Unipept - Unipept

Unipept
Unipept logo.png
Původní autořiGentská univerzita
VývojářiBart Mesuere
První vydání3. února 2011; Před 9 lety (2011-02-03)
Stabilní uvolnění
4.1.1 / 21. ledna 2019; Před 22 měsíci (2019-01-21)[1]
Úložiště Upravte to na Wikidata
NapsánoRubín, JavaScript
TypBioinformatika, Vizualizace dat
LicenceLicence MIT
webová stránkaunipept.ugent.být

Unipept je open source výzkumný nástroj pro biologická rozmanitost analýza metaproteomika Vzorky. Obsahuje také nástroj pro výběr peptidů, které se použijí jako biomarker a nástroj pro porovnání genom organismů na základě jejich obsahu bílkovin.[2][3] Tento software je vyvíjen na Gentská univerzita.

Unipept se skládá z webové aplikace a samostatného nástroje příkazového řádku. Webová aplikace používá interaktivní datové vizualizace k prozkoumání datových sad. Nástroj příkazového řádku obsahuje stejné funkce, ale je navržen pro použití v potrubích automatického zpracování dat.[4]

Reference

  1. ^ „Unipept zprávy“. Citováno 14. dubna 2019.
  2. ^ Mesuere, Bart; Devreese, Bart; Debyser, Griet; Aerts, Maarten; Vandamme, Peter; Dawyndt, Peter (2012). „Unipept: Analýza biodiverzity vzorků metaproteomu založená na tryptickém peptidu“. Journal of Proteome Research. 11 (12): 5773–80. doi:10.1021 / pr300576s. ISSN  1535-3893. PMID  23153116.
  3. ^ Mesuere, Bart; Debyser, Griet; Aerts, Maarten; Devreese, Bart; Vandamme, Peter; Dawyndt, Peter (2015). "Potrubí pro metaproteomickou analýzu Unipept". Proteomika. 15 (8): 1437–1442. doi:10.1002 / pmic.201400361. ISSN  1615-9853. PMID  25477242.
  4. ^ „Unipept CLI documentation“. Citováno 24. srpna 2015.

externí odkazy