Uberon - Uberon

Uberon
Database.png
Obsah
PopisUberon, integrativní vícedruhová ontologie anatomie.
Typy dat
zajat
Anatomické struktury
OrganismyMetazoa
Kontakt
Primární citaceMungall a spol. (2012)[1]
Datum vydání2012
Přístup
Datový formátSOVA a OBO
webová stránkahttp://uberon.org
Stáhnout URLhttp://purl.obolibrary.org/obo/uberon/merged.owl
Sparql koncový bodhttp://sparql.hegroup.org/sparql
Smíšený
Licenceotevřeno

Uberon je srovnávací anatomie ontologie představující řadu struktur nalezených v zvířata, jako plíce, svaly, kosti, peří a ploutve. Tyto struktury jsou propojeny s jinými strukturami prostřednictvím vztahů, jako jsou část a vyvíjí se z.[1] Jedním z použití této ontologie je integrace dat z různých biologické databáze a další druhově specifické ontologie, jako je Foundational Model of Anatomy.[2][3][4]

Reference

  1. ^ A b Mungall, Christopher J; Torniai Carlo; Gkoutos Georgios V; Lewis Suzanna E; Haendel Melissa A (2012). „Uberon, integrativní multidruhová anatomická ontologie“. Genome Biol. Anglie. 13 (1): R5. doi:10.1186 / gb-2012-13-1-r5. PMC  3334586. PMID  22293552.
  2. ^ Washington, N.L .; Haendel, M. A.; Mungall, C. J .; Ashburner, M .; Westerfield, M .; Lewis, S.E. (2009). Buetow, Kenneth H (ed.). „Propojení lidských nemocí se zvířecími modely pomocí anotace fenotypu založené na ontologii“. Biologie PLoS. 7 (11): e1000247. doi:10.1371 / journal.pbio.1000247. PMC  2774506. PMID  19956802.
  3. ^ Hoehndorf, R .; Schofield, P. N .; Gkoutos, G. V. (2011). „PhenomeNET: přístup k objevu genů nemocí v rámci celého fenomu“. Výzkum nukleových kyselin. 39 (18): e119. doi:10.1093 / nar / gkr538. PMC  3185433. PMID  21737429.
  4. ^ Chen, C. K.; Mungall, C. J .; Gkoutos, G. V .; Doelken, S. C .; Köhler, S .; Ruef, B. J .; Smith, C .; Westerfield, M .; Robinson, P. N .; Lewis, S.E .; Schofield, P. N .; Smedley, D. (2012). „MouseFinder: Geny kandidátní choroby z údajů o fenotypu myší“. Lidská mutace. 33 (5): 858–866. doi:10,1002 / humu.22051. PMC  3327758. PMID  22331800.

externí odkazy