VA RNA - VA RNA
VA RNA | |
---|---|
![]() Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence VA | |
Identifikátory | |
Symbol | VA |
Rfam | RF00102 |
Další údaje | |
RNA typ | Gen |
Domény | Eukaryota; Viry |
TAK | SO: 0005836 |
PDB struktur | PDBe |
The VA (virová asociovaná) RNA je typ nekódující RNA nalezen v adenovirus.[1][2] Hraje roli při regulaci překlad.[3] Existují dvě kopie této RNA nazývané VAI nebo VA RNAI a VAII nebo VA RNAII. Tyto dva geny VA RNA jsou odlišné geny v genomu adenoviru. VA RNAI je hlavní druh s VA RNAII exprimovanou na nižší úrovni. Ani jeden transkript není polyadenylován a oba jsou transkribovány PolIII.
Funkce
VAI stimuluje translaci časných i pozdních virových genů včetně E3 a hexon.[4] VAII nestimuluje překlad. Testy přechodné transfekce ukázaly, že VAI-RNA zvyšuje stabilitu transkriptů vázaných na ribozomy.[5]
VAI RNA je v buňce zpracována za vzniku RNA o délce 22 nukleotidů, které mohou působit jako siRNA nebo miRNA.[6] VAI RNA funguje jako návnadová RNA pro aktivovanou dvouvláknovou RNA protein kináza R. které by jinak fosforylovaly eukaryotický iniciační faktor 2.
Struktura
VA RNA se skládá ze dvou kmenové smyčky oddělené centrální oblastí nezbytnou pro funkci.[7]
Reference
- ^ Mathews, MB (1995). "Struktura, funkce a vývoj RNA spojených s virem adenoviru". Curr Top Microbiol Immunol. 199: 173–187. PMID 7555067.
- ^ Kidd, AH; Garwicz D; Oberg M (1995). "Lidské a opičí adenoviry: fylogenetické závěry z analýzy genů VA RNA". Virologie. 207: 32–45. doi:10.1006 / viro.1995.1049. PMID 7871747.
- ^ Thimmappaya, B; Weinberger C; Schneider RJ; Shenk T (1982). „Adenovirus VAI RNA je nutný pro efektivní translaci virových mRNA v pozdních dobách po infekci.“ Buňka. 31 (3 Pt 2): 543–551. doi:10.1016/0092-8674(82)90310-5. PMID 6297772.
- ^ Svensson, C; Akusjarvi G (1984). „Adenovirus VA RNAI: pozitivní regulátor translace mRNA“. Mol Cell Biol. 4 (4): 736–742. doi:10,1128 / mcb.4.4.736. PMC 368790. PMID 6201722.
- ^ Strijker, R; Fritz DT; Levinson AD (1989). „Adenovirus VAI-RNA reguluje genovou expresi kontrolou stability RNA vázaných na ribozomy“. EMBO J.. 8 (9): 2669–2675. doi:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08407.x. PMC 401273. PMID 2583126.
- ^ Sano M, Kato Y, Taira K (2006). "Sekvenčně specifická interference malých RNA odvozených z adenovirové VAI RNA". FEBS Lett. 580 (6): 1553–1564. doi:10.1016 / j.febslet.2006.01.085. PMID 16472808.
- ^ Smět; Mathews MB (1996). "Sekundární a terciární struktura v centrální doméně adenoviru typu 2 VA RNA I". RNA. 2 (9): 937–951. PMC 1369428. PMID 8809020.
externí odkazy
![]() | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |