VFDB - VFDB

Databáze faktorů virulence
Obsah
PopisDatabáze, která sleduje faktory bakteriální virulence
Typy dat
zajat		Patogenní bakterie
OrganismyBakterie
Kontakt
Primární citacePMID  15608208
Přístup
webová stránkawww.mgc.ac.cn/ VF/hlavní.htm
Smíšený
Bookmarkable
subjekty		Ano

VFDB také známý jako Databáze faktorů virulence je databáze který poskytuje vědec rychlý přístup k faktory virulence v bakteriální patogeny.[1] Lze jej navigovat a procházet pomocí rod nebo slova. A VÝBUCH nástroj je k dispozici pro vyhledávání proti známým faktory virulence.[2] VFDB obsahuje sbírku 16 důležitých bakteriální patogeny.[1] Skripty Perl byly použity k extrakci pozic a sekvencí VF z GenBank.[3] Clustery ortologních skupin (COG) byly použity k aktualizaci neúplných anotací.[1] Více informací získal NCBI. VFDB byl postaven na Linux operační systémy zapnuty DELL PowerEdge 1600SC servery.

Viz také

Reference

  1. ^ A b C Chen, L. (2004-12-17). „VFDB: referenční databáze faktorů bakteriální virulence“. Výzkum nukleových kyselin. 33 (Problém s databází): D325 – D328. doi:10.1093 / nar / gki008. ISSN  1362-4962. PMC  539962. PMID  15608208.
  2. ^ Altschul, S. (1997-09-01). „Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (17): 3389–3402. doi:10.1093 / nar / 25.17.3389. ISSN  1362-4962. PMC  146917. PMID  9254694.
  3. ^ Benson, D. A .; Karsch-Mizrachi, I .; Lipman, D. J .; Ostell, J .; Sayers, E. W. (01.01.2009). „GenBank“. Výzkum nukleových kyselin. 37 (Databáze): D26 – D31. doi:10.1093 / nar / gkn723. ISSN  0305-1048. PMC  2686462. PMID  18940867.