní bakterie, kde se předpokládá, že pomáhají virulence. O tom, jak tyto vezikuly podporují virulenci, je známo jen málo, ale spekulovalo se, že mohou přispívat vylučováním toxinů a pomáhat při úniku imunitní systém.[2][3][4]

Nedávné studie ukázaly, že exprese VrrA je aktivována alternativním stresem faktor sigma, sigma E; na rozdíl od jiných kmenů bakterií, jako je E-coli a Salmonella, nevyžaduje Hfq protein k regulaci faktoru sigma. Bylo také prokázáno, že VrrA transkripce zvyšuje expozici vůči UV světlo a že nadměrná exprese VrrA vedla ke zvýšení vylučovaných vezikul vnější membrány. Z těchto studií bylo navrženo, že VrrA působí na zmírnění stresu vnější membrány omezením syntézy proteinu OmpA a že vezikuly vnější membrány poskytují bakteriím fyzickou ochranu před UV zářením.[1]

Reference

  1. ^ A b Song T, Wai SN (červenec 2009). „Nová sRNA, která moduluje virulenci a environmentální zdatnost Vibrio cholerae“. RNA Biol. 6 (3): 254–258. doi:10,4161 / rna.6.3.8371. PMID  19411843.
  2. ^ Kolling GL, Matthews KR (květen 1999). „Export genů virulence a Shiga toxinu membránovými váčky Escherichia coli O157: H7“. Appl. Environ. Microbiol. 65 (5): 1843–1848. PMC  91264. PMID  10223967.
  3. ^ Saunders NB, Shoemaker DR, Brandt BL, Moran EE, Larsen T, Zollinger WD (leden 1999). „Imunogenicita intranazálně podávaných meningokokových nativních vezikul vnější membrány u myší“. Infikovat. Immun. 67 (1): 113–119. PMC  96285. PMID  9864204.
  4. ^ Kouokam JC, Wai SN, Fällman M, Dobrindt U, Hacker J, Uhlin BE (duben 2006). "Aktivní cytotoxický nekrotizující faktor 1 spojený s vezikuly vnější membrány z uropatogenní Escherichia coli". Infikovat. Immun. 74 (4): 2022–2030. doi:10.1128 / IAI.74.4.2022-2030.2006. PMC  1418910. PMID  16552031.

externí odkazy