VPS4A - VPS4A
Protein 4A spojený s vakuovým tříděním proteinů je protein že u lidí je kódován VPS4A gen.[5][6][7]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinů AAA (ATPázy spojené s různými buněčnými aktivitami) a je homologem kvasinkového proteinu Vps4. U lidí byly identifikovány dva paralogy kvasinkového proteinu. První sdílejí vysoký stupeň aa sekvenční podobnosti mezi sebou navzájem a také s kvasinkovými proteiny Vps4 a myšími proteiny Skd1. Ukázalo se, že myší Skd1 (supresor transportního defektu K + 1) je skutečně kvasinkový Vps4 ortholog. Funkční studie naznačují, že oba lidské paralogy se sdružují s endozomálními kompartmenty a podílejí se na intracelulárním transportu proteinů, podobně jako protein Vps4 v kvasinkách. Gen kódující tento paralog byl mapován na chromozom 16; gen pro druhý se nachází na chromozomu 18.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že VPS4A komunikovat s CHMP1A.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132612 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031913 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Bishop N, Woodman P (duben 2000). „Savčí VPS4 s defektem ATPázy se lokalizuje na aberantní endosomy a zhoršuje obchodování s cholesterolem“. Mol Biol Cell. 11 (1): 227–39. doi:10,1091 / mbc.11.1.227. PMC 14770. PMID 10637304.
- ^ Scheuring S, Röhricht RA, Schöning-Burkhardt B, Beyer A, Müller S, Abts HF, Köhrer K (září 2001). „Savčí buňky exprimují dva proteiny VPS4, které se podílejí na intracelulárním transportu proteinů“. J Mol Biol. 312 (3): 469–80. doi:10.1006 / jmbi.2001.4917. PMID 11563910.
- ^ A b "Entrez Gene: VPS4A vakuolární protein třídění 4 homolog A (S. cerevisiae)".
- ^ Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (červenec 2001). "CHMP1 funguje jako člen nově definované rodiny proteinů přenášejících vezikuly". J. Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID 11559748.
Další čtení
- Scheuring S, Bodor O, Röhricht RA, Müller S, Beyer A, Köhrer K (1999). „Klonování, charakterizace a funkční exprese genu Mus musculus SKD1 v kvasinkách ukazuje, že myší geny SKD1 a kvasinky VPS4 jsou ortology a podílejí se na intracelulárním transportu proteinů.“ Gen. 234 (1): 149–59. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00163-8. PMID 10393249.
- Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (17): 9543–8. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
- Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (2002). "CHMP1 funguje jako člen nově definované rodiny proteinů přenášejících vezikuly". J. Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID 11559748.
- Tanaka H, Fujita H, Katoh H, Mori K, Negishi M (2002). „Vps4-A (vakuolární třídění proteinů 4-A) je vazebným partnerem pro novou GTPázu rodiny Rho, Rnd2“. Biochem. J. 365 (Pt 2): 349–53. doi:10.1042 / BJ20020062. PMC 1222680. PMID 11931639.
- Nara A, Mizushima N, Yamamoto A, Kabeya Y, Ohsumi Y, Yoshimori T (2002). „SKD1 AAA ATPázově závislý endosomální transport se podílí na tvorbě autolysozomů“. Struktura buněk. Funct. 27 (1): 29–37. doi:10.1247 / csf.27.29. PMID 11937716.
- Chagnon P, Michaud J, Mitchell G, Mercier J, Marion JF, Drouin E, Rasquin-Weber A, Hudson TJ, Richter A (2003). „Missense Mutation (R565W) in Cirhin (FLJ14728) in North American Indian Childhood Cirhhosis“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 71 (6): 1443–9. doi:10.1086/344580. PMC 378590. PMID 12417987.
- Beyer A, Scheuring S, Müller S, Mincheva A, Lichter P, Köhrer K (2003). "Srovnávací sekvenční a expresní analýzy čtyř savčích genů VPS4". Gen. 305 (1): 47–59. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 01205-2. PMID 12594041.
- Katoh K, Shibata H, Suzuki H, Nara A, Ishidoh K, Kominami E, Yoshimori T, Maki M (2003). „ALG-2 interagující protein Alix se asociuje s CHMP4b, lidským homologem kvasinek Snf7, který se podílí na multivesikulárním třídění těla“. J. Biol. Chem. 278 (40): 39104–13. doi:10,1074 / jbc.M301604200. PMID 12860994.
- Strack B, Calistri A, Craig S, Popova E, Göttlinger HG (2003). „AIP1 / ALIX je vazebným partnerem pro HIV-1 p6 a EIAV p9 fungující při nadějném viru“. Buňka. 114 (6): 689–99. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID 14505569. S2CID 10733770.
- von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B, Ward DM, Chung HY, Morita E, Wang HE, Davis T, He GP, Cimbora DM, Scott A, Kräusslich HG, Kaplan J, Morham SG, Sundquist WI (2003). "Proteinová síť HIV nadějná". Buňka. 114 (6): 701–13. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID 14505570. S2CID 16894972.
- Sachse M, Strous GJ, Klumperman J (2004). „ATV-deficientní hVPS4 zhoršuje tvorbu vnitřních endosomálních váčků a stabilizuje dvouvrstvé klatrinové pláště na endosomálních vakuolách“. J. Cell Sci. 117 (Pt 9): 1699–708. doi:10,1242 / jcs.00998. PMID 15075231.
- Lin Y, Kimpler LA, Naismith TV, Lauer JM, Hanson PI (2005). „Interakce savčího endozomálního třídícího komplexu požadovaného pro transport (ESCRT) III proteinu hSnf7-1 se sebou samými, membránami a AAA + ATPázou SKD1“. J. Biol. Chem. 280 (13): 12799–809. doi:10,1074 / jbc.M413968200. PMID 15632132.
- Scott A, Gaspar J, Stuchell-Brereton MD, Alam SL, Skalicky JJ, Sundquist WI (2005). "Struktura a ESCRT-III proteinové interakce MIT domény lidského VPS4A". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (39): 13813–8. doi:10.1073 / pnas.0502165102. PMC 1236530. PMID 16174732.
- Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.
- Chen VY, Posada MM, Blazer LL, Zhao T, Rosania GR (2007). „Role dráhy VPS4A-exosomu ve vnitřní výstupní cestě protinádorového léčiva vázajícího DNA“. Pharm. Res. 23 (8): 1687–95. doi:10.1007 / s11095-006-9043-0. PMID 16841193. S2CID 2777033.
- Lambert C, Döring T, Prange R (2007). „Zrání viru hepatitidy B je citlivé na funkční inhibici ESCRT-III, Vps4 a γ2-adapinu“. J. Virol. 81 (17): 9050–60. doi:10.1128 / JVI.00479-07. PMC 1951427. PMID 17553870.
Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |