TOM1 - TOM1 - Wikipedia

TOM1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1ELK, 1WRD, 2N2N
Identifikátory
Aliasy	TOM1cíl proteinu přenášejícího membránu myb1
Externí ID	OMIM: 604700 MGI: 1338026 HomoloGene: 88453 Genové karty: TOM1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	35,347,992 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	75,070,121 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• clathrinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytosol; • endozom; • časný endosom; • extracelulární exosom; • intracelulární; • cytoplazma; • membrána; • buněčná membrána; • azurofilní granulovaná membrána; • specifická granulovaná membrána;
Biologický proces	• transport intracelulárních proteinů; • endocytóza; • endozomální transport; • transport bílkovin; • degranulace neutrofilů; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10043
	21968
	ENSG00000100284
	ENSMUSG00000042870
	O60784
	O88746
	NM_001135729; NM_001135730; NM_001135732; NM_005488
	NM_001136259; NM_011622
	NP_001129201; NP_001129202; NP_001129204; NP_005479
	NP_001129731; NP_035752
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cíl proteinu Myb 1 je protein že u lidí je kódován TOM1 gen.^[5]^[6]^[7]

Specifická funkce tohoto genu dosud nebyla stanovena, přesto může zahrnovat translokaci komplexů receptorů růstového faktoru do lysozomu za účelem degradace. Tento gen je lokalizován na 22q13.1, s HMOX1 a MCM5 distálně a HMG2L1 proximálně umístěnými.^[7]

Interakce

TOM1 bylo prokázáno komunikovat s TOLLIP^[8] a ZFYVE16.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100284 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042870 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Seroussi E, Kedra D, Kost-Alimova M, Sandberg-Nordqvist AC, Fransson I, Jacobs JF, Fu Y, Pan HQ, Roe BA, Imreh S, Dumanski JP (srpen 1999). "TOM1 geny mapují na lidský chromozom 22q13.1 a myší chromozom 8C1 a kódují proteiny podobné endosomálním proteinům HGS a STAM". Genomika. 57 (3): 380–8. doi:10.1006 / geno.1998.5739. PMID 10329004.
^ Katoh Y, Shiba Y, Mitsuhashi H, Yanagida Y, Takatsu H, Nakayama K (květen 2004). „Tollip a Tom1 tvoří komplex a přijímají proteiny konjugované s ubikvitinem na časné endosomy“. J Biol Chem. 279 (23): 24435–43. doi:10,1074 / jbc.M400059200. PMID 15047686.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TOM1 cíl myb1 (kuře)".
^ Yamakami, Megumi; Yoshimori Tamotsu; Yokosawa Hideyoshi (prosinec 2003). „Tom1, protein obsahující doménu VHS, interaguje s tollip, ubikvitinem a klatrinem“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52865–72. doi:10,1074 / jbc.M306740200. ISSN 0021-9258. PMID 14563850.
^ Seet, Li-Fong; Liu Ningsheng; Hanson Brendon J; Hong Wanjin (únor 2004). „Endofin získává TOM1 do endosomů“. J. Biol. Chem. 279 (6): 4670–9. doi:10,1074 / jbc.M311228200. ISSN 0021-9258. PMID 14613930.

Další čtení

Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Misra S, Beach BM, Hurley JH (2000). „Struktura VHS domény lidského Tom1 (cíl myb 1): poznatky o interakcích s proteiny a membránami“. Biochemie. 39 (37): 11282–90. doi:10.1021 / bi0013546. PMID 10985773.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Yamakami M, Yoshimori T, Yokosawa H (2004). „Tom1, protein obsahující doménu VHS, interaguje s tollip, ubikvitinem a klatrinem“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52865–72. doi:10,1074 / jbc.M306740200. PMID 14563850.
Seet LF, Liu N, Hanson BJ, Hong W (2004). „Endofin získává TOM1 do endosomů“. J. Biol. Chem. 279 (6): 4670–9. doi:10,1074 / jbc.M311228200. PMID 14613930.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Seet LF, Hong W (2005). „Endofin získává klatrin do časných endozomů prostřednictvím TOM1“. J. Cell Sci. 118 (Pt 3): 575–87. doi:10.1242 / jcs.01628. PMID 15657082.
Schmid EM, Ford MG, Burtey A a kol. (2007). „Role AP2 beta-appendage hub při náboru partnerů pro sestavu vezikul potaženou klatrinem“. PLoS Biol. 4 (9): e262. doi:10.1371 / journal.pbio.0040262. PMC 1540706. PMID 16903783.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

externí odkazy

TOM1 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
TOM1 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100284 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042870 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10329004-5] Seroussi E, Kedra D, Kost-Alimova M, Sandberg-Nordqvist AC, Fransson I, Jacobs JF, Fu Y, Pan HQ, Roe BA, Imreh S, Dumanski JP (srpen 1999). "TOM1 geny mapují na lidský chromozom 22q13.1 a myší chromozom 8C1 a kódují proteiny podobné endosomálním proteinům HGS a STAM". Genomika. 57 (3): 380–8. doi:10.1006 / geno.1998.5739. PMID 10329004.

[pmid15047686-6] Katoh Y, Shiba Y, Mitsuhashi H, Yanagida Y, Takatsu H, Nakayama K (květen 2004). „Tollip a Tom1 tvoří komplex a přijímají proteiny konjugované s ubikvitinem na časné endosomy“. J Biol Chem. 279 (23): 24435–43. doi:10,1074 / jbc.M400059200. PMID 15047686.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: TOM1 cíl myb1 (kuře)".

[pmid14563850-8] Yamakami, Megumi; Yoshimori Tamotsu; Yokosawa Hideyoshi (prosinec 2003). „Tom1, protein obsahující doménu VHS, interaguje s tollip, ubikvitinem a klatrinem“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52865–72. doi:10,1074 / jbc.M306740200. ISSN 0021-9258. PMID 14563850.

[pmid14613930-9] Seet, Li-Fong; Liu Ningsheng; Hanson Brendon J; Hong Wanjin (únor 2004). „Endofin získává TOM1 do endosomů“. J. Biol. Chem. 279 (6): 4670–9. doi:10,1074 / jbc.M311228200. ISSN 0021-9258. PMID 14613930.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]