Membránový protein spojený s vezikuly 8 - Vesicle-associated membrane protein 8

VAMP8
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4TY4
Identifikátory
Aliasy	VAMP8, EDB, VAMP-8, membránový protein spojený s vezikuly 8
Externí ID	OMIM: 603177 MGI: 1336882 HomoloGene: 37846 Genové karty: VAMP8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	85,582,031 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita SNAP receptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita inhibitoru chloridového kanálu; • Vazba SNARE;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • recyklace endosomu; • váček; • cytosol; • endozom; • časná endosomová membrána; • membrána; • sekreční granulovaná membrána; • membrána pozdního endozomu; • buněčná membrána; • mucinová granule; • lysozomální membrána; • Komplex SNARE; • časný endosom; • perinukleární oblast cytoplazmy; • lysozom; • extracelulární exosom; • klatrinem potažená membrána vezikul; • membrána fagocytických vezikul; • azurofilní granulovaná membrána; • specifická granulovaná membrána; • recyklace endosomové membrány; • membrána terciární granule; • synaptický váček;
Biologický proces	• transport zprostředkovaný vezikulemi po Golgi; • autofagie; • GO: 0000046 zrání autofagosomu; • negativní regulace sekrece buňkou; • transport bílkovin; • virový vstup; • fúze vezikul; • eosinofilní degranulace; • transport zprostředkovaný vezikuly; • sekrece hlenu; • regulace lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • pozitivní regulace sekrece histaminu žírnými buňkami; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I, TAP-dependentní; • dokování membrány autofagosomu; • degranulace neutrofilů; • membránová organizace; • regulace molekulární funkce; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8673
	22320
	ENSG00000118640
	ENSMUSG00000050732
	Q9BV40
	O70404
	NM_003761
	NM_016794
	NP_003752
	NP_058074
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Membránový protein spojený s vezikuly 8 je protein že u lidí je kódován VAMP8 gen.^[4]^[5]^[6]

Synaptobreviny / VAMP, syntaxiny a 25-kD synaptosomální asociovaný protein SNAP25 jsou hlavními složkami proteinového komplexu zapojeného do dokování a / nebo fúze synaptických vezikul s presynaptickou membránou. Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny membránových proteinů spojených s vezikuly (VAMP) / synaptobrevin. Je spojena s perinukleárními vezikulárními strukturami časného endocytického kompartmentu. Bylo zjištěno, že VAMP8 interaguje specificky s rozpustným proteinem vázajícím NSF (alfa-SNAP), nejpravděpodobněji prostřednictvím komplexu SNARE obsahujícího VAMP8.^[6] Fosforylace VAMP8 uvnitř konzervované domény SNARE může potlačit fúzi vezikul.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že membránový protein 8 spojený s vezikuly komunikovat s STX4,^[8]^[9] SNAP23,^[8]^[10] STX1A,^[11] STX8^[12] a STX7.^[12]^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000118640 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bui TD, Wong SH, Lu L, Hong W (únor 1999). "Endobrevin se mapuje na chromozom 2 u člověka a chromozom 6 u myši". Genomika. 54 (3): 579–80. doi:10.1006 / geno.1998.5596. PMID 9878266.
^ Wong SH, Zhang T, Xu Y, Subramaniam VN, Griffiths G, Hong W (červenec 1998). „Endobrevin, nový synaptobrevin / protein podobný VAMP přednostně asociovaný s časným endosomem“. Mol Biol Cell. 9 (6): 1549–63. doi:10,1091 / mbc.9.6.1549. PMC 25382. PMID 9614193.
^ ^A ^b "Entrez Gene: VAMP8 vezikulární asociovaný membránový protein 8 (endobrevin)".
^ Malmersjö S, Di Palma S, Diao J, Lai Y, Pfuetzner RA, Wang AL, McMahon MA, Hayer A, Porteus M, Bodenmiller B, Brunger AT, Meyer T (červenec 2016). „Fosforylace zbytků uvnitř komplexu SNARE potlačuje fúzi sekrečních vezikul“. EMBO Journal. 35 (16): 1721–1843. doi:10.15252 / embj.201694071. PMC 5010044. PMID 27402227.
^ ^A ^b Paumet, F; Le Mao J; Martin S; Galli T; David B; Prázdné U; Roa M (červen 2000). "Rozpustné receptory NSF pro připojení proteinu (SNARE) v žírných buňkách RBL-2H3: funkční role syntaxinu 4 v exocytóze a identifikace sekreční kompartmentu obsahujícího membránový protein 8 spojeného s vezikulem" ". J. Immunol. 164 (11): 5850–7. doi:10,4049 / jimmunol.164.11.5850. ISSN 0022-1767. PMID 10820264.
^ Polgár, János; Chung Sul-Hee; Reed Guy L (srpen 2002). „Membránový protein asociovaný s vezikuly 3 (VAMP-3) a VAMP-8 jsou přítomny v lidských krevních destičkách a jsou nutné pro sekreci granulí“. Krev. 100 (3): 1081–3. doi:10.1182 / krev. V100.3.1081. ISSN 0006-4971. PMID 12130530.
^ Imai, Akane; Nashida Tomoko; Yoshie Sumio; Shimomura Hiromi (srpen 2003). "Intracelulární lokalizace proteinů SNARE v krysích příušních acinárních buňkách: komplexy SNARE na apikální plazmatické membráně". Oblouk. Oral Biol. 48 (8): 597–604. doi:10.1016 / S0003-9969 (03) 00116-X. ISSN 0003-9969. PMID 12828989.
^ Nagamatsu, S; Nakamichi Y; Watanabe T; Matsushima S; Yamaguchi S; Ni J; Itagaki E; Ishida H (leden 2001). „Lokalizace peptidu souvisejícího s celubrevinem, endobrevin, v časném endosomu v beta buňkách pankreatu a jeho fyziologická funkce v exo-endocytóze sekrečních granulí“. J. Cell Sci. 114 (Pt 1): 219–227. ISSN 0021-9533. PMID 11112705.
^ ^A ^b Antonin, W; Holroyd C; Fasshauer D; Pabst S; Von Mollard G F; Jahn R (prosinec 2000). „Komplex SNARE zprostředkující fúzi pozdních endosomů definuje konzervované vlastnosti struktury a funkce SNARE“. EMBO J.. 19 (23): 6453–64. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6453. ISSN 0261-4189. PMC 305878. PMID 11101518.
^ Wade, N; Bryant NJ; Connolly L M; Simpson R J; Luzio J P; Piper RC; James D E (červen 2001). „Komplexy syntaxinu 7 s myší Vps10p ocasní interaktor lb, syntaxin 6, membránový protein asociovaný s vezikulemi (VAMP) 8 a VAMP7 v buňkách melanomu b16“. J. Biol. Chem. 276 (23): 19820–7. doi:10,1074 / jbc.M010838200. ISSN 0021-9258. PMID 11278762.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Fasshauer D, Antonin W, Margittai M a kol. (1999). „Smíšené a neznámé komplexy SNARE. Charakterizace složení a biofyzikální vlastnosti“. J. Biol. Chem. 274 (22): 15440–6. doi:10.1074 / jbc.274.22.15440. PMID 10336434.
