USP1 - USP1

USP1
Identifikátory
Aliasy	USP1UBP, ubikvitin specifická peptidáza 1
Externí ID	OMIM: 603478 MGI: 2385198 HomoloGene: 2528 Genové karty: USP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	62,451,804 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	98,935,543 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy cysteinového typu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu; • aktivita peptidázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• vývoj kosterního systému; • monubiquitinated protein deubiquitination; • reakce na UV; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • proteolýza; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • Reakce poškození DNA, detekce poškození DNA; • deubikvitinace bílkovin; • Oprava DNA; • regulace opravy DNA; • oprava křížového propojení mezi řetězci;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7398
	230484
	ENSG00000162607
	ENSMUSG00000028560
	O94782
	Q8BJQ2
	NM_003368; NM_001017415; NM_001017416
	NM_001301414; NM_146144; NM_001356424
	NP_001017415; NP_001017416; NP_003359
	NP_001288343; NP_666256; NP_001343353
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin karboxyl-terminální hydroláza 1 je enzym že u lidí je kódován USP1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena ubikvitin - rodina proteáz specifického zpracování (UBP), která je a deubikvitinační enzym (DUB) s doménami His a Cys. Tento protein se nachází v cytoplazma a štěpí ubikvitinovou část z prekurzorů fúzovaných na ubikvitin a ubikvitinylovaných proteinů.

Protein specificky deubikvitinuje protein v Fanconiho anémie (FA) opravná cesta DNA. Alternativní transkripce varianty spoje byly charakterizovány.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162607 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028560 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
^ ^A ^b „Entrez Gene: USP1 ubikvitinová specifická peptidáza 1“.

Další čtení

D'Andrea A, Pellman D (1999). „Deubikvitinační enzymy: nová třída biologických regulátorů“. Krit. Biochem. Mol. Biol. 33 (5): 337–52. doi:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Fujiwara T, Saito A, Suzuki M a kol. (1999). „Identifikace a chromozomální přiřazení USP1, nového genu kódujícího proteázu specifickou pro lidský ubikvitin“. Genomika. 54 (1): 155–8. doi:10.1006 / geno.1998.5554. PMID 9806842.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Nijman SM, Huang TT, Dirac AM a kol. (2005). „Deubikvitinační enzym USP1 reguluje cestu Fanconiho anémie“. Mol. Buňka. 17 (3): 331–9. doi:10.1016 / j.molcel.2005.01.008. hdl:1874/17796. PMID 15694335.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162607 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028560 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12838346-5] Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: USP1 ubikvitinová specifická peptidáza 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]