TRAF3IP2 - TRAF3IP2 - Wikipedia

TRAF3IP2
Identifikátory
Aliasy	TRAF3IP2, ACT1, C6orf2, C6orf4, C6orf5, C6orf6, CANDF8, CIKS, PSORS13, TRAF3 interagující protein 2
Externí ID	OMIM: 607043 MGI: 2143599 HomoloGene: 15885 Genové karty: TRAF3IP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	111,606,906 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	39,655,307 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na receptory; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• intracelulární; • buněčná složka;
Biologický proces	• pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • sekrece imunoglobulinu; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • humorální imunitní odpověď; • Apoptotický proces B buněk; • pozitivní regulace obranné reakce na virus hostitelem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10758
	103213
	ENSG00000056972
	ENSMUSG00000019842
	O43734
	Q8N7N6
	NM_001164281; NM_001164282; NM_001164283; NM_147200; NM_147686
	NM_134000
	NP_001157753; NP_001157755; NP_671733; NP_679211
	NP_598761
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Adaptér protein CIKS je protein že u lidí je kódován TRAF3IP2 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje protein podílející se na regulaci odpovědí na cytokiny členy rodiny transkripčních faktorů Rel / NF-kappaB. Tyto faktory hrají ústřední roli ve vrozené imunitě v reakci na patogeny, zánětlivé signály a stres. Tento genový produkt interaguje s proteiny TRAF (faktory spojené s receptorem faktoru nekrotizující tumor) a buď s I-kappaB kinázou nebo MAP kinázou za účelem aktivace buď NF-kappaB nebo Jun kinázy. Byly identifikovány dva alternativní transkripty kódující různé proteiny. Byl identifikován třetí transkript, který nekóduje protein a je přepisován v opačné orientaci. Bylo prokázáno, že nadměrná exprese tohoto transkriptu snižuje expresi alespoň jednoho z transkriptů kódujících protein, což naznačuje, že má regulační roli v expresi tohoto genu.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že TRAF3IP2 komunikovat s IKBKG.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000056972 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019842 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Leonardi A, Chariot A, Claudio E, Cunningham K, Siebenlist U (říjen 2000). „CIKS, spojení s Ikappa B kinázou a stresem aktivovanou proteinovou kinázou“. Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (19): 10494–9. Bibcode:2000PNAS ... 9710494L. doi:10.1073 / pnas.190245697. PMC 27052. PMID 10962033.
^ ^A ^b Li X, Commane M, Nie H, Hua X, Chatterjee-Kishore M, Wald D, Haag M, Stark GR (říjen 2000). „Act1, NF-kappa B-aktivující protein“. Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (19): 10489–93. Bibcode:2000PNAS ... 9710489L. doi:10.1073 / pnas.160265197. PMC 27051. PMID 10962024.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TRAF3IP2 TRAF3 interagující protein 2“.

Další čtení

Morelli C, Magnanini C, Mungall AJ a kol. (2000). "Klonování a charakterizace dvou překrývajících se genů v podoblasti na 6q21 zapojených do replikativní senescence a schizofrenie". Gen. 252 (1–2): 217–25. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00231-6. PMID 10903453.
Qian Y, Zhao Z, Jiang Z, Li X (2002). "Role NF kappa B aktivátoru Act1 v CD40 zprostředkované signalizaci v epitelových buňkách". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (14): 9386–91. Bibcode:2002PNAS ... 99.9386Q. doi:10.1073 / pnas.142294499. PMC 123150. PMID 12089335.
Chariot A, Leonardi A, Muller J a kol. (2002). „Sdružení adaptéru TANK s regulátorem I kappa B kinázy (IKK) NEMO spojuje komplexy IKK s IKK epsilon a TBK1 kinázami“. J. Biol. Chem. 277 (40): 37029–36. doi:10,1074 / jbc.M205069200. PMID 12133833.
Xia YF, Li YD, Li X, Geng JG (2002). "Identifikace alternativně sestříhaného Act1 a důsledky pro jeho role v onkogenezi". Biochem. Biophys. Res. Commun. 296 (2): 406–12. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00887-2. PMID 12163033.
Kanamori M, Kai C, Hayashizaki Y, Suzuki H (2003). „NF-kappaB aktivátor Act1 se asociuje s IL-1 / Toll cestou adaptéru molekuly TRAF6“. FEBS Lett. 532 (1–2): 241–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03688-8. PMID 12459498. S2CID 83623149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Matsuda A, Suzuki Y, Honda G a kol. (2003). „Rozsáhlá identifikace a charakterizace lidských genů, které aktivují signální dráhy NF-kappaB a MAPK“. Onkogen. 22 (21): 3307–18. doi:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID 12761501.
Mauro C, Vito P, Mellone S a kol. (2003). „Role adaptorového proteinu CIKS při aktivaci komplexu IKK“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309 (1): 84–90. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01532-8. PMID 12943667.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000056972 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019842 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10962033-5] A ^b Leonardi A, Chariot A, Claudio E, Cunningham K, Siebenlist U (říjen 2000). „CIKS, spojení s Ikappa B kinázou a stresem aktivovanou proteinovou kinázou“. Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (19): 10494–9. Bibcode:2000PNAS ... 9710494L. doi:10.1073 / pnas.190245697. PMC 27052. PMID 10962033.

[pmid10962024-6] A ^b Li X, Commane M, Nie H, Hua X, Chatterjee-Kishore M, Wald D, Haag M, Stark GR (říjen 2000). „Act1, NF-kappa B-aktivující protein“. Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (19): 10489–93. Bibcode:2000PNAS ... 9710489L. doi:10.1073 / pnas.160265197. PMC 27051. PMID 10962024.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TRAF3IP2 TRAF3 interagující protein 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]