Trojlístek faktor 1 - Trefoil factor 1

TFF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1HI7, 1PS2
Identifikátory
Aliasy	TFF1, BCEI, D21S21, HP1.A, HPS2, pNR-2, pS2, trojlístek faktor 1
Externí ID	OMIM: 113710 MGI: 88135 HomoloGene: 2426 Genové karty: TFF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	42,366,535 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	31,165,277 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita růstového faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• extracelulární; • extracelulární oblast;
Biologický proces	• reakce na imobilizační stres; • diferenciace buněk; • reakce na peptidový hormon; • udržování gastrointestinálního epitelu; • negativní regulace buněčné proliferace; • reakce na iont železa; • hojení ran; • metabolický proces sacharidů; • regulace aktivity receptoru; • trávení; • signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7031
	21784
	ENSG00000160182
	ENSMUSG00000024032
	P04155
	Q08423
	NM_003225
	NM_009362
	NP_003216
	NP_033388
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Trojlístek faktor 1 je protein že u lidí je kódován TFF1 gen^[5]^[6] (také zvaný pS2 gen^[7]).

Funkce

Členové rodiny trojlístků se vyznačují tím, že mají alespoň jednu kopii trojlístek motiv, 40-aminokyselinová doména, která obsahuje tři konzervované disulfidy. Jsou to stabilní sekreční proteiny exprimované v gastrointestinální sliznice. Jejich funkce nejsou definovány, ale mohou chránit sliznici před urážkami, stabilizovat vrstvu hlenu a ovlivňovat hojení epitelu. Tento gen, který je exprimován v žaludeční sliznici, byl také studován kvůli jeho expresi v lidských nádorech. Tento gen a dva další příbuzné geny členů rodiny trojlístků se nacházejí v klastru na chromozomu 21.^[6]

Glykanová vazba

Všechny tři lidské trojlístkové faktory jsou lektiny které interagují specificky s disacharidem GlcNAc-α-1,4-Gal.^[8] Tento disacharid je neobvyklý glykotop, o kterém je známo, že existuje pouze na velkých, silně glykosylovaných, muciny ve sliznici. Zesíťováním muciny prostřednictvím bivalentní vazby tohoto glykotopu jsou pak trojlístkové faktory schopny reverzibilně modulovat tloušťku a viskozitu hlenu.^[8]

U karcinomu žaludku

Výraz TFF1 je často ztracen karcinom žaludku, pravděpodobně prostřednictvím mechanismu methylace DNA, a je proto považován za gen potlačující nádor.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160182 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024032 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gött P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (květen 1997). "Lidské trojlístkové peptidy: genomová struktura v 21q22.3 a koordinovaná exprese". Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. doi:10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TFF1 trojlístek faktor 1“.
^ Chatagnon A, Ballestar E, Esteller M, Dante R (2010). "Role pro methyl-CpG vazebný doménový protein 2 v modulaci estrogenové odpovědi genu pS2 / TFF1". PLOS ONE. 5 (3): e9665. Bibcode:2010PLoSO ... 5.9665C. doi:10,1371 / journal.pone.0009665. PMC 2837351. PMID 20300195.
^ ^A ^b Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (květen 2020). „Trojlístkové faktory sdílejí aktivitu lektinu, která definuje jejich roli v hlenu“. Příroda komunikace. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. doi:10.1038 / s41467-020-16223-7. PMC 7221086. PMID 32404934.
^ Feng G, Zhang Y, Yuan H, Bai R, Zheng J, Zhang J, Song M (leden 2014). „Methylace DNA trojlístkového faktoru 1 (TFF1) je spojena s tumorigenezí karcinomu žaludku“. Mol Med Rep. 9 (1): 109–117. doi:10,3892 / mmr.2013.1772. PMID 24190027.

Další čtení

Langer G, Jagla W, Behrens-Baumann W, Walter S, Hoffmann W (2003). "Oční TFF-peptidy: nové sekreční produkty spojené s hlenem spojivkových pohárkových buněk". Adv. Exp. Med. Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 506 (Pt A): 313–6. doi:10.1007/978-1-4615-0717-8_44. ISBN 978-1-4613-5208-2. PMID 12613926.
Piggott NH, Henry JA, květen FE, Westley BR (1991). „Antipeptidové protilátky proti pNR-2 estrogenem regulovaný protein lidských buněk rakoviny prsu a detekce exprese pNR-2 v normálních tkáních pomocí imunohistochemie“. J. Pathol. 163 (2): 95–104. doi:10,1002 / cesta.1711630204. PMID 1707960. S2CID 2120939.
Mori K, Fujii R, Kida N, Takahashi H, Ohkubo S, Fujino M, Ohta M, Hayashi K (1990). "Kompletní primární struktura produktu lidského genu reagujícího na estrogen (pS2)". J. Biochem. 107 (1): 73–6. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a123014. PMID 2185238.
Tomasetto C, Rio MC, Gautier C, Wolf C, Hareuveni M, Chambon P, Lathe R (1990). „hSP, doménou duplikovaný homolog proteinu pS2, je koexprimován s pS2 v žaludku, ale ne v karcinomu prsu“. EMBO J.. 9 (2): 407–14. doi:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08125.x. PMC 551681. PMID 2303034.
Takahashi H, Kida N, Fujii R, Tanaka K, Ohta M, Mori K, Hayashi K (1990). "Exprese genu pS2 v lidských buňkách rakoviny žaludku pocházejících ze špatně diferencovaného adenokarcinomu". FEBS Lett. 261 (2): 283–6. doi:10.1016 / 0014-5793 (90) 80572-Z. PMID 2311759. S2CID 37115994.
Rio MC, Bellocq JP, Daniel JY, Tomasetto C, soustruh R, Chenard MP, Batzenschlager A, Chambon P (1988). „Protein pS2 spojený s rakovinou prsu: syntéza a sekrece normální sliznicí žaludku“. Věda. 241 (4866): 705–8. Bibcode:1988Sci ... 241..705R. doi:10.1126 / science.3041593. PMID 3041593.
Rio MC, Lepage P, Diemunsch P, Roitsch C, Chambon P (1989). "[Primární struktura lidského proteinu pS2]". Comptes Rendus de l'Académie des Sciences, Série III. 307 (19): 825–31. PMID 3146413.
Mori K, Fujii R, Kida N, Ohta M, Hayashi K (1988). „Identifikace polypeptidu vylučovaného lidskými buňkami rakoviny prsu (MCF-7) jako produktu genu reagujícího na lidský estrogen (pS2)“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 155 (1): 366–72. doi:10.1016 / S0006-291X (88) 81094-5. PMID 3261981.
Jeltsch JM, Roberts M, Schatz C, Garnier JM, Brown AM, Chambon P (1987). "Struktura lidského estrogenu reagujícího genu pS2". Nucleic Acids Res. 15 (4): 1401–14. doi:10.1093 / nar / 15.4.1401. PMC 340557. PMID 3822834.
Prud'homme JF, Fridlansky F, Le Cunff M, Atger M, Mercier-Bodart C, Pichon MF, Milgrom E (1985). „Klonování genu exprimovaného v lidské rakovině prsu a regulovaného estrogenem v buňkách MCF-7“. DNA. 4 (1): 11–21. doi:10.1089 / dna.1985.4.11. PMID 3838275.
Jakowlew SB, Breathnach R, Jeltsch JM, Masiakowski P, Chambon P (1984). "Sekvence pS2 mRNA indukovaná estrogenem v buněčné linii MCF-7 u lidské rakoviny prsu". Nucleic Acids Res. 12 (6): 2861–78. doi:10.1093 / nar / 12.6.2861. PMC 318711. PMID 6324130.
Hanby AM, Poulsom R, Singh S, Elia G, Jeffery RE, Wright NA (1993). „Spasmolytický polypeptid je hlavní antrální peptid: distribuce trojlístkových peptidů, lidský spasmolytický polypeptid a pS2 v žaludku.“ Gastroenterologie. 105 (4): 1110–6. doi:10.1016 / 0016-5085 (93) 90956-d. PMID 8405856.
Polshakov VI, Frenkiel TA, Westley B, Chadwick M, květen F, Carr MD, Feeney J (1996). „Strukturální studie založené na NMR peptidu trojlístku pNR-2 / pS2 s jednou doménou. Podobnosti s prasečím spasmolytickým peptidem a důkazy o monomerní struktuře“. Eur. J. Biochem. 233 (3): 847–55. doi:10.1111 / j.1432-1033.1995.847_3.x. PMID 8521850.
Seib T, Blin N, Hilgert K, Seifert M, Theisinger B, Engel M, Dooley S, Zang KD, Welter C (1997). „Tři lidské trojlístkové geny TFF1, TFF2 a TFF3 jsou umístěny v oblasti 55 kb na chromozomu 21q22.3“. Genomika. 40 (1): 200–2. doi:10.1006 / geno.1996.4511. PMID 9070946.
Polshakov VI, Williams MA, Gargaro AR, Frenkiel TA, Westley BR, Chadwick MP, květen FE, Feeney J (1997). "Struktura řešení s vysokým rozlišením lidského pNR-2 / pS2: jediný trojlístkový motivový protein". J. Mol. Biol. 267 (2): 418–32. doi:10.1006 / jmbi.1997.0896. PMID 9096235.
Chadwick MP, Westley BR, květen FE (1997). „Homodimerizace a hetero-oligomerizace jednodoménového trojlístkového proteinu pNR-2 / pS2 prostřednictvím cysteinu 58“. Biochem. J. 327 (1): 117–23. doi:10.1042 / bj3270117. PMC 1218770. PMID 9355742.
Chen H, Lin RJ, Xie W, Wilpitz D, Evans RM (1999). „Regulace hyperacetylace histonů vyvolané hormony a aktivace genů prostřednictvím acetylace acetylázy“. Buňka. 98 (5): 675–86. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80054-9. PMID 10490106. S2CID 14697597.
Newton JL, Allen A, Westley BR, květen FE (2000). „Lidský trojlístkový peptid, TFF1, je přítomen v různých molekulárních formách, které jsou v normálním žaludku úzce spojeny s hlenem“. Střevo. 46 (3): 312–20. doi:10.1136 / střevo.46.3.312. PMC 1727855. PMID 10673290.

Tento článek o gen na lidský chromozom 21 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160182 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024032 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9043862-5] Gött P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (květen 1997). "Lidské trojlístkové peptidy: genomová struktura v 21q22.3 a koordinovaná exprese". Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. doi:10.1159/000472224. PMID 9043862. S2CID 25235589.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TFF1 trojlístek faktor 1“.

[7] Chatagnon A, Ballestar E, Esteller M, Dante R (2010). "Role pro methyl-CpG vazebný doménový protein 2 v modulaci estrogenové odpovědi genu pS2 / TFF1". PLOS ONE. 5 (3): e9665. Bibcode:2010PLoSO ... 5.9665C. doi:10,1371 / journal.pone.0009665. PMC 2837351. PMID 20300195.

[Järvå_2020-8] A ^b Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (květen 2020). „Trojlístkové faktory sdílejí aktivitu lektinu, která definuje jejich roli v hlenu“. Příroda komunikace. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. doi:10.1038 / s41467-020-16223-7. PMC 7221086. PMID 32404934.

[pmid_=_24190027-9] Feng G, Zhang Y, Yuan H, Bai R, Zheng J, Zhang J, Song M (leden 2014). „Methylace DNA trojlístkového faktoru 1 (TFF1) je spojena s tumorigenezí karcinomu žaludku“. Mol Med Rep. 9 (1): 109–117. doi:10,3892 / mmr.2013.1772. PMID 24190027.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]