USP13 - USP13

USP13
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2L80, 2LBC
Identifikátory
Aliasy	USP13, ISOT3, IsoT-3, ubikvitin specifická peptidáza 13 (isopeptidáza T-3), ubikvitin specifická peptidáza 13
Externí ID	OMIM: 603591 MGI: 1919857 HomoloGene: 68372 Genové karty: USP13
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	179,789,401 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	32,938,071 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy cysteinového typu; • chaperonová vazba; • vazba iontů zinku; • Vazba komplexu BAT3; • vazba kovových iontů; • GO: 1904454, GO: 1904455 aktivita proteázově specifické proteinu podobného ubikvitinu; • vazba proteazomu; • aktivita peptidázy; • ubikvitinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba ubikvitinového proteinu na ligázu; • aktivita hydrolázy; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • pozitivní regulace dráhy ERAD; • proteolýza; • autofagie; • regulace autofagie; • deubikvitinace spojená s proteinem K63; • udržování rozloženého proteinu zapojeného do dráhy ERAD; • buněčná proliferace; • diferenciace melanocytů; • deubikvitinace bílkovin; • deubikvitinace spojená s proteinem K29; • deubikvitinace spojená s proteinem K6; • stabilizace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8975
	72607
	ENSG00000058056
	ENSMUSG00000056900
	Q92995
	Q5BKP2
	NM_003940
	NM_001013024
	NP_003931
	NP_001013042
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin karboxyl-terminální hydroláza 13 je enzym že u lidí je kódován USP13 gen.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000058056 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056900 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
^ "Entrez Gene: USP13 ubikvitinová specifická peptidáza 13 (isopeptidáza T-3)".

Další čtení

D'Andrea A, Pellman D (1999). „Deubikvitinační enzymy: nová třída biologických regulátorů“. Krit. Biochem. Mol. Biol. 33 (5): 337–52. doi:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
Timms KM, Ansari-Lari MA, Morris W a kol. (1998). „Genomická organizace isopeptidázy T-3 (ISOT-3), nového člena rodiny proteáz specifických pro ubikvitin (UBP)“. Gen. 217 (1–2): 101–6. doi:10.1016 / S0378-1119 (98) 00341-2. PMID 9841226.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H a kol. (2002). „Svalově specifický prsten RING-1 interaguje s titinem, aby reguloval sarkomickou M-linii a strukturu tlustého vlákna a může mít jaderné funkce prostřednictvím své interakce s glukokortikoidovým modulačním prvkem vázajícím protein-1“. J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. doi:10.1083 / jcb.20010808989. PMC 2173255. PMID 11927605.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000058056 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056900 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12838346-5] Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.

[entrez-6] "Entrez Gene: USP13 ubikvitinová specifická peptidáza 13 (isopeptidáza T-3)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]