USP16 - USP16 - Wikipedia

USP16
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2I50
Identifikátory
Aliasy	USP16UBP-M, UBPM, ubikvitin specifická peptidáza 16
Externí ID	OMIM: 604735 MGI: 1921362 HomoloGene: 38183 Genové karty: USP16
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	29,054,488 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	87,483,517 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy cysteinového typu; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • aktivita peptidázy; • aktivita hydrolázy; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu; • histonová vazba; • ubikvitinová vazba; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • pozitivní regulace translační tažnosti; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • monubiquitinated histon H2A deubiquitination; • transkripce, chráněná DNA; • proteolýza; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • buněčné dělení; • deubikvitinace spojená s histonem H2A K63; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • deubikvitinace bílkovin; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • homotetramerizace bílkovin; • regulace genové exprese; • histonová deubikvitinace; • regulace buněčného cyklu; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • organizace chromatinu; • buněčný cyklus; • mitotické jaderné dělení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10600
	74112
	ENSG00000156256
	ENSMUSG00000025616
	Q9Y5T5
	Q99LG0
	NM_006447; NM_001001992; NM_001032410
	NM_024258
	NP_001001992; NP_001027582; NP_006438
	NP_077220
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin karboxyl-terminální hydroláza 16 je enzym že u lidí je kódován USP16 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje a deubiquitinating enzym, který je fosforylovaný na začátku mitóza a poté defosforylovány na metafáze /anafáze přechod. Může deubikvitinovat H2A, jeden ze dvou hlavních ubikvitinovaných proteinů z chromatin Bylo prokázáno, že in vitro a mutantní forma proteinu blokují buněčné dělení. Střídat transkripční sestřihové varianty, kódující různé izoformy, byly charakterizovány.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156256 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025616 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
^ ^A ^b „Entrez Gene: USP16 ubikvitinová specifická peptidáza 16“.

Další čtení

D'Andrea A, Pellman D (1999). „Deubikvitinační enzymy: nová třída biologických regulátorů“. Krit. Biochem. Mol. Biol. 33 (5): 337–52. doi:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Cai SY, Babbitt RW, Marchesi VT (1999). „Mutantní deubikvitinační enzym (Ubp-M) se asociuje s mitotickými chromozomy a blokuje buněčné dělení.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (6): 2828–33. Bibcode:1999PNAS ... 96.2828C. doi:10.1073 / pnas.96.6.2828. PMC 15854. PMID 10077596.
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD a kol. (2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK a kol. (2002). „Vyjádřená analýza sekvenční značky lidské sítnice pro projekt NEIBank: retbindin, hojná nová retinální cDNA a alternativní sestřih dalších transkriptů genů preferovaných pro sítnici“. Mol. Vis. 8: 196–204. PMID 12107411.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Pai MT, Tzeng SR, Kovacs JJ a kol. (2007). „Struktura řešení domény Ubp-M BUZ, vysoce specifického proteinového modulu, který rozpoznává C-koncový konec volného ubikvitinu“. J. Mol. Biol. 370 (2): 290–302. doi:10.1016 / j.jmb.2007.04.015. PMC 2870993. PMID 17512543.
Joo HY, Zhai L, Yang C a kol. (2007). "Regulace progrese buněčného cyklu a genové exprese deubikvitinací H2A". Příroda. 449 (7165): 1068–72. Bibcode:2007Natur.449.1068J. doi:10.1038 / nature06256. PMID 17914355. S2CID 4417239.

Tento článek o gen na lidský chromozom 21 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156256 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025616 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12838346-5] Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: USP16 ubikvitinová specifická peptidáza 16“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]