VTA1 - VTA1

VTA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LXL, 2LXM, 4TXP, 4TXQ, 4TXR, 4U7E
Identifikátory
Aliasy	VTA1, C6orf55, DRG-1, DRG1, LIP5, My012, SBP1, HSPC228, obchodování s vezikuly 1
Externí ID	OMIM: 610902 MGI: 1913451 HomoloGene: 6473 Genové karty: VTA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	142,224,685 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	14,705,560 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • endozom; • endosomová membrána; • extracelulární exosom; • membrána; • nukleoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• transport bílkovin; • endozomální transport; • multivesikulární sestava těla; • GO: 0019067 virový životní cyklus; • multivesikulární dráha třídění těla; • Složitá demontáž ESCRT III; • makroautofagie; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51534
	66201
	ENSG00000009844
	ENSMUSG00000019868
	Q9NP79
	Q9CR26
	NM_016485; NM_001286371; NM_001286372
	NM_025418
	NP_001273300; NP_001273301; NP_057569
	NP_079694
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homolog VTA1 s proteinem spojeným s tříděním vakua je protein že u lidí je kódován VTA1 gen.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000009844 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019868 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shi J, Cai W, Chen X, Ying K, Zhang K, Xie Y (srpen 2001). "Identifikace mRNA reagujících na dopamin v gliových buňkách potlačením subtraktivní hybridizace". Brain Res. 910 (1–2): 29–37. doi:10.1016 / S0006-8993 (01) 02393-9. PMID 11489251. S2CID 43814085.
^ „Entrez Gene: C6orf55 chromozom 6 otevřený čtecí rámec 55“.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Tchernev VT, Mansfield TA, Giot L a kol. (2002). „Protein Chediak-Higashi interaguje s komplexem SNARE a proteiny signální transdukce“. Mol. Med. 8 (1): 56–64. doi:10.1007 / bf03402003. PMC 2039936. PMID 11984006.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Fujita H, Umezuki Y, Imamura K a kol. (2005). „Proteiny Vps třídy E savců, SBP1 a mVps2 / CHMP2A, interagují s a regulují funkci AAA-ATPázy SKD1 / Vps4B“. J. Cell Sci. 117 (Pt 14): 2997–3009. doi:10.1242 / jcs.01170. PMID 15173323.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000009844 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019868 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11489251-5] Shi J, Cai W, Chen X, Ying K, Zhang K, Xie Y (srpen 2001). "Identifikace mRNA reagujících na dopamin v gliových buňkách potlačením subtraktivní hybridizace". Brain Res. 910 (1–2): 29–37. doi:10.1016 / S0006-8993 (01) 02393-9. PMID 11489251. S2CID 43814085.

[entrez-6] „Entrez Gene: C6orf55 chromozom 6 otevřený čtecí rámec 55“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]