VNN2 - VNN2

VNN2
Identifikátory
Aliasy	VNN2, FOAP-4, GPI-80, vanin 2
Externí ID	OMIM: 603571 HomoloGene: 130041 Genové karty: VNN2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	132,763,459 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita hydrolázy, působící na vazby uhlík-dusík (ale ne peptid), v lineárních amidech; • aktivita hydrolázy; • aktivita pantetheine hydrolázy;
Buněčná složka	• ukotvená součást membrány; • membrána; • extracelulární oblast; • buněčná membrána;
Biologický proces	• metabolický proces sloučeniny dusíku; • metabolický proces pantothenátu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8875
	n / a
	ENSG00000112303
	n / a
	O95498
	n / a
	NM_001242350; NM_004665; NM_078488
	n / a
	NP_001229279; NP_004656; NP_511043
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Cévní nezánětlivá molekula 2 je protein že u lidí je kódován VNN2 gen.^[3]^[4]^[5]

Tento genový produkt je členem rodiny proteinů Vanin, které sdílejí rozsáhlou sekvenční podobnost navzájem a také s biotinidáza. Rodina zahrnuje vylučované a s membránou asociované proteiny, z nichž u některých bylo hlášeno, že se jich účastní krvetvorné obchodování s buňkami. U žádného z vaninových proteinů nebyla prokázána žádná biotinidázová aktivita, avšak mají pantetheinázovou aktivitu, která může hrát roli v reakci na oxidační stres.

Kódovaný protein je a Ukotveno GPI molekula povrchu buňky, která hraje roli v transendoteliální migraci neutrofily. Tento gen leží v těsné blízkosti a ve stejné transkripční orientaci jako dva další geny pro vanin na chromozomu 6q23-q24. Dvě varianty přepisu kódující různé izoformy byly pro tento gen popsány.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112303 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Galland F, Malergue F, Bazin H, Mattei MG, Aurrand-Lions M, Theillet C, Naquet P (prosinec 1998). „Dva lidské geny příbuzné myšímu vaninu-1 se nacházejí na dlouhém rameni lidského chromozomu 6“. Genomika. 53 (2): 203–13. doi:10.1006 / geno.1998.5481. PMID 9790769.
^ Martin F, Malergue F, Pitari G, Philippe JM, Philips S, Chabret C, Granjeaud S, Mattei MG, Mungall AJ, Naquet P, Galland F (srpen 2001). „Vaninové geny jsou seskupeny (lidské 6q22-24 a myší 10A2B1) a kódují izoformy ektoenzymů pantetheinázy“. Imunogenetika. 53 (4): 296–306. doi:10.1007 / s002510100327. PMID 11491533. S2CID 10763223.
^ ^A ^b „Entrez Gene: VNN2 vanin 2“.

Další čtení

Suzuki K, Watanabe T, Sakurai S a kol. (1999). „Nový protein ukotvený v glykosylfosfatidyl inositolu na lidských leukocytech: možná role pro regulaci adherence a migrace neutrofilů“. J. Immunol. 162 (7): 4277–84. PMID 10201959.
Dahlgren C, Karlsson A, Sendo F (2001). „Neutrofilní sekreční vezikuly jsou intracelulárním rezervoárem pro GPI-80, protein s potenciálem regulovat adhezi“. J. Leukoc. Biol. 69 (1): 57–62. PMID 11200068.
Watanabe T, Sendo F (2002). „Fyzikální asociace integrinu beta 2 s GPI-80, novým proteinem ukotveným v glykosylfosfatidylinositolu s potenciálem pro regulaci adheze a migrace“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 294 (3): 692–4. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00538-7. PMID 12056825.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Takeda Y, Fu J, Suzuki K a kol. (2003). „Exprese GPI-80, proteinu ukotveného v glykosylfosfatidylinositolu asociovaném s beta2, vyžaduje diferenciaci neutrofilů s dimethylsulfoxidem v buňkách HL-60.“ Exp. Cell Res. 286 (2): 199–208. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00071-5. PMID 12749849.
Sendo D, Takeda Y, Ishikawa H a kol. (2004). „Lokalizace GPI-80, proteinu ukotveného ke glykosylfosfatidyl-inositolu asociovanému s beta2-integrinem, na silně lidských monocytech pozitivních na CD14“. Imunobiologie. 207 (3): 217–21. doi:10.1078/0171-2985-00235. PMID 12777063.
Sasaki H, Ide N, Sendo F a kol. (2004). „Exprese genu glykosylfosfatidyl inositolu (GPI-80) je v korelaci s fází lidského thymomu“. Cancer Sci. 94 (9): 809–13. doi:10.1111 / j.1349-7006.2003.tb01523.x. PMID 12967480. S2CID 20499237.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Yoshitake H, Takeda Y, Nitto T a kol. (2004). „GPI-80, protein ukotvený s glykosylfosfatidylinositolem spojený s beta2 integrinem, se během migrace neutrofilů koncentruje na pseudopodii bez spojení s beta2 integrinem“. Imunobiologie. 208 (4): 391–9. doi:10.1078/0171-2985-00281. PMID 14748512.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Liu T, Qian WJ, Gritsenko MA a kol. (2006). „Analýza lidského plazmatu N-glykoproteomu odečtením imunoafinity, chemií hydrazidů a hmotnostní spektrometrií“. J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. doi:10.1021 / pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952.
Nitto T, Takeda Y, Yoshitake H a kol. (2007). "Strukturální divergence GPI-80 v aktivovaných lidských neutrofilech". Biochem. Biophys. Res. Commun. 359 (2): 227–33. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.05.087. PMID 17543284.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112303 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9790769-3] Galland F, Malergue F, Bazin H, Mattei MG, Aurrand-Lions M, Theillet C, Naquet P (prosinec 1998). „Dva lidské geny příbuzné myšímu vaninu-1 se nacházejí na dlouhém rameni lidského chromozomu 6“. Genomika. 53 (2): 203–13. doi:10.1006 / geno.1998.5481. PMID 9790769.

[pmid11491533-4] Martin F, Malergue F, Pitari G, Philippe JM, Philips S, Chabret C, Granjeaud S, Mattei MG, Mungall AJ, Naquet P, Galland F (srpen 2001). „Vaninové geny jsou seskupeny (lidské 6q22-24 a myší 10A2B1) a kódují izoformy ektoenzymů pantetheinázy“. Imunogenetika. 53 (4): 296–306. doi:10.1007 / s002510100327. PMID 11491533. S2CID 10763223.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: VNN2 vanin 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]