VPS45 - VPS45

VPS45
Identifikátory
Aliasy	VPS45, H1, H1SCN5, VPS45A, VPS45B, VPS54A, VSP45, VSP45A, vakuolární třídění proteinů 45 homolog
Externí ID	OMIM: 610035 MGI: 891965 HomoloGene: 5250 Genové karty: VPS45
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	150,145,329 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	96,058,466 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • endozom; • Golgiho aparát; • endosomová membrána; • membrána; • Golgiho membrána; • buněčná složka; • synaptický váček;
Biologický proces	• transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • srážení krve; • transport zprostředkovaný vezikuly; • dokování vezikul zapojené do exocytózy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11311
	22365
	ENSG00000136631
	ENSMUSG00000015747
	Q9NRW7
	P97390
	NM_001279353; NM_001279354; NM_001279355; NM_007259
	NM_013841
	NP_001266282; NP_001266283; NP_009190
	NP_038869
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein spojený s vakuovým tříděním proteinů 45 je protein že u lidí je kódován VPS45 gen.^[5]^[6]

Funkce

Váček zprostředkovaný třídění bílkovin hraje důležitou roli při segregaci intracelulárních molekul na odlišné organely. Genetické studie u kvasinek identifikovaly více než 40 vakuolární třídění proteinů (VPS) geny zapojené do transport vezikul do vakuol. Tento gen je členem rodiny domén Sec1 a vykazuje vysoký stupeň sekvenční podobnosti s myší, krysí a kvasinkovou Vps45. Přesná funkce tohoto genu není známa, ale jeho vysoká exprese v mononukleárních buňkách periferní krve naznačuje roli v přenosu proteinů, včetně zánětlivých mediátorů.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136631 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015747 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Pevsner J, Hsu SC, Hyde PS, Scheller RH (únor 1997). "Savčí homology kvasinkových vakuolárních proteinů pro třídění (vps) genů zapojených do obchodování s Golgi-to-lysozomy". Gen. 183 (1–2): 7–14. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00367-8. PMID 8996080.
^ ^A ^b "Entrez Gene: VPS45 vakuolární protein třídění 45 homolog (S. cerevisiae)".

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Tellam JT, James DE, Stevens TH, Piper RC (1997). „Identifikace savčího proteinu podobného Golgi Sec1p, mVps45“. J. Biol. Chem. 272 (10): 6187–93. doi:10.1074 / jbc.272.10.6187. PMID 9045632.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Rajasekariah P, Eyre HJ, Stanley KK a kol. (1999). "Molekulární klonování a charakterizace cDNA kódující třídění vakuolárního proteinu lidského leukocytu (h1Vps45)". Int. J. Biochem. Cell Biol. 31 (6): 683–94. doi:10.1016 / S1357-2725 (99) 00017-5. PMID 10404641.
Nielsen E, Christoforidis S, Uttenweiler-Joseph S a kol. (2000). „Rabenosyn-5, nový efektor Rab5, je komplexován s hVPS45 a získáván do endosomů prostřednictvím domény prstu FYVE“. J. Cell Biol. 151 (3): 601–12. doi:10.1083 / jcb.151.3.601. PMC 2185588. PMID 11062261.
de Renzis S, Sönnichsen B, Zerial M (2002). „Divalentní Rabovy efektory regulují subkompartmentovou organizaci a třídění časných endosomů“. Nat. Cell Biol. 4 (2): 124–33. doi:10.1038 / ncb744. PMID 11788822.
Dulubova I, Yamaguchi T, Gao Y a kol. (2002). "Jak Tlg2p / syntaxin 16 'nastražuje' Vps45". EMBO J.. 21 (14): 3620–31. doi:10.1093 / emboj / cdf381. PMC 126126. PMID 12110575.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kim BY, Ueda M, Kominami E a kol. (2004). "Identifikace myší Vps16 a biochemická charakterizace komplexu Vps savců třídy C". Biochem. Biophys. Res. Commun. 311 (3): 577–82. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.10.030. PMID 14623309.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136631 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015747 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8996080-5] Pevsner J, Hsu SC, Hyde PS, Scheller RH (únor 1997). "Savčí homology kvasinkových vakuolárních proteinů pro třídění (vps) genů zapojených do obchodování s Golgi-to-lysozomy". Gen. 183 (1–2): 7–14. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00367-8. PMID 8996080.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: VPS45 vakuolární protein třídění 45 homolog (S. cerevisiae)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]