TRAK1 - TRAK1 - Wikipedia

TRAK1

Identifikátory

TRAK1, MILT1, OIP106, přenášející kinesinový protein 1, EIEE68

Externí ID

OMIM: 608112 MGI: 1914345 HomoloGene: 25103 Genové karty: TRAK1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 3 (lidský)^[1]

Kapela	3p22.1	Start	42,013,802 bp^[1]
Kapela	3p22.1	Konec	42,225,890 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 9 (myš)^[2]

Kapela	9 F4 \| 9 72,41 cM	Start	121,297,502 bp^[2]
Kapela	9 F4 \| 9 72,41 cM	Konec	121,474,918 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • Vazba na receptor GABA • Vazba domény TPR • vazba na receptory • vazba myosinu
Buněčná složka	• cytoplazma • endozom • časný endosom • mitochondrie • buněčné jádro • axonová cytoplazma • dendrit • axonální růstový kužel • perinukleární oblast cytoplazmy • cytoplazmatický váček • dendritová cytoplazma • buněčná kůra • membrána • mitochondriální membrány
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • cílení na bílkoviny • glykosylace vázaná na protein O • transport endosomu k lysozomu • anterográdní axonální transport mitochondrií • axonální transport mitochondrií • dendritická morfogeneze • pozitivní regulace axonogeneze • anterográdní axonální transport • lokalizace bílkovin • neurogeneze • transport vezikul podél mikrotubulů • distribuce mitochondrií
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


22906


67095


ENSG00000182606


ENSMUSG00000032536


Q9UPV9


Q6PD31

RefSeq (mRNA)

NM_001042646 NM_001265608 NM_001265609 NM_001265610 NM_014965
NM_001349245 NM_001349246 NM_001349247 NM_001349248 NM_001349249

NM_175114 NM_001357968 NM_001357969 NM_001357970 NM_001357972
NM_001357973

RefSeq (protein)

NP_001036111 NP_001252537 NP_001252538 NP_001252539 NP_055780
NP_001336174 NP_001336175 NP_001336176 NP_001336177 NP_001336178

NP_780323 NP_001344897 NP_001344898 NP_001344899 NP_001344901
NP_001344902

Místo (UCSC)

Chr 3: 42,01 - 42,23 Mb

Chr 9: 121,3 - 121,47 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Obchodování s proteinem vázajícím kinesin 1 je protein že v lidé je kódován TRAK1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182606 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032536 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (říjen 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (3): 197–205. doi:10.1093 / dnares / 6.3.197. PMID 10470851.
^ Iyer SP, Akimoto Y, Hart GW (únor 2003). „Identifikace a klonování nové rodiny proteinů domény coiled-coil, které interagují s O-GlcNAc transferázou“. J Biol Chem. 278 (7): 5399–409. doi:10,1074 / jbc.M209384200. PMID 12435728.
^ Gilbert SL, Zhang L, Forster ML, Anderson JR, Iwase T, Soliven B, Donahue LR, Sweet HO, Bronson RT, Davisson MT, Wollmann RL, Lahn BT (leden 2006). „Mutace Trak1 narušuje homeostázu receptoru GABA (A) u hypertonických myší“. Nat Genet. 38 (2): 245–50. doi:10.1038 / ng1715. PMID 16380713. S2CID 20231963.
^ „Entrez Gene: TRAK1 trafficking protein, kinesin binding 1“.

Další čtení

Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Iyer SP, Hart GW (2003). „Role tetratrikopeptidové repetiční domény v cílení O-GlcNAc transferázy a specificita proteinového substrátu“. J. Biol. Chem. 278 (27): 24608–16. doi:10,1074 / jbc.M300036200. PMID 12724313.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Brickley K, Smith MJ, Beck M, Stephenson FA (2005). „GRIF-1 a OIP106, členové nové genové rodiny proteinů domény coiled-coil: asociace in vivo a in vitro s kinesinem“. J. Biol. Chem. 280 (15): 14723–32. doi:10,1074 / jbc.M409095200. PMID 15644324.
Ozyildirim AM, Wistow GJ, Gao J a kol. (2005). „Transkriptom slzné žlázy je neobvykle bohatým zdrojem vzácných a špatně charakterizovaných transkriptů genů“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 46 (5): 1572–80. CiteSeerX 10.1.1.123.3574. doi:10.1167 / iovs.04-1380. PMID 15851553.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Fransson S, Ruusala A, Aspenström P (2006). „Atypické Rho GTPasy Miro-1 a Miro-2 mají zásadní roli v mitochondriálním obchodování.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 344 (2): 500–10. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.03.163. PMID 16630562.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.