VA RNA - VA RNA

VA RNA
RF00102.jpg
Identifikátory
SymbolVA
RfamRF00102
Další údaje
RNA typGen
DoményEukaryota; Viry
TAKSO: 0005836
PDB strukturPDBe

The VA (virová asociovaná) RNA je typ nekódující RNA nalezen v adenovirus.[1][2] Hraje roli při regulaci překlad.[3] Existují dvě kopie této RNA nazývané VAI nebo VA RNAI a VAII nebo VA RNAII. Tyto dva geny VA RNA jsou odlišné geny v genomu adenoviru. VA RNAI je hlavní druh s VA RNAII exprimovanou na nižší úrovni. Ani jeden transkript není polyadenylován a oba jsou transkribovány PolIII.

Funkce

VAI stimuluje translaci časných i pozdních virových genů včetně E3 a hexon.[4] VAII nestimuluje překlad. Testy přechodné transfekce ukázaly, že VAI-RNA zvyšuje stabilitu transkriptů vázaných na ribozomy.[5]

VAI RNA je v buňce zpracována za vzniku RNA o délce 22 nukleotidů, které mohou působit jako siRNA nebo miRNA.[6] VAI RNA funguje jako návnadová RNA pro aktivovanou dvouvláknovou RNA protein kináza R. které by jinak fosforylovaly eukaryotický iniciační faktor 2.

Struktura

VA RNA se skládá ze dvou kmenové smyčky oddělené centrální oblastí nezbytnou pro funkci.[7]

Reference

  1. ^ Mathews, MB (1995). "Struktura, funkce a vývoj RNA spojených s virem adenoviru". Curr Top Microbiol Immunol. 199: 173–187. PMID  7555067.
  2. ^ Kidd, AH; Garwicz D; Oberg M (1995). "Lidské a opičí adenoviry: fylogenetické závěry z analýzy genů VA RNA". Virologie. 207: 32–45. doi:10.1006 / viro.1995.1049. PMID  7871747.
  3. ^ Thimmappaya, B; Weinberger C; Schneider RJ; Shenk T (1982). „Adenovirus VAI RNA je nutný pro efektivní translaci virových mRNA v pozdních dobách po infekci.“ Buňka. 31 (3 Pt 2): 543–551. doi:10.1016/0092-8674(82)90310-5. PMID  6297772.
  4. ^ Svensson, C; Akusjarvi G (1984). „Adenovirus VA RNAI: pozitivní regulátor translace mRNA“. Mol Cell Biol. 4 (4): 736–742. doi:10,1128 / mcb.4.4.736. PMC  368790. PMID  6201722.
  5. ^ Strijker, R; Fritz DT; Levinson AD (1989). „Adenovirus VAI-RNA reguluje genovou expresi kontrolou stability RNA vázaných na ribozomy“. EMBO J.. 8 (9): 2669–2675. doi:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08407.x. PMC  401273. PMID  2583126.
  6. ^ Sano M, Kato Y, Taira K (2006). "Sekvenčně specifická interference malých RNA odvozených z adenovirové VAI RNA". FEBS Lett. 580 (6): 1553–1564. doi:10.1016 / j.febslet.2006.01.085. PMID  16472808.
  7. ^ Smět; Mathews MB (1996). "Sekundární a terciární struktura v centrální doméně adenoviru typu 2 VA RNA I". RNA. 2 (9): 937–951. PMC  1369428. PMID  8809020.

externí odkazy