Kim PK, Hollerbach C, Trimble WS, et al. (2000). "Identifikace signálu zaměřeného na endoplazmatické retikulum v membránových proteinech asociovaných s vezikuly". J. Biol. Chem. 274 (52): 36876–82. doi:10.1074 / jbc.274.52.36876. PMID 10601239.
Paumet F, Le Mao J, Martin S a kol. (2000). "Rozpustné receptory NSF pro připojení proteinu (SNARE) v žírných buňkách RBL-2H3: funkční role syntaxinu 4 v exocytóze a identifikace sekreční kompartmentu obsahujícího membránový protein 8 spojeného s vezikulem" ". J. Immunol. 164 (11): 5850–7. doi:10,4049 / jimmunol.164.11.5850. PMID 10820264.
Antonin W, Holroyd C, Tikkanen R a kol. (2000). „R-SNARE Endobrevin / VAMP-8 zprostředkovává homotypickou fúzi časných endosomů a pozdních endosomů“. Mol. Biol. Buňka. 11 (10): 3289–98. doi:10,1091 / mbc. 11.10.3289. PMC 14992. PMID 11029036.
Antonin W, Holroyd C, Fasshauer D a kol. (2001). „Komplex SNARE zprostředkující fúzi pozdních endosomů definuje konzervované vlastnosti struktury a funkce SNARE“. EMBO J.. 19 (23): 6453–64. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6453. PMC 305878. PMID 11101518.
Nagamatsu S, Nakamichi Y, Watanabe T a kol. (2001). „Lokalizace peptidu souvisejícího s celubrevinem, endobrevin, v časném endosomu v beta buňkách pankreatu a jeho fyziologická funkce v exo-endocytóze sekrečních granulí“. J. Cell Sci. 114 (Pt 1): 219–227. PMID 11112705.
Wade N, Bryant NJ, Connolly LM a kol. (2001). „Komplexy syntaxinu 7 s myší Vps10p ocasní interaktor lb, syntaxin 6, membránový protein asociovaný s vezikulemi (VAMP) 8 a VAMP7 v buňkách melanomu b16“. J. Biol. Chem. 276 (23): 19820–7. doi:10,1074 / jbc.M010838200. PMID 11278762.
Antonin W, Fasshauer D, Becker S a kol. (2002). „Krystalová struktura endosomálního komplexu SNARE odhaluje společné strukturní principy všech SNARE“. Nat. Struct. Biol. 9 (2): 107–11. doi:10.1038 / nsb746. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-F459-F. PMID 11786915. S2CID 17724790.
Polgár J, Chung SH, Reed GL (2002). „Membránový protein asociovaný s vezikuly 3 (VAMP-3) a VAMP-8 jsou přítomny v lidských krevních destičkách a jsou nutné pro sekreci granulí“. Krev. 100 (3): 1081–3. doi:10.1182 / krev. V100.3.1081. PMID 12130530.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Imai A, Nashida T, Yoshie S, Shimomura H (2003). "Intracelulární lokalizace proteinů SNARE v krysích příušních acinárních buňkách: komplexy SNARE na apikální plazmatické membráně". Oblouk. Oral Biol. 48 (8): 597–604. doi:10.1016 / S0003-9969 (03) 00116-X. PMID 12828989.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005 Natur.434..724H. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Brinkman JF, Ottenheim CP, de Jong LA a kol. (2006). „VAMP5 a VAMP8 se s největší pravděpodobností nepodílejí na primárním glaukomu s otevřeným úhlem“. Mol. Vis. 11: 582–6. PMID 16110299.
Oishi Y, Arakawa T, Tanimura A a kol. (2007). „Role VAMP-2, VAMP-7 a VAMP-8 v konstitutivní exocytóze z HSY buněk“. Histochem. Cell Biol. 125 (3): 273–81. doi:10.1007 / s00418-005-0068-r. PMID 16195891. S2CID 10541252.
Shiffman D, Rowland CM, Louie JZ a kol. (2006). „Genové varianty VAMP8 a HNRPUL1 jsou spojeny s časným nástupem infarktu myokardu“. Arterioskler. Tromb. Vasc. Biol. 26 (7): 1613–8. doi:10.1161 / 01.ATV.0000226543.77214.e4. PMID 16690874.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000118640 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9878266-4] Bui TD, Wong SH, Lu L, Hong W (únor 1999). "Endobrevin se mapuje na chromozom 2 u člověka a chromozom 6 u myši". Genomika. 54 (3): 579–80. doi:10.1006 / geno.1998.5596. PMID 9878266.

[pmid9614193-5] Wong SH, Zhang T, Xu Y, Subramaniam VN, Griffiths G, Hong W (červenec 1998). „Endobrevin, nový synaptobrevin / protein podobný VAMP přednostně asociovaný s časným endosomem“. Mol Biol Cell. 9 (6): 1549–63. doi:10,1091 / mbc.9.6.1549. PMC 25382. PMID 9614193.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: VAMP8 vezikulární asociovaný membránový protein 8 (endobrevin)".

[pmid27402227-7] Malmersjö S, Di Palma S, Diao J, Lai Y, Pfuetzner RA, Wang AL, McMahon MA, Hayer A, Porteus M, Bodenmiller B, Brunger AT, Meyer T (červenec 2016). „Fosforylace zbytků uvnitř komplexu SNARE potlačuje fúzi sekrečních vezikul“. EMBO Journal. 35 (16): 1721–1843. doi:10.15252 / embj.201694071. PMC 5010044. PMID 27402227.

[pmid10820264-8] A ^b Paumet, F; Le Mao J; Martin S; Galli T; David B; Prázdné U; Roa M (červen 2000). "Rozpustné receptory NSF pro připojení proteinu (SNARE) v žírných buňkách RBL-2H3: funkční role syntaxinu 4 v exocytóze a identifikace sekreční kompartmentu obsahujícího membránový protein 8 spojeného s vezikulem" ". J. Immunol. 164 (11): 5850–7. doi:10,4049 / jimmunol.164.11.5850. ISSN 0022-1767. PMID 10820264.

[pmid12130530-9] Polgár, János; Chung Sul-Hee; Reed Guy L (srpen 2002). „Membránový protein asociovaný s vezikuly 3 (VAMP-3) a VAMP-8 jsou přítomny v lidských krevních destičkách a jsou nutné pro sekreci granulí“. Krev. 100 (3): 1081–3. doi:10.1182 / krev. V100.3.1081. ISSN 0006-4971. PMID 12130530.

[pmid12828989-10] Imai, Akane; Nashida Tomoko; Yoshie Sumio; Shimomura Hiromi (srpen 2003). "Intracelulární lokalizace proteinů SNARE v krysích příušních acinárních buňkách: komplexy SNARE na apikální plazmatické membráně". Oblouk. Oral Biol. 48 (8): 597–604. doi:10.1016 / S0003-9969 (03) 00116-X. ISSN 0003-9969. PMID 12828989.

[pmid11112705-11] Nagamatsu, S; Nakamichi Y; Watanabe T; Matsushima S; Yamaguchi S; Ni J; Itagaki E; Ishida H (leden 2001). „Lokalizace peptidu souvisejícího s celubrevinem, endobrevin, v časném endosomu v beta buňkách pankreatu a jeho fyziologická funkce v exo-endocytóze sekrečních granulí“. J. Cell Sci. 114 (Pt 1): 219–227. ISSN 0021-9533. PMID 11112705.

[pmid11101518-12] A ^b Antonin, W; Holroyd C; Fasshauer D; Pabst S; Von Mollard G F; Jahn R (prosinec 2000). „Komplex SNARE zprostředkující fúzi pozdních endosomů definuje konzervované vlastnosti struktury a funkce SNARE“. EMBO J.. 19 (23): 6453–64. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6453. ISSN 0261-4189. PMC 305878. PMID 11101518.

[pmid11278762-13] Wade, N; Bryant NJ; Connolly L M; Simpson R J; Luzio J P; Piper RC; James D E (červen 2001). „Komplexy syntaxinu 7 s myší Vps10p ocasní interaktor lb, syntaxin 6, membránový protein asociovaný s vezikulemi (VAMP) 8 a VAMP7 v buňkách melanomu b16“. J. Biol. Chem. 276 (23): 19820–7. doi:10,1074 / jbc.M010838200. ISSN 0021-9258. PMID 11278762.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]