Trojlístek faktor 2 - Trefoil factor 2

TFF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DYZ, 2DZ0, 2DZ1
Identifikátory
Aliasy	TFF2, SML1, SP, trojlístek faktor 2
Externí ID	OMIM: 182590 MGI: 1306805 HomoloGene: 3956 Genové karty: TFF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	42,350,997 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	31,144,282 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na chemokinový receptor CXCR4;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární;
Biologický proces	• hojení ran; • udržování gastrointestinálního epitelu; • negativní regulace sekrece žaludeční kyseliny; • chemokiny zprostředkovaná signální dráha;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7032
	21785
	ENSG00000160181
	ENSMUSG00000024028
	Q03403
	Q03404; Q9QX97
	NM_005423
	NM_009363
	NP_005414
	NP_033389
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Trojlístek faktor 2 je protein že u lidí je kódován TFF2 gen.^[5]^[6]^[7]

Členové rodiny trojlístků se vyznačují tím, že mají alespoň jednu kopii trojlístkového motivu, 40 aminokyselinovou doménu, která obsahuje tři konzervované disulfidy. Jsou stabilní sekreční bílkoviny vyjádřen v gastrointestinální sliznice. Jejich funkce nejsou definovány, ale mohou chránit sliznici před urážkami, stabilizovat vrstvu hlenu a ovlivňovat hojení epitel. Kódovaný protein inhibuje žaludeční kyselina vylučování. Tento gen a dva další příbuzné geny členů rodiny trojlístků se nacházejí v klastru na chromozom 21.^[7]

Glykanová vazba

Všechny lidské trojlístkové faktory jsou lektiny které interagují specificky s disacharidem GlcNAc-α-1,4-Gal.^[8] Tento disacharid je neobvyklý glykotop, o kterém je známo, že existuje pouze na velkých, silně glykosylovaných, muciny ve sliznici. Zesíťováním muciny prostřednictvím bivalentní vazby tohoto glykotopu jsou pak trojlístkové faktory schopny reverzibilně modulovat tloušťku a viskozitu hlenu.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160181 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024028 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tomasetto C, Rockel N, Mattei MG, Fujita R, Rio MC (září 1992). „Gen kódující lidský spasmolytický protein (SML1 / hSP) je v 21q 22.3, fyzicky spojený s homologním genem markeru rakoviny prsu BCEI / pS2.“ Genomika. 13 (4): 1328–30. doi:10.1016/0888-7543(92)90059-2. PMID 1505966.
^ Gott P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (květen 1997). "Lidské trojlístkové peptidy: genomová struktura v 21q22.3 a koordinovaná exprese". Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. doi:10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TFF2 trojlístek faktor 2 (spasmolytický protein 1)“.
^ ^A ^b Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (květen 2020). „Trojlístkové faktory sdílejí aktivitu lektinu, která definuje jejich roli v hlenu“. Příroda komunikace. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. doi:10.1038 / s41467-020-16223-7. PMC 7221086. PMID 32404934.

Další čtení

Advenier C, Lagente V, Boichot E (1997). „Úloha antagonistů tachykininových receptorů v prevenci bronchiální hyperreaktivity, zánětu dýchacích cest a kašle“. Eur. Respir. J. 10 (8): 1892–906. doi:10.1183/09031936.97.10081892. PMID 9272936.
Langer G, Jagla W, Behrens-Baumann W a kol. (2003). "Oční TFF-peptidy: nové sekreční produkty spojené s hlenem spojivkových pohárkových buněk". Adv. Exp. Med. Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 506 (Pt A): 313–6. doi:10.1007/978-1-4615-0717-8_44. ISBN 978-1-4613-5208-2. PMID 12613926.
Tomasetto C, Rio MC, Gautier C a kol. (1990). „hSP, doménou duplikovaný homolog proteinu pS2, je koexprimován s pS2 v žaludku, ale ne v karcinomu prsu“. EMBO J.. 9 (2): 407–14. doi:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08125.x. PMC 551681. PMID 2303034.
Bhogal N, Donnelly D, Findlay JB (1994). "Ligandové vazebné místo receptoru neurokininu 2. Místně zaměřená mutageneze a identifikace vazebných zbytků neurokininu A v lidském receptoru neurokininu 2". J. Biol. Chem. 269 (44): 27269–74. PMID 7961636.
Hanby AM, Poulsom R, Singh S a kol. (1993). „Spasmolytický polypeptid je hlavní antrální peptid: distribuce trojlístkových peptidů, lidský spasmolytický polypeptid a pS2 v žaludku.“ Gastroenterologie. 105 (4): 1110–6. doi:10.1016 / 0016-5085 (93) 90956-d. PMID 8405856.
Itoh H, Tomita M, Uchino H a kol. (1996). "cDNA klonování krysího pS2 peptidu a exprese trojlístkových peptidů v kolitidě vyvolané kyselinou octovou". Biochem. J. 318 (3): 939–44. doi:10.1042 / bj3180939. PMC 1217708. PMID 8836141.
Květen FE, Westley BR (1997). "Úzká fyzická vazba genů kódujících protein pNR-2 / pS2 a lidský spasmolytický protein (hSP)". Hučení. Genet. 99 (3): 303–7. doi:10,1007 / s004390050362. PMID 9050913. S2CID 22603186.
Seib T, Blin N, Hilgert K a kol. (1997). „Tři lidské trojlístkové geny TFF1, TFF2 a TFF3 jsou umístěny v oblasti 55 kb na chromozomu 21q22.3“. Genomika. 40 (1): 200–2. doi:10.1006 / geno.1996.4511. PMID 9070946.
Kayademir T, Silva Edos S, Pusch C a kol. (1998). „Nová tandemová repetice o 25 bp v rámci lidského trojlístkového peptidového genu TFF2 v 21q22.3: polymorfismus a evoluce savců“. Eur. J. Hum. Genet. 6 (2): 121–8. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200166. PMID 9781055.
Brunelleschi S, Bordin G, Colangelo D, Viano I (1999). "Tachykininové receptory na lidských monocytech: jejich účast na revmatoidní artritidě". Neuropeptidy. 32 (3): 215–23. doi:10.1016 / S0143-4179 (98) 90040-3. PMID 10189055. S2CID 40222022.
Květen FE, Semple JI, Newton JL, Westley BR (2000). „Lidský dvoudomý trojlístkový protein, TFF2, je glykosylován in vivo v žaludku“. Střevo. 46 (4): 454–9. doi:10,1136 / gut. 46.4.454. PMC 1727891. PMID 10716671.
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD a kol. (2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
Berry A, Scott HS, Kudoh J a kol. (2001). „Rafinovaná lokalizace autosomálně recesivní nonsyndromické hluchoty lokusu DFNB10 pomocí 34 nových mikrosatelitních markerů, genomové struktury a vyloučení šesti známých genů v regionu“. Genomika. 68 (1): 22–9. doi:10,1006 / geno.2000.6253. PMID 10950923.
Bulitta CJ, Fleming JV, Raychowdhury R a kol. (2002). „Automatická indukce promotoru trojlístku faktoru 2 (TFF2) vyžaduje předřazený cis působící prvek“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (1): 366–74. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00199-7. PMID 12054609.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hu GY, Yu BP, Dong WG a kol. (2003). "Exprese infekce TFF2 a Helicobacter pylori při karcinogenezi žaludeční sliznice". Svět J. Gastroenterol. 9 (5): 910–4. doi:10,3748 / wjg.v9.i5.910. PMC 4611396. PMID 12717829.

Tento článek o gen na lidský chromozom 21 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160181 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024028 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1505966-5] Tomasetto C, Rockel N, Mattei MG, Fujita R, Rio MC (září 1992). „Gen kódující lidský spasmolytický protein (SML1 / hSP) je v 21q 22.3, fyzicky spojený s homologním genem markeru rakoviny prsu BCEI / pS2.“ Genomika. 13 (4): 1328–30. doi:10.1016/0888-7543(92)90059-2. PMID 1505966.

[pmid9043862-6] Gott P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (květen 1997). "Lidské trojlístkové peptidy: genomová struktura v 21q22.3 a koordinovaná exprese". Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. doi:10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TFF2 trojlístek faktor 2 (spasmolytický protein 1)“.

[Järvå_2020-8] A ^b Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (květen 2020). „Trojlístkové faktory sdílejí aktivitu lektinu, která definuje jejich roli v hlenu“. Příroda komunikace. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. doi:10.1038 / s41467-020-16223-7. PMC 7221086. PMID 32404934.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]